| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 186030 = | 72 (1.380) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 6.0% | coding (109/522 nt) | PP_0162 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor |
| ? | NC_002947 | 186077 = | 57 (1.150) | coding (62/522 nt) | PP_0162 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor | |||||
TAGGCCCTGTGCAGTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGA > NC_002947/185882‑186177 | cattacccgctttacgcgttaactgatgggttgcaaattaatcttgctccgccaacaatgagactaattatcattaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaccgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccac < 6:104365‑M1/1‑1 (MQ=255) aGGCCCTGTGCAGTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCg > 4:44607/1‑149 (MQ=255) ccTGTGCAGTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTg > 5:249938/1‑149 (MQ=255) cTGTGCAGTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGc < 3:109888/149‑1 (MQ=255) tgCAGTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGtt < 7:110122/149‑1 (MQ=255) cAGTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGc < 7:5986/149‑1 (MQ=255) gTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCg < 3:44607/149‑1 (MQ=255) ttCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGa < 3:138360/149‑1 (MQ=255) ccTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCgcgc > 5:314414/1‑149 (MQ=255) cTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGa > 2:272797/1‑146 (MQ=255) cTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGa < 1:272797/146‑1 (MQ=255) cTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGc < 8:14209/148‑1 (MQ=255) cTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGc < 6:249938/148‑1 (MQ=255) cTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGc < 8:245415/148‑1 (MQ=255) cTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCAGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCt > 1:85140/1‑149 (MQ=255) gcggcgCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTg < 6:148171/148‑1 (MQ=255) cggcgCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCt < 3:132381/149‑1 (MQ=255) ccAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACg > 5:176279/1‑147 (MQ=255) aaTGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGc > 3:249411/1‑149 (MQ=255) aaTGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGc > 1:34966/1‑149 (MQ=255) aaTGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGc > 2:171094/1‑149 (MQ=255) aaTGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCGGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGc > 1:231147/1‑149 (MQ=255) tcgatcACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGt < 5:76442/149‑1 (MQ=255) cgatcACCAGCCCACGGGCTACGGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGGGCTTTGAGGTGCAATTGTTCACGACTCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGTGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGt < 6:241043/148‑1 (MQ=255) aCCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCa < 8:170097/148‑1 (MQ=255) ccAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGCGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAAc > 6:312936/1‑149 (MQ=255) aGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCa < 5:70273/149‑1 (MQ=255) ccACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAg > 6:283628/1‑147 (MQ=255) ccACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGcc > 7:74897/1‑149 (MQ=255) tccgccaacaatgagactaattatcattaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgt < 6:152673‑M1/48‑1 (MQ=255) aCGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgt > 1:79992/1‑149 (MQ=255) cgcgCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtg < 4:272218/149‑1 (MQ=255) gcgcTACCGTGCGCAGGAAGGCGGTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGAGGAAGGTATCCTGGGCGTTGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtgg < 1:255057/149‑1 (MQ=255) cgccaacaatgagactaattatcataaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtg > 4:110262‑M1/100‑148 (MQ=255) gcTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtggtg < 8:154125/149‑1 (MQ=255) gcTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtggtg < 8:74897/149‑1 (MQ=255) cctacaatgagactaattatcattaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtggtg > 4:67854‑M1/98‑149 (MQ=255) tACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTggtggt > 6:63058/1‑149 (MQ=255) aacaatgagactaattatcattaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTggtggt > 5:152673‑M1/96‑149 (MQ=255) gTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACt < 8:250576/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTg > 8:243949/1‑149 (MQ=255) gcAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTg > 7:260385/1‑146 (MQ=255) cAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAgg < 5:202601/119‑1 (MQ=255) cAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAgg > 6:202601/1‑119 (MQ=255) 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7:243949/147‑1 (MQ=255) ggCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACg < 5:2786/147‑1 (MQ=255) aGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCt > 4:85057/1‑149 (MQ=255) cAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGGCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTg < 1:136253/145‑1 (MQ=255) cAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTggg < 8:172992/147‑1 (MQ=255) aaTTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCAt > 1:46809/1‑149 (MQ=255) aaTTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCAt > 6:90040/1‑149 (MQ=255) ttGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATgg < 5:254805/149‑1 (MQ=255) gTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTTGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATgga < 1:171094/148‑1 (MQ=255) tCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATggag > 8:210970/1‑147 (MQ=255) acgacgCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGaggagg < 2:231147/149‑1 (MQ=255) gacgCTGTAGCAAGCAGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGgc < 2:85140/149‑1 (MQ=255) cTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCg > 5:104365/1‑149 (MQ=255) aGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTATAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAAt < 5:283628/149‑1 (MQ=255) aGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAAt < 2:79992/149‑1 (MQ=255) gCGGACGAATGAAGCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGTTGGTCTCTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATg < 5:291497/149‑1 (MQ=255) gACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGAc > 6:136136/1‑149 (MQ=255) gACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGAc < 2:46809/149‑1 (MQ=255) gaacagTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGt < 2:96299/144‑1 (MQ=255) gAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGa < 4:136790/145‑1 (MQ=255) gAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGa > 3:136790/1‑145 (MQ=255) gAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGt > 8:150244/1‑148 (MQ=255) ggTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAAt < 6:176279/149‑1 (MQ=255) tCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGAt < 4:228783/148‑1 (MQ=255) ggCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAg < 3:278199/149‑1 (MQ=255) ggCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAg > 8:230494/1‑149 (MQ=255) aGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCAttgt > 1:135874/1‑149 (MQ=255) ccGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCAt > 7:88164/1‑144 (MQ=255) ccGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCAt < 8:88164/144‑1 (MQ=255) agCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATTGAGGAGGGCGGCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCTTTGTTgg < 8:260385/148‑1 (MQ=255) cATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCg < 6:314414/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCg > 1:51538/1‑147 (MQ=255) tCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGa < 2:51538/149‑1 (MQ=255) | TAGGCCCTGTGCAGTTCCTCGCGGCGCCAATGATCGATCACCAGCCCACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGA > NC_002947/185882‑186177 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |