New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 5816767 | 74 (1.030) | 4 (0.060) | 4/256 | NT | 5.6% | coding (577/624 nt) | PP_5092 | NLP/P60 protein |
? | NC_002947 | = 5816800 | 65 (0.950) | coding (610/624 nt) | PP_5092 | NLP/P60 protein |
TCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAG > NC_002947/5816652‑5816939 | tCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTc > 2:358672/1‑149 (MQ=255) tCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTc > 5:38837/1‑149 (MQ=255) aCGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtg > 8:106915‑M2/1‑147 (MQ=255) cGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtgg > 2:55291‑M2/1‑146 (MQ=255) cGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtgg > 1:148875‑M2/1‑146 (MQ=255) cGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtgg > 2:262333‑M2/1‑146 (MQ=255) tAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggc < 6:353683‑M2/148‑5 (MQ=255) aGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggcc < 7:155427‑M2/148‑6 (MQ=255) aGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggcc < 7:96247‑M2/148‑6 (MQ=255) ccATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtgg < 7:375104‑M2/144‑4 (MQ=255) ccATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtgg > 8:375104‑M2/1‑141 (MQ=255) aCCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGtt > 4:295546/1‑147 (MQ=255) ccTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGtt < 1:72771/146‑1 (MQ=255) cTGTGTAACGACCGCTTCCTCAACGCTCCACGCCGGTGCAAGCGGGGGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTTGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGc < 8:356219/149‑1 (MQ=255) cTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGc < 5:224496/149‑1 (MQ=255) cTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAACCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGc < 5:374647/149‑1 (MQ=255) ggTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCt < 8:96247/147‑1 (MQ=255) gTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGAt > 5:265445/1‑149 (MQ=255) tAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATc > 3:160023/1‑149 (MQ=255) gACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGa < 2:365443/143‑1 (MQ=255) gACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGa > 1:365443/1‑143 (MQ=255) gACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑gcg > 8:15014/1‑149 (MQ=255) ccacgctccacgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTAc > 8:197398/1‑149 (MQ=255) cacgctccacgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTAcc > 7:336429/1‑149 (MQ=255) cacgctccacgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTAc < 3:295546/148‑1 (MQ=255) gctccacgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGc < 6:37712/149‑1 (MQ=255) cacgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCt > 4:351264/1‑149 (MQ=255) acgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGAAGCAGCTGAGTCTGGCCACGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATACGGTACCGGCCCCtt > 4:319960/1‑149 (MQ=255) cgcCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTAGTGGCAGAACCCTACTGATTCTTTTTATTAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGccc < 1:358672/149‑1 (MQ=255) cGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCGTGCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTcgc < 1:225616/149‑1 (MQ=255) tGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCggg > 3:215633/1‑149 (MQ=255) ggCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGc < 6:369716/149‑1 (MQ=255) gCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCa < 8:155427/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGc < 4:17340/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGcc < 6:38837/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGcc < 6:249911/149‑1 (MQ=255) cGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGccc > 4:39543/1‑149 (MQ=255) ggTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGc > 3:226821/1‑149 (MQ=255) 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aaaGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCATCGct < 7:181984/148‑1 (MQ=255) atcccTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTCAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGctc < 3:211726/146‑1 (MQ=255) aCTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgc < 4:215633/148‑1 (MQ=255) aCTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgc < 2:105505/148‑1 (MQ=255) cTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgcg < 4:226821/148‑1 (MQ=255) 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cT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATAc > 1:43488/1‑148 (MQ=255) cT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATAc < 2:43488/148‑1 (MQ=255) t‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgcg > 3:224946/1‑135 (MQ=255) t‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTcgcgcg < 4:224946/135‑1 (MQ=255) t‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCt < 2:392616/149‑1 (MQ=255) t‑A‑CGTGCTCGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTATGGCCAATCGTTAACCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCTGCCCCTTATCGGGCACCCCCGCTCCCACCCCAATCTCCACGCTCTCTCGCGCAGCTCacctacct > 4:66103/1‑149 (MQ=255) gtggtgGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCtgtg < 4:364755/149‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGGGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg < 3:66103/149‑1 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatg < 5:386441‑M2/149‑108 (MQ=255) tggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTgg < 3:351264/149‑1 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggat > 3:401153‑M2/1‑41 (MQ=255) ggtggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggat < 4:401153‑M2/123‑83 (MQ=255) tggCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAg < 6:24776/149‑1 (MQ=255) aaGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGgc < 4:316987/149‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac > 2:224392/1‑98 (MQ=255) gCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcac < 1:224392/98‑1 (MQ=255) gcagcagcTGAGTCtggccaccacgtagtgcttctgccagtaaggcttgctcaaggtgtcgatactcacccgcttgccacggcgtggagcgtggatgaagcggtcgttacccaggtagatggctacgtgattgacccgacggctcttga > 6:386441‑M2/1‑14 (MQ=255) gcagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGcc > 2:263864/1‑71 (MQ=255) gcagcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGcc < 1:263864/71‑1 (MQ=255) agcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGc > 7:168166/1‑52 (MQ=255) agcagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGc < 8:168166/52‑1 (MQ=255) cagcTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAg < 5:319688/149‑1 (MQ=255) | TCACGTAGCCATCTACCTGGGTAACGACCGCTTCATCCACGCTCCACGCCGTGGCAAGCGGGTGAGTATCGACACCTTGAGCAAGCCTTACTGGCAGAAGC‑‑ACT‑A‑CGTGGTGGCCAAGCGGGTGCTGCCGAAAGAGCAGCAGCTGAGTCTGGCCAAGCGTTAAGCTGATCG‑GCGCTATCCGGTACCGGCCCCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTAGCGCGTCGCTCTCGCGCGCAGCTCACATACCTGTGGGAGCGGGCGCGCCCGCGAAAGGGCCTTTGCAG > NC_002947/5816652‑5816939 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |