| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 1265262 = | 85 (1.190) | 4 (0.060) | 4/254 | NT | 5.0% | coding (158/1017 nt) | PP_1106 | hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 1265302 = | 70 (1.030) | coding (118/1017 nt) | PP_1106 | hypothetical protein | |||||
CTCGATACTCCAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGGGGCGGGCGATGA > NC_002947/1265116‑1265409 | gggtaaccccagaaccagtgcccgtgccatggacctcgtcatcgcccgccccgaaggcctgtactgcccgcccggagatttctacatcgacccctggcggcccgtggagcgggctgtcattacccatggccacggcgaccacgcacgca < 2:148711‑M1/3‑1 (MQ=255)cTCGATACTCCAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCa > 4:183804/1‑149 (MQ=255) taaccccagaaccagtgcccgtgccatggacctcgtcatcgcccgccccgaaggcctgtactgcccgcccggagatttctacatcgacccctggcggcccgtggagcgggctgtcattacccatggccacggcgaccacgcacGCACCg > 4:75782‑M1/144‑149 (MQ=255) gATACTCCAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCg > 2:284411/1‑149 (MQ=255) accccagaaccagtgcccgtgccatggacctcgtcatcgcccgccccgaaggcctgtactgcccgcccggagatttctacatcgacccctggcggcccgtggagcgggctgtcattacccatggccacggcgaccacgcacGCACCgg > 4:343135‑M1/142‑148 (MQ=255) cTCCAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGTCGGCACCGGG‑Gc > 6:95103/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCt > 7:409916/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCt > 3:167068/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTg > 8:286913/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTg < 8:356867/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCACCTGTTCCGAACCCATCACGTGCGCGGCCGGGTGGAGGCTCAACGTCACGGCGTGGTTCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTTGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTg < 6:370192/148‑1 (MQ=255) cAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTgg < 1:284411/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTgg > 2:380678/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCACATGTGCCGAACCCAGCACGTGACCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCAAAGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGACGGCACCGGG‑GCTgg > 1:299090/1‑149 (MQ=255) gggCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGc > 6:96595/2‑149 (MQ=255) gcACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGt > 2:114543/1‑148 (MQ=255) cACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCa < 7:286913/149‑1 (MQ=255) cACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCa < 3:326766/149‑1 (MQ=255) 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atcgcccgccccgaaggcctgtactgcccgcccggagatttctacatcgacccctggcggcccgtggagcgggctgtcattacccatggccacggcgaccacgcacGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGgtgcgt < 4:158760‑M1/42‑1 (MQ=255) ccggccggGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGgtgcgtgc > 6:171424/1‑149 (MQ=255) cggccggGTGCAGGGTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGtgcgtgcg > 7:368949/1‑149 (MQ=255) cggccggGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGtgcgtgcg < 4:35972/149‑1 (MQ=255) cggccggGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGtgcgtgcg < 1:427740/149‑1 (MQ=255) gccggGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGcgtgcgtg < 3:265039/149‑1 (MQ=255) cggGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGt > 3:100043/1‑149 (MQ=255) gCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGc < 4:100043/149‑1 (MQ=255) gCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGc > 7:170256/1‑149 (MQ=255) gCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGc > 4:262160/1‑149 (MQ=255) 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gcTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAg < 7:379128/148‑1 (MQ=255) aTTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAAtctc > 5:219134/1‑149 (MQ=255) aTTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAAtctc < 3:175667/149‑1 (MQ=255) gATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCcgg > 8:253370/1‑149 (MQ=255) gATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCcg < 1:362430/148‑1 (MQ=255) tGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCcgggc > 7:239035/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCcgggcgg < 8:170256/149‑1 (MQ=255) tCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCcgggcgg > 2:284610/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCcgggcgg > 8:318566/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCTGGCGGGCAGTa > 1:121110/1‑148 (MQ=255) cAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGgc > 6:355504/1‑109 (MQ=255) cAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGgc < 5:355504/109‑1 (MQ=255) tGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCg > 7:55010/1‑149 (MQ=255) gcAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCgggg > 2:384015/1‑149 (MQ=255) cAGAACGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGgggc > 4:355476/1‑149 (MQ=255) aGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGgggcg < 8:384445/149‑1 (MQ=255) aaTGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCCGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGgggcggg < 8:239035/149‑1 (MQ=255) aaTGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGgggcgg < 2:83372/148‑1 (MQ=255) aTGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACTGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGgggcggg < 8:359742/148‑1 (MQ=255) ccGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGGGGCGGGCGAt < 1:384015/149‑1 (MQ=255) cGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGGGGCGGGCGATg < 1:2591/149‑1 (MQ=255) ggCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATACTGGCCAGTGCCGGTGCGTGCGTGGGCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGGCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGGGGCGGGCGATGa < 7:388605/149‑1 (MQ=255) | CTCGATACTCCAGGCGCACCTGTGCCGAACCCAGCACGTGCCCGGCCGGGTGCAGGCTCAACGTCACGCCGTGGTGCAGCAGGCGCTCACCGTAGGGCAGGGTCTGCAGATTGATGTCCTGGCCCAGGCGGCTGCGCAGAATGCCGGCACCGGG‑GCTGGCGGTCAGATAATGGCCATTGCCGGTGCGTGCGTGGTCGCCGTGGCCATGGGTAATGACAGCCCGCTCCACGGGCCGCCAGGGGTCGATGTAGAAATCTCCGGGCGGGCAGTACAGGCCTTCGGGGCGGGCGATGA > NC_002947/1265116‑1265409 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |