| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
CCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGC > NC_002947/1084290‑1084585 | ccGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCC > 3:312278‑M1/1‑149 (MQ=255) ggAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGt > 3:106448/1‑149 (MQ=255) ggAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGt > 7:323238/1‑149 (MQ=255) ggAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCAGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCAGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGccgccga > 5:343366/1‑148 (MQ=255) aaaCTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑Cg < 3:375893/149‑1 (MQ=255) tttGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCa > 4:29479/1‑149 (MQ=255) tttGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCa > 1:225959/1‑149 (MQ=255) ccgccATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATccc < 6:418073/149‑1 (MQ=255) ccgccATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATcc < 3:222224/148‑1 (MQ=255) cgccATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCGAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATccc > 4:300651/1‑148 (MQ=255) gccATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGa < 3:327781/149‑1 (MQ=255) ccATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GTAGGGGCCATCCTGCCGTGGTTGTAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCTCC < 5:394930‑M1/133‑1 (MQ=255) ccATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGAt < 2:436630/149‑1 (MQ=255) 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cccTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACcgc < 7:395530/141‑1 (MQ=255) ccTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatgg < 3:213294‑M2/149‑77 (MQ=255) ccTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaacaacggcatgatgg < 4:255510‑M2/149‑77 (MQ=255) ccTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGAt < 5:210415/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCACATGCCTGCTCCCTGCTCCTCGATGAACACGCCG‑AGGTggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccaaaacttgaggtcgcgggaggtgagtttcaaccacggcaggatgg < 4:42240‑M2/149‑77 (MQ=255) cTTGCCGCCacctcgccgtgttcatcgaccagcagcgagcacgcatgggccttggcatcgggatggccgaacggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatggg > 4:312278‑M1/1‑9 (MQ=255) ttGCCGCCacctcgccgtggtcatcgaccagcagcgagcacgcatgggccttggcatcgggatggccgaacggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatgggc > 1:438032‑M1/1‑8 (MQ=255) ttGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATg > 7:157292/1‑148 (MQ=255) gccgccacctcgccgtgttcatcgaccagcagcgagcacgcatgggccttggcatcgggatggccgaacggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatgggc < 7:14621‑M1/147‑142 (MQ=255) cgccgTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACg > 4:146647/1‑60 (MQ=255) cgccgTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACg < 3:146647/60‑1 (MQ=255) cgccacctcgccgtgttcatcgaccagcagcgagcacgcatgggccttggcatcgggatggccgaacggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatgggccctt > 3:29479‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGa > 8:152562/1‑144 (MQ=255) ccgTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCATGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatgggcccttcc < 1:273206‑M2/149‑85 (MQ=255) ccacctcgccgtgttcatcgaccagcagcgagcacgcatgggccttggcatcgggatggccgaacggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatgggcccttcc < 3:13553‑M1/149‑148 (MQ=255) | CCGGAAAACTTTGCCGCCATGGGGCGCAAGGACGCTGCTGCCATCGGCCGCGCCGAAGCCTTGGGG‑GAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGC > NC_002947/1084290‑1084585 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |