New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 186030 = | 72 (1.380) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 6.0% | coding (109/522 nt) | PP_0162 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor |
? | NC_002947 | 186077 = | 57 (1.150) | coding (62/522 nt) | PP_0162 | ECF family RNA polymerase sigma‑70 factor |
ACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGTTAACGCGTAAAGCCGGTAATG > NC_002947/185929‑186224 | tccgccaacaatgagactaattatcattaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgt < 6:152673‑M1/48‑1 (MQ=255) aCGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgt > 1:79992/1‑149 (MQ=255) cgcgCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtg < 4:272218/149‑1 (MQ=255) gcgcTACCGTGCGCAGGAAGGCGGTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGAGGAAGGTATCCTGGGCGTTGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtgg < 1:255057/149‑1 (MQ=255) cgccaacaatgagactaattatcataaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtg > 4:110262‑M1/100‑148 (MQ=255) gcTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtggtg < 8:154125/149‑1 (MQ=255) gcTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtggtg < 8:74897/149‑1 (MQ=255) cctacaatgagactaattatcattaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgtggtg > 4:67854‑M1/98‑149 (MQ=255) tACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTggtggt > 6:63058/1‑149 (MQ=255) aacaatgagactaattatcattaacgtccattgatgccggcgccctcctccatgcccagcaacgattccgtgcaaacgctctacagtgaccaccaCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTggtggt > 5:152673‑M1/96‑149 (MQ=255) gTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACt < 8:250576/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTg > 8:243949/1‑149 (MQ=255) gcAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTg > 7:260385/1‑146 (MQ=255) cAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTaga < 2:34966/149‑1 (MQ=255) aGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgt < 8:4753/133‑1 (MQ=255) aGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCgt > 7:4753/1‑133 (MQ=255) gCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTg < 5:63058/149‑1 (MQ=255) cttggCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCAc < 6:131278/146‑1 (MQ=255) ggCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACg < 5:2786/147‑1 (MQ=255) ggCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACg < 7:243949/147‑1 (MQ=255) aGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCt > 4:85057/1‑149 (MQ=255) cAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGGCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTg < 1:136253/145‑1 (MQ=255) cAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTggg < 8:172992/147‑1 (MQ=255) aaTTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCAt > 6:90040/1‑149 (MQ=255) aaTTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCAt > 1:46809/1‑149 (MQ=255) ttGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATgg < 5:254805/149‑1 (MQ=255) gTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTTGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATgga < 1:171094/148‑1 (MQ=255) tCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATggag > 8:210970/1‑147 (MQ=255) acgacgCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGaggagg < 2:231147/149‑1 (MQ=255) gacgCTGTAGCAAGCAGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGgc < 2:85140/149‑1 (MQ=255) cTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCg > 5:104365/1‑149 (MQ=255) aGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTATAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAAt < 5:283628/149‑1 (MQ=255) aGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAAt < 2:79992/149‑1 (MQ=255) gCGGACGAATGAAGCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGTTGGTCTCTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATg < 5:291497/149‑1 (MQ=255) gACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGAc > 6:136136/1‑149 (MQ=255) gACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGAc < 2:46809/149‑1 (MQ=255) gaacagTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGt < 2:96299/144‑1 (MQ=255) gAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGa < 4:136790/145‑1 (MQ=255) gAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGa > 3:136790/1‑145 (MQ=255) gAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGt > 8:150244/1‑148 (MQ=255) ggTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAAt < 6:176279/149‑1 (MQ=255) tCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGAt < 4:228783/148‑1 (MQ=255) ggCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAg > 8:230494/1‑149 (MQ=255) ggCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAg < 3:278199/149‑1 (MQ=255) aGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCAttgt > 1:135874/1‑149 (MQ=255) accaccacggctggttgcatacctggctgcgtagcaagctcggcaacgcagccgTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCAttgtt > 5:152673‑M2/55‑149 (MQ=255) ccGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCAt > 7:88164/1‑144 (MQ=255) ccGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCAt < 8:88164/144‑1 (MQ=255) caccacggctggttgcatacctggctgcgtagcaagctcggcaacgcagccgTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTAgg > 4:67854‑M2/53‑149 (MQ=255) agCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATTGAGGAGGGCGGCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCTTTGTTgg < 8:260385/148‑1 (MQ=255) cATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCg < 6:314414/149‑1 (MQ=255) cacggctggttgcatacctggctgcgtagcaagctcggcaacgcagccgTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTTATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCg > 4:110262‑M2/50‑148 (MQ=255) tCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCg > 1:51538/1‑147 (MQ=255) tCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGa < 2:51538/149‑1 (MQ=255) acggctggttgcatacctggctgcgtagcaagctcggcaacgcagccgTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGa < 6:152673‑M2/101‑1 (MQ=255) GGCTGCGTTGCAGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACAGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGCGAGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTTGTCTAATTGTTTGCGGAg < 6:235232‑M1/148‑1 (MQ=255) TGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAg > 7:230494‑M1/1‑149 (MQ=255) cGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGa < 7:210970/148‑1 (MQ=255) ccGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCg > 6:286542/1‑135 (MQ=255) ccGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCg < 5:286542/135‑1 (MQ=255) ccGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAAt < 5:312936/148‑1 (MQ=255) gAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAAttt > 6:135546/1‑148 (MQ=255) ttGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGCGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGAc < 2:60765/100‑1 (MQ=255) ttGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGCGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGAc > 1:60765/1‑100 (MQ=255) tGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACACTAGAGCCTTCGCACCGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTACTGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAAcc < 4:249411/149‑1 (MQ=255) cTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAAccc < 7:150244/148‑1 (MQ=255) cGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCAt < 5:90040/147‑1 (MQ=255) cGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATc < 3:85057/148‑1 (MQ=255) cAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGt > 5:131339/1‑149 (MQ=255) aGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGt > 7:148065/1‑148 (MQ=255) ccAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGTTaa > 2:241446/1‑149 (MQ=255) cAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGTTAAc < 3:95519/149‑1 (MQ=255) gTATCCAACCAGCCGTGGTGCTCACTGTAGAGCGATTGCACGGAATCGTTGCTCGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGATAATGATAATTAGTCTCATTGTTGCCGGAGCAAGAATAATTTGCAACCCATCAGTTAAcgcg > 7:111110/1‑149 (MQ=255) tATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGTTAACGCGt < 5:136136/149‑1 (MQ=255) aaCCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCAt > 6:150670/1‑132 (MQ=255) aaCCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCAt < 5:150670/132‑1 (MQ=255) ccAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCaa < 5:85776/125‑1 (MQ=255) ccAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCaa > 6:85776/1‑125 (MQ=255) gTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGGTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGTTAACGCGTAAAGCGGGTAATg < 6:104365‑M2/148‑1 (MQ=255) | ACGCGCTACCGTGCGCAGGAAGGCCCTGGGCGCATTCAGCTGCAATTGTTCACGACGCTGTAGCAAGCGGACGAAGGTATCCTGGGCGAGGTCAGCCGCATCGGCTGCGTTGCCGAGCTTGCTACGCAGCCAGGTATGCAACCAGCCGTGGTGGTCACTGTAGAGCGTTTGCACGGAATCGTTGCTGGGCATGGAGGAGGGCGCCGGCATCAATGGACGTTAATGATAATTAGTCTCATTGTTGGCGGAGCAAGATTAATTTGCAACCCATCAGTTAACGCGTAAAGCCGGTAATG > NC_002947/185929‑186224 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |