| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5380510 | 76 (1.060) | 5 (0.070) | 5/258 | NT | 5.6% | coding (92/405 nt) | fur | ferric iron uptake global transcriptional repressor Fur |
| ? | NC_002947 | = 5380557 | 97 (1.410) | coding (45/405 nt) | fur | ferric iron uptake global transcriptional repressor Fur | |||||
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
GGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCACCGATGCAA > NC_002947/5380424‑5380704 | gggTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCg > 6:297067/1‑149 (MQ=255) tCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCt > 3:426670/1‑149 (MQ=255) cgcgATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTgcg > 3:277579/1‑148 (MQ=255) cgATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCaa < 3:87683/149‑1 (MQ=255) gATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAAt > 2:195292/1‑149 (MQ=255) aTAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAAtt < 4:424545/149‑1 (MQ=255) gACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGc < 1:192451/149‑1 (MQ=255) ggTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGTTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGTGTCTCCTTGA‑GACCGTCTTTGCGCAATTCGCTa < 7:202698/148‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTAtttt > 1:229981/1‑148 (MQ=255) cAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCaa < 6:93699/149‑1 (MQ=255) cTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTga‑g > 5:173090/1‑115 (MQ=255) cTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTga‑g < 6:173090/115‑1 (MQ=255) cTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑g > 5:280671/1‑149 (MQ=255) cTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑g < 7:363734/149‑1 (MQ=255) cTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGGCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑g < 5:87743/149‑1 (MQ=255) tACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑gg > 4:414788/1‑149 (MQ=255) aTCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGt > 8:110735/1‑147 (MQ=255) tCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGCCTCGA‑‑G‑GCAGGGTCCCCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCTCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCtt > 7:350247/1‑149 (MQ=255) tCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCtt > 1:184018/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGAGTtct > 8:285083/1‑149 (MQ=255) aGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCg > 7:6841/1‑149 (MQ=255) aGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTAT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTAAACCAT‑‑GGTCAGCTTtctag > 7:329760/1‑147 (MQ=255) gCCTCGATCAGCGGCTTGTTTAAATCCTCT‑GCACTCATGTGACGGTTCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCAGCTTGA‑GACCTGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGc < 7:195985/149‑1 (MQ=255) cTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCTGGCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGcc > 1:253876/1‑149 (MQ=255) cTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGcc > 5:219667/1‑148 (MQ=255) cTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGcc > 1:18531/1‑148 (MQ=255) cTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCATGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTTA‑GACCGGCTTAGCGCAATTAGCTATTTTCAACCAT‑‑GCTCATCTTTCTcccc > 1:399022/1‑148 (MQ=255) tCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGa > 7:311185/1‑149 (MQ=255) ccATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGAt > 6:225846/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGAtgc > 7:124685/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGAtgc < 3:192858/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGAtgct > 3:81478/1‑149 (MQ=255) cgcCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAAGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCtt > 8:406815/1‑149 (MQ=255) ccTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTca < 2:18531/149‑2 (MQ=255) cTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGc < 2:229981/149‑1 (MQ=255) tAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGc < 2:358621/148‑1 (MQ=255) cATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTtctc < 2:110814/149‑1 (MQ=255) ccTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTctct > 4:417711/1‑147 (MQ=255) ccTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTctct < 3:417711/147‑1 (MQ=255) ctct‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTaa < 3:414788/149‑1 (MQ=255) ctct‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACAAT‑‑GGTCAGCGTTCTCGCCGATGATGCTTCGCAGCTTCTCTTaa > 5:363813/1‑149 (MQ=255) tct‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTctct > 2:269357/1‑145 (MQ=255) tct‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTctct < 1:269357/145‑1 (MQ=255) cACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACgg < 5:297067/149‑1 (MQ=255) cACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTAGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACgg > 2:202991/1‑149 (MQ=255) aCTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACggg > 8:127055/1‑149 (MQ=255) tCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTa > 3:157026/1‑149 (MQ=255) tCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTa > 4:229556/1‑149 (MQ=255) tCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTa > 6:1608/1‑149 (MQ=255) tCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCGTGACTCGA‑‑G‑GCAGGgtcacatgagtgcagaggatgtctacaaggcgctgatggaggctggcgaggatgtaggcatggccaccgtctatcgcgtgctgccccagttc < 5:82064‑M2/148‑93 (MQ=255) aTGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTAt > 4:135191/1‑148 (MQ=255) aTGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTAt > 1:316678/1‑148 (MQ=255) tgACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGAt < 7:383389/148‑1 (MQ=255) tgACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGAt < 8:124685/148‑1 (MQ=255) tgACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTATTAATACGGGTATGATc > 2:184970/1‑149 (MQ=255) tgACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGATTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCACCTTATCTTAATACCGGTATGAt > 8:383389/1‑148 (MQ=255) aCGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCgg < 1:195292/149‑1 (MQ=255) cGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGgtcacatgagtgcagaggatgtctacaaggcgctgatggaggctggcgaggatgtag > 4:235117‑M2/1‑48 (MQ=255) cGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGgtcacatgagtgcagaggatgtctacaaggcgctgatggaggctggcgaggatgtag < 3:235117‑M2/105‑58 (MQ=255) cGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCggg < 4:81478/149‑1 (MQ=255) cGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCggg < 6:219667/149‑1 (MQ=255) gctgctCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGACGACCGGCTTTGCGCAATTGGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGATATGATCggg > 1:342909/1‑149 (MQ=255) gctCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGtt > 2:36404/1‑148 (MQ=255) ggTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCTACCGAGCAGCgtcacatgagtgcagaggatgtctacaatgcgctgatggaggctggcgaggatgtaggccttgccaccgtctatagcgtgctgacccagttctaggcggcgggtct < 6:343948‑M2/149‑107 (MQ=255) ggTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTAc < 7:406815/147‑1 (MQ=255) ggTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGt > 3:390496/1‑149 (MQ=255) gTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCg < 2:188560/138‑1 (MQ=255) gTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCg > 1:188560/1‑138 (MQ=255) gTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGtt < 5:1608/149‑1 (MQ=255) tAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCTACCGAGCAGCgtcacatgagtgcagaggatgtctacaaggcgctgatggaggctggcgaggatgtaggcctggccaacgtctatcgcgtgctgacccagttcgaggcggcgggtctgg < 1:352578‑M2/149‑109 (MQ=255) gagTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTc < 3:229556/149‑1 (MQ=255) tCGAGCATCTGAAGGTTCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTTA‑TACCTGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTTAACCATCAATTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTc < 1:136875/148‑1 (MQ=255) tCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAg < 1:36404/149‑1 (MQ=255) tCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAg > 3:401164/1‑149 (MQ=255) tCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAAAACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAg < 7:110735/149‑1 (MQ=255) gAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGc < 6:343784/148‑1 (MQ=255) aGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCa < 4:426670/149‑1 (MQ=255) tGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTGCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCCGCCAagagag > 6:162456/1‑149 (MQ=255) gAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAg > 4:13270/1‑98 (MQ=255) gAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAg < 3:13270/98‑1 (MQ=255) aaGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCATGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGt < 7:407255/148‑1 (MQ=255) aaGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGAt < 2:184018/145‑1 (MQ=255) aaGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAg < 4:390496/147‑1 (MQ=255) aaGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTg < 3:135191/149‑1 (MQ=255) tCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGt > 4:68263/1‑149 (MQ=255) tGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGc > 4:394911/1‑149 (MQ=255) tGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGACAGGTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCAAGACAAGATAGTGGAAGTCGc > 5:355462/1‑149 (MQ=255) tCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGt < 1:156839/136‑1 (MQ=255) tCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGt > 2:156839/1‑136 (MQ=255) tCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCAc > 4:318132/1‑149 (MQ=255) tCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCAc > 2:413932/1‑149 (MQ=255) tCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCAc > 8:386245/1‑149 (MQ=255) gA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCAcc > 5:184813/1‑148 (MQ=255) gA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCAcc > 3:227817/1‑148 (MQ=255) a‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACg > 6:128228/1‑115 (MQ=255) a‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACg < 5:128228/115‑1 (MQ=255) a‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCACCCACCGa > 2:57359/1‑149 (MQ=255) g‑gCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCACCGAt > 5:241080/1‑149 (MQ=255) g‑gCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCACCGAt > 1:170268/1‑149 (MQ=255) ggTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCACCGATGCaa > 3:384018/1‑148 (MQ=255) | GGGTCAGCACGCGATAGACGGTGGCCAGGCCTACATCCTCGCCAGCCTCCATCAGCGCCTTGTAGACATCCTCT‑GCACTCATGTGACGCTGCTCGGTAGAGTCGAGCATCTGAAGGATCTTGACTCGA‑‑G‑GCAGGGTCACCTTGA‑GACCGGCTTTGCGCAATTCGCTATTTTCAACCAT‑‑GGTCAGCTTTCTCGCCGATGCTGCTTCGCAGCTTCTCTTAATACGGGTATGATCGGGGTTTACGTTGTCCAGCCAAGATAGTGGAAGTCGCCCACCGATGCAA > NC_002947/5380424‑5380704 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |