New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 437616 | 33 (0.630) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 7.8% | coding (744/1008 nt) | rdoA | serine/threonine protein kinase |
? | NC_002947 | = 437674 | 39 (0.780) | coding (686/1008 nt) | rdoA | serine/threonine protein kinase |
GGTCGTCCCAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGT > NC_002947/437468‑437762 | ggTCGTCCCAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCG < 7:70864‑M1/149‑1 (MQ=255) gtcgtcCCAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTcgc > 5:8831/1‑149 (MQ=255) tcgtcCCAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTGGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTcgcg < 1:96909/149‑1 (MQ=255) tcgtcCCAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTcgcg < 7:209437/149‑1 (MQ=255) tcCCAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGtt > 4:53174/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGcc > 4:87340/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCg < 1:249674/149‑1 (MQ=255) ccTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCa < 6:8831/149‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAg > 3:194712/1‑148 (MQ=255) gcgcTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCcacat < 8:226652/149‑2 (MQ=255) taGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCt < 6:194901/147‑1 (MQ=255) taGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTg > 7:271595/1‑149 (MQ=255) tGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAg < 4:84605/140‑1 (MQ=255) tGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAg > 3:84605/1‑140 (MQ=255) gcgcAGGGCGCGCAGTGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTggg < 4:95445/148‑1 (MQ=255) gcgcAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGc < 3:85063/149‑1 (MQ=255) cTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTc < 8:237527‑M2/147‑2 (MQ=255) tCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGacgattgccgcatgggcccagcggtgcaagacctgtggatgatgctggccggcaaccgcgaggagc < 2:11798‑M1/149‑67 (MQ=255) aGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCATCGCGGTTGCCGTCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGAc > 3:187318/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCa > 5:272449/1‑149 (MQ=255) ggCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCa > 4:40758/1‑149 (MQ=255) gCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCAc > 2:165531/1‑149 (MQ=255) ccAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGTCACTCCTCGCGGTTTCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACg < 3:180405/149‑1 (MQ=255) aGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTg < 1:165531/149‑1 (MQ=255) cgcgcgGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAACATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTa < 3:53174/148‑1 (MQ=255) gcgcgGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCCTCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTaca > 7:142/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGacgattgccgcatgggcccagcggtgcaagacctgtggatgatgctggccggcaaccgcga < 1:239858‑M1/130‑62 (MQ=255) cgcgGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGacgattgccgcatgggcccagcggtgaaagacctgtggatgatgctggccggcaaccgcga > 2:239858‑M1/1‑69 (MQ=255) gcgGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCCGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCCCGTGGTACAcc > 6:182312/1‑149 (MQ=255) aGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCgg < 4:194712/149‑1 (MQ=255) gTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCa > 6:137788/1‑149 (MQ=255) ggcaCTCGTTCTAGCCGTCGATCAGCTCGCCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGGTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGGCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATc < 7:286606/146‑1 (MQ=255) tCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGtt > 1:178447/1‑149 (MQ=255) gTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACATGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGc > 4:241782/1‑149 (MQ=255) gCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCg > 6:201483/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGt > 3:84477/1‑149 (MQ=255) ccAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCggg > 8:109356/1‑130 (MQ=255) ccAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCggg < 7:109356/130‑1 (MQ=255) gCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGAt > 6:156216/1‑148 (MQ=255) gCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGAt < 7:237527/148‑1 (MQ=255) cccAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAg > 6:47041/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCAACATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGc > 3:161756/1‑149 (MQ=255) gcTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTcgaggagcgcctggggcaactggccgagctgatcgacggctacaacgagttccacgacttcgacccgcgcgaactggccctga < 2:11798‑M2/149‑84 (MQ=255) ctcGGGGTTGGCGGCGAGCTTGTTGCTGAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCTTGGGGCAATCGTGGAGGTCGACCTCGTGGGACAGGTCATGGCGGTGCTTCAGGTTGGCGGGGTGCAGGTGGGGGTGGAGGGGGATGAGCtggtgtggt < 4:161756/148‑1 (MQ=255) tcGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTTCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTcgaggagcgcctggggcaactggccgagctgatcgacggctacaacgagttccacgacttcgacccgcg > 2:239858‑M2/1‑61 (MQ=255) tcGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTcgaggagcgcctggggcaactggccgagctgatcgacggctacaacgagttccacgacttcgacccgcg < 1:239858‑M2/130‑70 (MQ=255) gcgGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGGAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTggtgtggtgt < 6:272449/147‑1 (MQ=255) gacgattgccgcatgggcccagcggtgcaagacctgtggatgatgctggccggcaaccgcgaggagcgcctggggcaactggccgagctgatcgacggctacaacgagttccacgacttcgacccgcgcgaactggccctgatcgag < 8:237527‑M1/147‑147 (MQ=255) | GGTCGTCCCAGCGCCTTGCCAGCCAGGCGCTATAGTGCAGCTGGCGCAGGGCGCGCAGGGGCTCGATCAGGGCCAGTTCGCGCGGGTCGAAGTCGTGGAACTCGTTGTAGCCGTCGATCAGCTCGGCCAGTTGCCCCAGGCGCTCCTCGCGGTTGCCGGCCAGCATCATCCACAGGTCTTGCACCGCTGGGCCCATGCGGCAATCGTCGAGGTCGACCACGTGGTACACCTCATCGCGGTGCATCAGGTTGCCGGGGTGCAGGTCGCCGTGCAGGCGGATGAGCTGGTGTGGTGT > NC_002947/437468‑437762 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |