| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 2098975 | 59 (0.820) | 7 (0.100) | 7/252 | NT | 11.1% | coding (915/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| ? | NC_002947 | = 2099067 | 57 (0.850) | coding (823/2358 nt) | PP_1875 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator | |||||
TGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCGTCATGCTCGTGT > NC_002947/2098920‑2099212 | tGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTg > 8:266139‑M2/1‑148 (MQ=255) ttGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgc > 5:26727‑M2/1‑143 (MQ=255) ttGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgc > 8:319916‑M2/1‑143 (MQ=255) cGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGaca < 4:155341/149‑1 (MQ=255) gggCGGATTTCGTGTCTCATGTTGTCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGAt < 8:325385/147‑1 (MQ=255) gATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGCGCGCGCCGACACGATGTCtt < 7:358693/149‑1 (MQ=255) aTTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTc < 8:154218/149‑1 (MQ=255) gTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCt > 1:22565/1‑149 (MQ=255) cATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGtt > 5:376708/1‑147 (MQ=255) aTGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGTCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCGTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTc < 1:248899/147‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGCGGCGCGCGCCTTGGCCATGTCCAGCTCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTTGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTgg < 5:337414/149‑1 (MQ=255) ccAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTgg < 7:185240/149‑1 (MQ=255) ggcggcGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGc > 2:222322/1‑149 (MQ=255) gcggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgct < 3:17402‑M2/149‑49 (MQ=255) cggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgct < 3:150510‑M2/148‑49 (MQ=255) cggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCgg > 2:400819/1‑149 (MQ=255) ggcgCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcacaccgctc < 2:61191‑M2/148‑50 (MQ=255) cgcgcCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTc < 8:122241/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgctcaacg > 3:304967‑M2/1‑92 (MQ=255) gcCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgctcaacg < 4:304967‑M2/145‑54 (MQ=255) gcCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCcgc > 5:425895/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTTGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCcgcg < 2:22565/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCcgcg < 3:39788/149‑1 (MQ=255) ggCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTc < 5:379928/108‑1 (MQ=255) ggCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTc > 6:379928/1‑108 (MQ=255) aTGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGcgccg < 4:197651/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGcgccg > 4:189661/1‑147 (MQ=255) gTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGcgccg < 3:189661/147‑1 (MQ=255) cAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGtt < 2:330768/149‑1 (MQ=255) aGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTc < 1:52478/149‑1 (MQ=255) gcTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGa > 3:283442/1‑148 (MQ=255) gcTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGAt > 2:65134/1‑149 (MQ=255) ggCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCg > 7:164242/1‑149 (MQ=255) cTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgctcaacggcatgctcggcatgatcgccctggcgct > 4:17402‑M2/1‑68 (MQ=255) cTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGt < 5:114127/149‑1 (MQ=255) tGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTg < 1:222322/149‑1 (MQ=255) gggCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGc > 3:391/1‑148 (MQ=255) gTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCt > 7:253664/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGa < 1:65134/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGAc > 6:185897/1‑148 (MQ=255) ccAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGAc < 1:400819/148‑1 (MQ=255) cTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAAct > 8:105535/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAActg < 8:253664/147‑1 (MQ=255) ggACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTgg > 6:148964/1‑149 (MQ=255) gACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTgg < 6:425895/148‑1 (MQ=255) aaaggctcaggctGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATATCGTGGGCCATGCTGACTAACTGCTGGTTGGc > 8:73195/3‑148 (MQ=255) aCAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCg > 8:127564/1‑149 (MQ=255) gctcaggctGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCgg < 3:88363/95‑1 (MQ=255) gctcaggctGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCgg > 4:88363/1‑95 (MQ=255) gctcaggctGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGtt < 7:105238/107‑1 (MQ=255) gctcaggctGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGtt > 8:105238/1‑107 (MQ=255) gctcaggctGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCt > 5:260454/1‑149 (MQ=255) aggctGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTgcgcgccgccttcctggccaacatgagccacgaaatccgcaccccgctcaacggcatgctcggcatgatcgccctggcgctggacaacccgctgcccagcgagcaacgccagcaac > 4:150510‑M2/1‑32 (MQ=255) gctgctGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCt < 4:255022/98‑1 (MQ=255) gctgctGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCAc > 2:73874/1‑147 (MQ=255) gctgctGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGAAACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCt > 3:255022/1‑98 (MQ=255) ctgTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCAc > 2:312710/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCg < 5:185897/148‑1 (MQ=255) tGGCCTTGAGCTCGTTGGTGAGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGACGAtt > 4:410093/1‑149 (MQ=255) ccTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCg < 6:260454/149‑1 (MQ=255) gAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTTCGCCTCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGTCGACCTTCACCATCACGCCGATTTCGTc < 7:73195/147‑1 (MQ=255) gCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCCCCAGCACGCCGATTTCGTCATGc > 1:292995/1‑149 (MQ=255) gCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCGTCATGc > 5:148499/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGtt > 5:306954/1‑113 (MQ=255) tCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGtt < 6:306954/113‑1 (MQ=255) gTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCGTCATGCTc < 8:164242/147‑1 (MQ=255) gTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCGTCATGCTc < 6:376708/147‑1 (MQ=255) gTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCGTCATGCTCgt > 5:414260/1‑149 (MQ=255) tGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCGTCATGCTCgtgt > 8:217033/1‑149 (MQ=255) | TGCCGTTGAGCGGGGTGCGGATTTCGTGGCTCATGTTGGCCAGGAAGGCGGCGCGCGCCTGGGCCATGTCCAGCGCTCGGCTGCGGGCTTGTTCCAGCTCCTGGTTGGACAGGCTCAGGCTGCTGTTGCTGGCCTTGAGCTCGTTGGTGCGCGCCGACACGATGTCTTCCAGCTCGTTCAGGTACTGGGTCAGGCGGTTTTCCGCGGTGCGCCGCTGTTCGATCTCGGTGGCCATGCTGACGAACTGCTGGTTGGCGACCTTCACCAGCACGCCGATTTCGTCATGCTCGTGT > NC_002947/2098920‑2099212 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |