New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6086740 | 99 (1.380) | 6 (0.090) | 5/256 | NT | 5.7% | coding (262/1071 nt) | oruR | ornithine utilization transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 6086765 | 103 (1.510) | coding (287/1071 nt) | oruR | ornithine utilization transcriptional regulator |
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCTCGACGACGG > NC_002947/6086619‑6086909 | aGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgg > 5:139937‑M2/1‑147 (MQ=255) aGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgg < 6:44397‑M2/149‑3 (MQ=255) aGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgg > 2:213032‑M2/1‑147 (MQ=255) aGACGGTTGCGAGGCGGCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgg > 3:272186‑M2/1‑147 (MQ=255) gCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAgcg < 3:152013/148‑1 (MQ=255) gAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCAt > 5:408613/1‑149 (MQ=255) aGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATg > 1:275009/1‑149 (MQ=255) cGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATgcgc < 1:16058/149‑1 (MQ=255) cGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATgcgc < 3:47719/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTTGCTGGCCTGCAGCGGCATTGGCCCTGCAGACCTTGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCgt < 4:231928/149‑1 (MQ=255) tCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCgt > 5:262207/1‑149 (MQ=255) cGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCg < 3:265705/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACg > 2:363594/1‑149 (MQ=255) gCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACg < 4:4972/148‑1 (MQ=255) gCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACg < 5:44397/148‑1 (MQ=255) cGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGGAGCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGc < 1:125329/149‑1 (MQ=255) gCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTc < 6:262207/149‑1 (MQ=255) cGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCg > 5:358831/1‑149 (MQ=255) 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ggCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCTAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTAcg < 2:272541/148‑1 (MQ=255) gCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTAcgcg > 8:171243/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCACCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTAcgcg > 8:205462/1‑149 (MQ=255) ccGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCgct < 7:103264/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCgct > 5:81004/1‑149 (MQ=255) cGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCgctg < 8:102811/149‑1 (MQ=255) gACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCtctc < 6:183820/149‑1 (MQ=255) aCCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGctcac > 8:305463/1‑146 (MQ=255) ccGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACttt < 8:284516/148‑1 (MQ=255) ccGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTg < 6:408613/149‑1 (MQ=255) 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3:21143‑M2/1‑33 (MQ=255) tgtgG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccggg < 4:21143‑M2/110‑78 (MQ=255) tgG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTc > 8:294529/1‑149 (MQ=255) g‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTcc > 2:197141/1‑84 (MQ=255) g‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTcc < 1:197141/84‑1 (MQ=255) cccGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTATGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTc < 5:419928/149‑1 (MQ=255) cccGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTc < 6:358831/149‑1 (MQ=255) cccGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGAGAACAGTCTTc < 6:81004/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCaa < 7:171243/149‑1 (MQ=255) gcgAGGACATTGGCCTGGAACTgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccgggccaatgccgctgccggccagcaacgccgacgcctcgcaaccgtctgcctg > 6:433359‑M2/1‑22 (MQ=255) gAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTgcg > 4:30816/1‑149 (MQ=255) gAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTgcg > 2:265661/1‑149 (MQ=255) aGGACATTGGCCTGGAACTgggccacagcattggcgcaaacctgcagctcctgctgggtggtgatgcgcgcatcggcatgccccaggtctgccgggccaatgccgctgccggccagcaacgccgacgcctcgcaaccgtctgcctggaa > 2:203544‑M2/1‑19 (MQ=255) cATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGc < 7:291573/149‑1 (MQ=255) cATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGc < 6:90891/149‑1 (MQ=255) aTTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCt > 1:273555/1‑149 (MQ=255) aTTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCt > 3:428952/1‑149 (MQ=255) aTTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTACCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCt > 1:111085/1‑149 (MQ=255) ttGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCTc > 1:394663/1‑149 (MQ=255) gCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCTcgac < 6:330239/149‑1 (MQ=255) cTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCTcgacga > 2:326135/1‑149 (MQ=255) gAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCTCGacgacg < 2:275009/148‑1 (MQ=255) gAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCTCGACGACgg > 5:435333/1‑149 (MQ=255) | AGACGGTTGCGAGGCGTCGGCGTTGCTGGCCGGCAGCGGCATTGGCCCGGCAGACCTGGGGCATGCCGATGCGCGCATCACCACCCAGCAGGAGCTGCAGGTTTGCGCCAATGCTGTGG‑CCCGGCGCGAGGACATTGGCCTGGAACTGGGCCAGCGCATGCGCGTGTCGTGCTACGGCATGCTCGGTTACGCGCTGCTCTCCAGTGCCACTTTGGGTGACGCCCTACGCCTGGCGCTGCAGTATCCGGCACTGCTGGGAACAGTCTTCAAGCTGCGCTTGCTCGACGACGG > NC_002947/6086619‑6086909 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |