| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 4077627 | 42 (0.590) | 4 (0.060) | 4/256 | NT | 7.5% | coding (972/1188 nt) | PP_3588 | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter |
| ? | NC_002947 | = 4077665 | 58 (0.850) | coding (1010/1188 nt) | PP_3588 | Bcr/CflA family multidrug resistance transporter | |||||
GGGCATCACCCTTTTGATGTGGGAATGGGTGGCAGGTTTATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGC > NC_002947/4077519‑4077813 | gggCATCACCCTTTTGATGTGGGAATGGGTGGCAGGTTTATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGtg > 7:102934‑M2/1‑147 (MQ=255) ttGATGTGGGAATGGGTGGCAGGTTTATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCg < 2:353270/147‑1 (MQ=255) aTGTGGGAATGGGTGGCAGGTTTATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCa < 5:215814/148‑1 (MQ=255) tgtgGGAATGGGTGGCAGGTTTATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCaa > 7:325999/1‑148 (MQ=255) ggAATGGGTGACAGGTTTATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACg < 4:146416/148‑1 (MQ=255) gTGGCAGGTTTATCTTGGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGCCCCAGGGTTTGGGGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCt < 1:289907/149‑1 (MQ=255) tttATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCgccg > 2:238456/1‑149 (MQ=255) cTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCACAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCgccggtgcc > 1:173446/1‑149 (MQ=255) tgtgCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCgccggtgccg > 5:155350/1‑149 (MQ=255) tgCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCgccggtgccggt > 4:14958/1‑149 (MQ=255) cTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGtt < 3:370996/148‑1 (MQ=255) ggggCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGAc < 8:325999/149‑1 (MQ=255) ctctACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAg > 8:269861/1‑148 (MQ=255) gCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTgg > 2:77557/1‑149 (MQ=255) ccGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGttt > 3:96347/1‑134 (MQ=255) ccGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGttt < 4:96347/134‑1 (MQ=255) gatgatTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGtgtg < 1:322977/145‑1 (MQ=255) gatgatTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGtgtg > 2:322977/1‑145 (MQ=255) ttGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTACTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGt > 8:296094/1‑149 (MQ=255) tGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGt > 8:147463/1‑141 (MQ=255) tGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGt < 7:147463/141‑1 (MQ=255) tACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTgg < 4:386441/146‑1 (MQ=255) ccaccGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGc > 8:190369/1‑149 (MQ=255) cGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGc > 7:96126/1‑149 (MQ=255) cccTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTAccggcc > 1:51110/1‑149 (MQ=255) cTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTAccggcc > 3:274520/1‑147 (MQ=255) cTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTAccggcc < 4:274520/147‑1 (MQ=255) gTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCt < 1:238456/148‑1 (MQ=255) cGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTggg > 6:46836/1‑149 (MQ=255) cGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTACTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTgg < 7:296094/148‑1 (MQ=255) gCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGc > 1:280132/1‑149 (MQ=255) cccGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGt > 4:206364/1‑149 (MQ=255) cccGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGt < 4:217894/149‑1 (MQ=255) cgccgcAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGtgcggcggggcgtaccagggttgtcccggtggtacagacaatcatcggcagtagagcccccagcacagataaacctgccacccattcccacatcaaaagggtga < 4:187904‑M2/149‑105 (MQ=255) cgccgcAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGACGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAATCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGc > 2:352001/1‑149 (MQ=255) ccgcAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCTCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCTCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTg < 4:186302/149‑1 (MQ=255) ccgcAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGtgcggcggggcgtaccagggttgtcccggtggtacagacaatcatcggcagtagagcccccagcacagataaacctgccacccattcccacatctaaagggtgat > 4:369683‑M2/1‑43 (MQ=255) ccgcAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGtgcggcggggcgtaccagggttgtcccggtggtacagacaatcatcggcagtagagcccccagcacagataaacctgccacccattcccacatcaaaagggtgat < 3:369683‑M2/148‑106 (MQ=255) gcAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGtgcggcggggcgtaccagggttgtcccggtggtacagacaatcatcggcagtagagcccccagcacagataaacctgccacccattcccacatcaaaagggtgatgcc > 3:187904‑M2/1‑41 (MQ=255) gcAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGtt < 1:77557/149‑1 (MQ=255) aaCGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCa > 3:380550/1‑149 (MQ=255) gACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTATGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCAtg > 4:284795/1‑148 (MQ=255) gACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTATGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCAtg < 3:284795/148‑1 (MQ=255) cccAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCAtggtg < 2:280132/149‑1 (MQ=255) ccAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCAtggtgg > 4:122485/1‑149 (MQ=255) aGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTCCCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGc > 2:363054/1‑148 (MQ=255) aGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGc > 7:341574/1‑148 (MQ=255) aGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGc > 7:135951/1‑148 (MQ=255) gCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAg > 1:115408/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCTCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCtgtg > 6:88685/1‑149 (MQ=255) cgcgcTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGATGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGc < 5:236383/149‑1 (MQ=255) cgcgcTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCACTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGc > 2:80207/1‑149 (MQ=255) gcgcTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCg > 2:84241/1‑149 (MQ=255) gcgcTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCg > 3:310712/1‑149 (MQ=255) gcgcTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCg > 3:385146/1‑149 (MQ=255) tATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCTTGGTGGCCAGCCTGTGCGGAgg > 7:67410/1‑149 (MQ=255) tCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGa > 4:351413/1‑90 (MQ=255) tCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGa < 3:351413/90‑1 (MQ=255) tCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCAtg < 2:81700/127‑1 (MQ=255) tCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCAtg > 1:81700/1‑127 (MQ=255) ccGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTg > 5:348653/1‑149 (MQ=255) cgcgGCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAAATCGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTg < 4:385146/148‑1 (MQ=255) gcgGCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGGTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGgc < 8:161239/149‑1 (MQ=255) gcaggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAg > 7:254228/1‑87 (MQ=255) gcaggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAg < 8:254228/87‑1 (MQ=255) gcaggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGACTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTtg > 7:122014/1‑148 (MQ=255) aggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTtgcat < 1:84241/149‑1 (MQ=255) aggTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTtgcat > 3:289498/1‑149 (MQ=255) gTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTtgcatgc < 5:88685/149‑1 (MQ=255) | GGGCATCACCCTTTTGATGTGGGAATGGGTGGCAGGTTTATCTGTGCTGGGGGCTCTACTGCCGATGATTGTCTGTACCACCGGGACAACCCTGGTACGCCCCGCCGCAACGACCCAGGCTTTGGCGCGCTATCCGCGTCAGGCAGGTGCGGCAGCGTCGCTCAATACGACATTGCTGTTCGCCGGTGCCGGTTTGACGAGCAGTGTGGTCGCAGGTTTGGAAAGCGAGCTACCGGCCGGCTTGGGCGTGCTGTTCATGGTGGCCAGCCTGTGCGGAGGGTGGCTGCTTGCATGC > NC_002947/4077519‑4077813 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |