| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCGTGTGTTA > NC_002947/1084353‑1084648 | ggggAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGCTGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGt > 4:173642/1‑149 (MQ=255) ggAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTgg < 3:13553‑M2/149‑3 (MQ=255) aaGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTggcg > 3:29479‑M2/1‑145 (MQ=255) 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cTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGa < 6:8125/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCGCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGa < 5:336481/149‑1 (MQ=255) ccGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGAc < 1:221417/147‑1 (MQ=255) cGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAg < 3:153052/149‑1 (MQ=255) gTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTAATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTg > 7:383976/1‑148 (MQ=255) 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gctgctGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCCGATACGCcggt < 1:124584/147‑1 (MQ=255) ctgGTCGATGAACACGGCG‑AGGTggcggcaagggcaaagtaccggcaacaatccataacttgaggtcgcgggcggtgcgtttcaaccacggcaggatgggcccttcccccaaggcttcggcgcggccgatggcagcagcgtccttgcgc > 2:273206‑M2/1‑23 (MQ=255) ctgGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCggtcggtc < 5:437783/148‑1 (MQ=255) gTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCt > 6:87604/1‑149 (MQ=255) gTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCt > 3:215710/1‑149 (MQ=255) tCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGTCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTg < 3:192537/149‑1 (MQ=255) tCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTg > 7:380477/1‑149 (MQ=255) gATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTggg < 3:173642/149‑1 (MQ=255) aTGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTgggg < 5:166445/149‑1 (MQ=255) acacGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCcggt < 7:145743/132‑1 (MQ=255) acacGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCcggt > 8:145743/1‑132 (MQ=255) cacGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAg < 4:239859/149‑1 (MQ=255) acGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCGGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGc < 1:399128/149‑1 (MQ=255) acGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTTGGTCGGCTGGGGCTGAGc > 2:317328/1‑149 (MQ=255) ggCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCgt < 6:179535/149‑1 (MQ=255) cG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCgtgt < 4:215710/149‑1 (MQ=255) cG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCgtgt > 4:117028/1‑149 (MQ=255) cG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCgtgt < 8:157292/149‑1 (MQ=255) cG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCgtgt < 4:61452/149‑1 (MQ=255) g‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTATGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCgtgtg < 4:376875/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCGTGTGTTa < 4:303421/149‑1 (MQ=255) gTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCGTGTGTTa < 3:72263/149‑1 (MQ=255) | GGGGAAGGGCCCATCCTGCCGTGGTTGAAACGCACCGCCCGCGACCTCAAGTTATGGATTGTTGCCGGTACTTTGCCCTTGCCGCCGTT‑CGGCCATCCCGATGCCAAGGCCCATGCGTGCTCGCTGCTGGTCGATGAACACGGCG‑AGGTGGCGGCAAGGTATGACAAGCTGCACTTGTTTGATGTGGACGTGGCCGACAACCGGGGCCGTTACCGCGAGTCGGATGACTACGCACAGGGTGCTCAGGTGGTGGTGGCTGATACGCCGGTCGGTCGGCTGGGGCTGAGCGTGTGTTA > NC_002947/1084353‑1084648 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |