New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5137375 | 74 (1.030) | 5 (0.070) | 5/256 | NT | 6.6% | coding (227/894 nt) | PP_4522 | LysR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 5137408 | 70 (1.020) | coding (194/894 nt) | PP_4522 | LysR family transcriptional regulator |
TGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTG > NC_002947/5137228‑5137523 | tGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCcagcag > 7:126087/1‑149 (MQ=255) cTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGgc > 6:263696/1‑149 (MQ=255) tCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCTAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAgg < 6:271820/147‑1 (MQ=255) tCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCTAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAgg > 5:271820/1‑147 (MQ=255) tCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGgcg > 1:97626/1‑149 (MQ=255) gCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAgg < 6:397793/148‑1 (MQ=255) tGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGtt > 1:182776/1‑149 (MQ=255) gTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGttt > 8:235518/1‑149 (MQ=255) tAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTc > 2:63661/1‑149 (MQ=255) tAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTc < 7:335803/149‑1 (MQ=255) tAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCCTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGtt < 8:285249/147‑1 (MQ=255) gCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAagggcgagctgttcca > 1:129277‑M1/1‑133 (MQ=255) gCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCt > 5:172342/1‑148 (MQ=255) aCCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAagggcgagctgttccatc < 5:277945‑M1/149‑19 (MQ=255) aCCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGAt < 6:236602/149‑1 (MQ=255) aCCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGAt < 5:107279/149‑1 (MQ=255) cGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCGGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATg > 3:309165/1‑148 (MQ=255) cGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATgg < 1:63661/149‑1 (MQ=255) gATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGa < 2:285428/149‑1 (MQ=255) tGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGaa > 3:204474/1‑148 (MQ=255) ttCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCATGATGGAACAGCt > 6:63568/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGGCGAGCACCCCAAGGTTGAGGGGGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTc < 6:251094/149‑1 (MQ=255) ggCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCg < 3:15792/148‑1 (MQ=255) ccAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGccc > 4:358336/1‑149 (MQ=255) aaCGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTt > 2:182776‑M2/1‑148 (MQ=255) aCGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtg > 2:6557‑M2/1‑147 (MQ=255) aCGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtg > 2:97626‑M2/1‑147 (MQ=255) cGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtgc > 2:108689‑M2/1‑146 (MQ=255) ggCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgct < 2:129277‑M1/149‑38 (MQ=255) ggCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtgct > 8:406701‑M2/1‑145 (MQ=255) cAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtgctgg < 3:172333‑M2/149‑7 (MQ=255) aaGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGt > 4:312927/1‑149 (MQ=255) gcgcGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAg > 1:145045/1‑149 (MQ=255) gcgATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGc < 6:296212/149‑1 (MQ=255) gcgATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGc < 3:312927/149‑1 (MQ=255) gATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCt > 5:21879/1‑148 (MQ=255) gATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCt > 7:6179/1‑148 (MQ=255) tCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGa < 4:172333/148‑1 (MQ=255) tCACCGACGGGGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGTCTGaa < 7:183719/149‑1 (MQ=255) cGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggc > 2:338871‑M1/1‑96 (MQ=255) cGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggc < 1:338871‑M1/136‑41 (MQ=255) cGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGccc > 5:358788/1‑149 (MQ=255) aGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGAccc < 3:358336/149‑1 (MQ=255) tCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCg > 2:166991/1‑149 (MQ=255) gATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGt < 8:230783/149‑1 (MQ=255) gATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCAACCCCGGt < 7:235518/149‑1 (MQ=255) gATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCACGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGt < 5:369597/149‑1 (MQ=255) aTCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTg < 8:6179/149‑1 (MQ=255) aCCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGc < 7:234404/148‑1 (MQ=255) ccccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGcac < 1:166991/149‑1 (MQ=255) ccccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGca < 1:432003/148‑1 (MQ=255) ccccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGca > 2:432003/1‑148 (MQ=255) cccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGcac > 5:132853/1‑148 (MQ=255) cccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGcac > 8:313582/1‑148 (MQ=255) ccAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCacaa > 8:46683/1‑149 (MQ=255) cAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCacaa > 6:236214/1‑148 (MQ=255) cAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCacaa > 5:152404/1‑148 (MQ=255) cAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATAATGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTCGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCCACCCCGGTGGCacaa > 4:6020/1‑148 (MQ=255) gTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGa > 3:299458/1‑149 (MQ=255) gAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATa < 5:66119/148‑1 (MQ=255) ccACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGgc < 3:412221/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGt > 5:10964/1‑125 (MQ=255) aCGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGt < 6:10964/125‑1 (MQ=255) gCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCTAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGccc < 2:104531/149‑1 (MQ=255) cgccGCCCTGAAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTc > 2:327261/4‑148 (MQ=255) tCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAg > 6:348704/1‑149 (MQ=255) cGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGc > 7:370378/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCt < 7:313582/149‑1 (MQ=255) cccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAG‑CCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 5:263696/149‑1 (MQ=255) ccTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTgg < 6:416021/149‑1 (MQ=255) gggCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATg < 2:95757/149‑1 (MQ=255) ggcggcggcATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATg > 7:10112/1‑148 (MQ=255) cATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGGAGGTACt > 8:106319/1‑148 (MQ=255) tACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCTCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGAt < 5:63568/149‑1 (MQ=255) tGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGc < 7:46683/149‑1 (MQ=255) cTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGcc > 2:121604/1‑148 (MQ=255) tCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGcc > 2:337405/1‑147 (MQ=255) gAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAgg > 2:252079/1‑149 (MQ=255) gAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAgg > 7:404105/1‑149 (MQ=255) gAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAgg > 7:398426/1‑149 (MQ=255) gAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGACTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAg < 8:126087/148‑1 (MQ=255) aaaCCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGCCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGt > 4:302268/1‑149 (MQ=255) ccGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGa < 8:404105/149‑1 (MQ=255) ccGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGa < 8:398426/149‑1 (MQ=255) cGTCCAGCTCGTCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTCGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGAc < 3:6020/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAg < 6:358788/149‑1 (MQ=255) aGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTTGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGtt < 4:309165/149‑1 (MQ=255) aGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGtt < 8:370378/149‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCa < 5:236214/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGc < 6:172342/148‑1 (MQ=255) gCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcg > 2:338871‑M2/1‑40 (MQ=255) gCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcg < 1:338871‑M2/136‑97 (MQ=255) ccAGCAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcggtgatcgcgccttg < 3:172333‑M1/149‑144 (MQ=255) agcagGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTtgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcggtgatcgcgccttgcc < 2:129277‑M2/149‑113 (MQ=255) aGCAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcggtgatcgcgccttgcc > 8:406701‑M1/1‑4 (MQ=255) gCAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcggtgatcgcgccttgccg > 2:108689‑M1/1‑3 (MQ=255) cagGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATCTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGCCAGGTTCAGCACGCGCt > 8:322721/1‑149 (MQ=255) cAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcggtgatcgcgccttgccgt > 2:97626‑M1/1‑2 (MQ=255) cAagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcggtgatcgcgccttgccgt > 2:6557‑M1/1‑2 (MQ=255) aagggcgagctgttccatcaggaaaccctgcgcctgctggccgagctggacggtttcgagcagtatgccgccgccctgaagggcgaactgcgtggcaccctcaaccttggggtgatcgactccaccgtcggtgatcgcgccttgccgtt > 2:182776‑M1/1‑1 (MQ=255) | TGCTCCTGGCTGTAGGCACCGATGGCTTCGGCCAACGGCAAGGCGCGATCACCGACGGTGGAGTCGATCACCCCAAGGTTGAGGGTGCCACGCAGTTCGCCCTTCAGGGCGGCGGCATACTGCTCGAAACCGTCCAGCTCGGCCAGCAGGCGCAGGGTTTCCTGATGGAACAGCTCGCCCTTGCTGGTCAGGCTGAAGCCCCCCCGACCCCGGTGGCACAACACGATACCCAAGGCGCCCTCCAGCTGGCTCATGTAGGTACTGATGGCCGAGGTCGACAGGTTCAGCTCGCGCTG > NC_002947/5137228‑5137523 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |