New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6086740 | 99 (1.380) | 6 (0.090) | 5/256 | NT | 5.7% | coding (262/1071 nt) | oruR | ornithine utilization transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 6086765 | 103 (1.510) | coding (287/1071 nt) | oruR | ornithine utilization transcriptional regulator |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TCGCTGATCCTCAACGTCTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAA > NC_002947/6086593‑6086888 | tCGCTGATCCTCAACGTCTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGACAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCg > 5:160958/1‑149 (MQ=255) cGCTGATCCTCAACGTCTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCgg > 7:284516/1‑149 (MQ=255) cGCTGATCCTCAACGTCTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGACATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCgg > 6:205594/1‑149 (MQ=255) gCTGATCCTCAACGTCTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGgc > 4:265705/1‑149 (MQ=255) cGTCTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTg > 5:183820/1‑149 (MQ=255) cTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGcc < 7:255150/149‑1 (MQ=255) ttCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCagttccaggccaatgtcct > 2:203544‑M1/1‑130 (MQ=255) ttCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCt > 6:104893/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTg > 4:47719/1‑149 (MQ=255) ccAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCt < 7:206659/147‑1 (MQ=255) ccAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGACAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCt < 6:160958/147‑1 (MQ=255) cAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCagttccaggccaatgtcctcgc > 6:433359‑M1/1‑127 (MQ=255) aGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGaa < 5:50164/149‑1 (MQ=255) gCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGa < 2:91562/131‑1 (MQ=255) aGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgg < 6:44397‑M2/149‑3 (MQ=255) aGACGGTTGCGAGGCGGCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgg > 3:272186‑M2/1‑147 (MQ=255) ttGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCagttccaggccaatgtcctcgcgccgggccaca < 5:433359‑M1/149‑34 (MQ=255) gCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAgcg < 3:152013/148‑1 (MQ=255) 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7:212148/149‑1 (MQ=255) gcgcCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCActg > 5:330239/1‑149 (MQ=255) cAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccgggccaatgccgctgccggccagcaacgccgacgcc < 1:203544‑M2/149‑111 (MQ=255) cAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTgg > 7:329712/1‑149 (MQ=255) cAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTATGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTgg < 1:305158/149‑1 (MQ=255) gCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGaa > 8:291573/1‑148 (MQ=255) cTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGaa > 4:46482/1‑147 (MQ=255) cTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACa < 1:75940/149‑1 (MQ=255) cTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACa < 8:238592/149‑1 (MQ=255) cTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACa < 3:46482/149‑1 (MQ=255) cTGGGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACa < 8:167195/149‑1 (MQ=255) tgtgG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccggg < 4:21143‑M2/110‑78 (MQ=255) tgtgG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccggg > 3:21143‑M2/1‑33 (MQ=255) gtgG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAg > 1:206465/1‑148 (MQ=255) tgG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTc > 8:294529/1‑149 (MQ=255) g‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTcc > 2:197141/1‑84 (MQ=255) g‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTcc < 1:197141/84‑1 (MQ=255) cccGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTATGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTc < 5:419928/149‑1 (MQ=255) cccGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTc < 6:358831/149‑1 (MQ=255) cccGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGAGAACAGTCTTc < 6:81004/149‑1 (MQ=255) ccagttccaggccaatgtcctcgcgccgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccgggccaatgccgctgccggccagcaacgccgacgcctcgcaaccgtct > 2:213032‑M1/1‑2 (MQ=255) ccagttccaggccaatgtcctcgcgccgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccgggccaatgccgctgccggccagcaacgccgacgcctcgcaaccgtct > 5:139937‑M1/1‑2 (MQ=255) ccagttccaggccaatgtcctcgcgccgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccgggccaatgccgctgccggccagcaacgccgacgcctcgcaaccgtct < 6:44397‑M1/149‑148 (MQ=255) cGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCaa < 7:171243/149‑1 (MQ=255) | TCGCTGATCCTCAACGTCTTCCAGGCAGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAA > NC_002947/6086593‑6086888 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |