New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2098975 | 59 (0.820) | 7 (0.100) | 7/252 | NT | 11.1% | coding (915/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
? | NC_002947 | = 2099067 | 57 (0.850) | coding (823/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
CAGCACCTTGCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCC > NC_002947/2098828‑2099122 | cAGCACCTTGCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGgcgcgcg > 2:120559/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCCGAGTCATGGGTGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTGGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTgg < 5:444757/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTgg < 6:124659/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTgg < 5:291232/149‑1 (MQ=255) cattGCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTgg < 6:419626/147‑1 (MQ=255) cTTGCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTggg < 5:134517/149‑1 (MQ=255) gCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGc < 8:393700/147‑1 (MQ=255) aGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTc > 2:228833/1‑148 (MQ=255) aTGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAgcg > 2:248899/1‑149 (MQ=255) tGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAgcgc < 1:228833/149‑1 (MQ=255) tGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAgcgc > 1:410035/1‑149 (MQ=255) gCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCg > 2:52478/1‑149 (MQ=255) gCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCg > 8:185240/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGc < 2:94062/148‑1 (MQ=255) aGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGc < 3:128963/149‑1 (MQ=255) gTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcct > 4:150510‑M1/1‑116 (MQ=255) gTTGCTGGCGTTGCGGGCGGGGCAGCGGGTTGGCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCt < 7:378828/149‑1 (MQ=255) cTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTAGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGtt < 1:120559/149‑1 (MQ=255) tGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTc > 3:108250/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTc < 2:107160/147‑1 (MQ=255) cGTTGCTCGCGGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAg < 6:221033/149‑1 (MQ=255) gTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGc > 6:26727/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGTCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCaaccag > 7:201020/1‑143 (MQ=255) cTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTAAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCt > 1:330768/1‑149 (MQ=255) cGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTgg > 7:266139/1‑149 (MQ=255) gCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTg < 4:108250/147‑1 (MQ=255) gCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGt > 3:83525/1‑149 (MQ=255) cTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGt‑t > 3:155341/1‑149 (MQ=255) ggCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑Tg < 7:25169/147‑1 (MQ=255) ggttctggTTGTCGAGCGCCAGGGCGATCTTGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGGGGATTTCGTGGCTGATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCGATGTCCAGGGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCGAGCTCCTGGT‑TGGAc < 4:103220/143‑1 (MQ=255) aGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGAcag < 1:182659/149‑1 (MQ=255) gTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGAcaggcgca < 6:139530/149‑1 (MQ=255) cttGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGCCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTCGGCCATGTCCAGCGCTCGCCTGCGGGCTTCTTCCAGCACCTGCT‑AGGAcaagatcg > 3:103220/2‑143 (MQ=37) gTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGAcaggctcagg < 2:428029/148‑1 (MQ=255) ccAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGgctg > 7:154218/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGgctgc < 2:410035/149‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcag > 4:17402‑M1/1‑81 (MQ=255) gcgcCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGt > 6:252575/1‑129 (MQ=255) gcgcCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGt < 5:252575/129‑1 (MQ=255) cgcCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGt > 7:319916/1‑149 (MQ=255) cAGGGCTATCATTCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGc < 4:338192/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGc > 6:114127/1‑149 (MQ=255) tCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCtt > 8:358693/1‑148 (MQ=255) aTGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGa < 2:355084/148‑1 (MQ=255) ccGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTCTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGc < 1:64996/148‑1 (MQ=255) ccGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTc < 4:83525/149‑1 (MQ=255) gAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGt > 3:197651/1‑149 (MQ=255) gCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGttc < 3:34058/149‑2 (MQ=255) gCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTg < 7:92774/149‑1 (MQ=255) gCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTg < 2:130549/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTg > 8:266139‑M2/1‑148 (MQ=255) cGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggc > 3:304967‑M1/1‑53 (MQ=255) cGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggc < 4:304967‑M1/145‑93 (MQ=255) ttGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgc > 5:26727‑M2/1‑143 (MQ=255) ttGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgc > 8:319916‑M2/1‑143 (MQ=255) gAGCGGTGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggcgcgcgcc < 2:61191‑M1/148‑100 (MQ=255) aGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggcgcgcgccgc < 3:17402‑M1/149‑102 (MQ=255) aGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggcgcgcgccg < 3:150510‑M1/148‑101 (MQ=255) cGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGaca < 4:155341/149‑1 (MQ=255) gggCGGATTTCGTGTCTCATGTTGTCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGAt < 8:325385/147‑1 (MQ=255) gATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGCGCGCGCCGACACGATGTCtt < 7:358693/149‑1 (MQ=255) aTTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTc < 8:154218/149‑1 (MQ=255) gTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCt > 1:22565/1‑149 (MQ=255) cATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGtt > 5:376708/1‑147 (MQ=255) aTGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGTCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCGTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTc < 1:248899/147‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGCGGCGCGCGCCTTGGCCATGTCCAGCTCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTTGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTgg < 5:337414/149‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTgg < 7:185240/149‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTg < 4:96788/91‑1 (MQ=255) ggcggcGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGc > 2:222322/1‑149 (MQ=255) gcggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgct < 3:17402‑M2/149‑49 (MQ=255) cggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgct < 3:150510‑M2/148‑49 (MQ=255) cggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCgg > 2:400819/1‑149 (MQ=255) ggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcacaccgctc < 2:61191‑M2/148‑50 (MQ=255) gcgcgcaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggcgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgctcaa > 8:319916‑M1/1‑6 (MQ=255) gcgcgcaccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggcgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgctcaa > 5:26727‑M1/1‑6 (MQ=255) cgcgcCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTc < 8:122241/149‑1 (MQ=255) caccaacgagctcaaggccagcaacagcagcctgagcctgtccaaccaggagctggaacaagcccgcagccgagcgctggacatggcccaggcgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgctcaacggca > 8:266139‑M1/1‑1 (MQ=255) | CAGCACCTTGCCCGAGTCATGGGCGATAGCCAGTTGCTGGCGTTGCTCGCTGGGCAGCGGGTTGTCCAGCGCCAGGGCGATCATGCCGAGCATGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGT‑TGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCC > NC_002947/2098828‑2099122 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |