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gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 4:364755/149‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGGGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg < 3:66103/149‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatg < 5:386441‑M2/149‑108 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg < 3:351264/149‑1 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggat < 4:401153‑M2/123‑83 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggat > 3:401153‑M2/1‑41 (MQ=255) tggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAg < 6:24776/149‑1 (MQ=255) ggCCAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggct < 7:155427‑M1/148‑144 (MQ=255) ggCCAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggct < 7:96247‑M1/148‑144 (MQ=255) gCCAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggcta < 6:353683‑M1/148‑145 (MQ=255) ccAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggctacg > 1:148875‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggctacg > 2:262333‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggctacg > 2:55291‑M1/1‑3 (MQ=255) ccAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatgg < 7:375104‑M1/144‑142 (MQ=255) ccAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatgg > 8:375104‑M1/1‑3 (MQ=255) cAgactcagctgctgctctttcggcagcacccgcttggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggctacgt > 8:106915‑M1/1‑2 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgc < 4:316987/149‑1 (MQ=255) | CTTCTTCAACATCAAGAGCCGTCGGGTCAATCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGC > NC_002947/5816622‑5816915 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |