| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 448279 | 59 (1.130) | 4 (0.080) | 3/248 | NT | 6.4% | coding (858/1284 nt) | PP_0369 | diguanylate cyclase |
| ? | NC_002947 | = 448337 | 62 (1.280) | coding (916/1284 nt) | PP_0369 | diguanylate cyclase | |||||
CTTATCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCG > NC_002947/448134‑448427 | cTTAACAGAAGGCCTTCCGTGACGATCATACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGGTGAACGAGCGCAAGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTTATCGCCATAGACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGa < 1:75658/149‑1 (MQ=255) tCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTc < 3:56856/148‑1 (MQ=255) tCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCg < 2:161114/149‑1 (MQ=255) aGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGt < 3:188180/149‑1 (MQ=255) gATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGt > 2:29845/1‑148 (MQ=255) gATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGt > 6:87122/1‑148 (MQ=255) gATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCGGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTg < 4:24047/149‑1 (MQ=255) gCCTTCCGTGACTAGCTGACTGGACTGCCGGTGCGCAGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGTCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGAcc < 3:237024/148‑1 (MQ=255) gCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCa < 5:104538/149‑1 (MQ=255) ttCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGt > 2:118954/1‑149 (MQ=255) aCGAGCTGTCTGGCCTGCCGGGGCGCAGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCgg < 4:191332/149‑1 (MQ=255) cGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGTCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCgg < 5:137163/148‑1 (MQ=255) cGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGt < 7:151050/149‑1 (MQ=255) aCTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTc < 3:288884/147‑1 (MQ=255) cTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGc > 5:155715/1‑148 (MQ=255) gCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACGACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGc > 7:205477/1‑149 (MQ=255) gggCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACcgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacc > 4:164110‑M1/1‑105 (MQ=255) gcCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGTCGCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCaa < 1:29845/149‑1 (MQ=255) gAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCCCTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACcgccggtgacctttgacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctgggcaccgacatcgtgg < 6:210696‑M1/149‑63 (MQ=255) gAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACcgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtgg < 3:164110‑M1/149‑63 (MQ=255) gAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGgtgg > 1:59880‑M2/1‑145 (MQ=255) gcgcacggcgcctggggcGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGgtggccgt > 5:11361‑M2/8‑141 (MQ=255) cATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGgtggccgtg > 3:119341‑M2/1‑140 (MQ=255) aTGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACcgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtggccgtgg < 7:31211‑M1/149‑69 (MQ=255) gCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGcc > 3:27313/1‑148 (MQ=255) aGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc > 4:80257/1‑149 (MQ=255) ccTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGc < 2:9442/141‑1 (MQ=255) ccTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAC‑GACAGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGccagatcgg > 1:9442/1‑142 (MQ=255) cTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTa > 3:240671/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGAGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTa > 7:69960/1‑149 (MQ=255) gggCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATgg < 3:80257/149‑1 (MQ=255) gTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg < 5:132287/149‑1 (MQ=255) tAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg > 5:77988/1‑148 (MQ=255) aCTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGgga < 6:155715/148‑1 (MQ=255) tATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGTTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGggag > 5:101630/1‑147 (MQ=255) tgtgATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGggagga < 1:320768/147‑1 (MQ=255) tgATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTc > 2:151600/1‑149 (MQ=255) aTCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg > 7:290555/1‑138 (MQ=255) aTCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCggg < 8:290555/138‑1 (MQ=255) tCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGcc < 8:205477/149‑1 (MQ=255) t‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGgtg < 1:151600/149‑1 (MQ=255) cGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCg > 2:325084/1‑149 (MQ=255) aTGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGcc > 8:297389/1‑149 (MQ=255) aTGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACCGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCAAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAACGTTATGGCGGGGATGAGTTAGCCCTGGTGTTCGca > 4:103511/1‑148 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGc > 6:68925/1‑147 (MQ=255) gACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGc > 3:294249/1‑147 (MQ=255) ttaaaGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATTTAGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGACAGCCTCTTGTCCAAGGTCAACGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGAGGGGAGGAGTTCTCCCTTGTGTTCGCCTCCAAGAacgc > 8:264455/4‑149 (MQ=255) ttCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc < 8:100414/102‑1 (MQ=255) ttCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc > 7:100414/1‑102 (MQ=255) cAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGAccgccg > 6:291124/1‑149 (MQ=255) aGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCcgcg > 1:288999/1‑149 (MQ=255) gAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCcgcg > 7:1678/1‑148 (MQ=255) ttCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATg > 4:79712/1‑149 (MQ=255) tGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGc > 8:229058/1‑149 (MQ=255) cacCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc > 2:164795/1‑85 (MQ=255) cacCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc > 2:159731/1‑85 (MQ=255) cacCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc < 1:159731/85‑1 (MQ=255) cacCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTAc < 1:164795/85‑1 (MQ=255) acCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCa > 1:226445/1‑149 (MQ=255) acCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGACGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCa > 6:310707/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGgtggccgtgggtgtcattgaatttcttgaagtggtcgacatcggtcatggcgatcacatagttacgccccaggcgctgcat < 7:31211‑M2/149‑82 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGcc < 2:318078/106‑1 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGcc > 1:318078/1‑106 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 8:40624/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 4:11550/1‑149 (MQ=255) ccACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtg > 1:242874/1‑149 (MQ=255) cACGGCCACcgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtggccgtgggtgtcattgaatttcttgaagtggtcgacatcggtcatggcgatcacatagttacgccccaggcgctgcatg > 3:119341‑M1/1‑9 (MQ=255) cACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtgt < 4:27313/149‑1 (MQ=255) cACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCAtgt < 1:118954/149‑1 (MQ=255) aCGGCCACcgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtggccgtgggtgtcattgaatttcttgaagtggtcgacatcggtcatggcgatcacatagttacgccccaggcgccgtgcgc > 5:11361‑M1/1‑8 (MQ=255) gCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGaa < 3:103511/149‑1 (MQ=255) ccACcgccggtgaccttggacaagcggctggcgaccaaccgcagcacctggtcaccgacatcgtggccgtgggtgtcattgaatttcttgaagtggtcgacatcggtcatggcgatcacatagttacgccccaggcgctgcatgcgctc > 1:59880‑M1/1‑4 (MQ=255) ccACGATGTCGGTGCCCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCAAAGGTCACCGGCGgtggccgtgggtgtcattgaatttcttgaaggggtcgacatcggtcatggcgatcacatagttacgccccaggcgctgcatgcgctc < 6:210696‑M2/149‑88 (MQ=255) ccACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGgtggccgtgggtgtcattgaatttcttgaagtggtcgacatcggtcatggcgatcacatagttacgccccaggcgctgcatgcgctc < 3:164110‑M2/149‑88 (MQ=255) ccACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAg > 1:57517/1‑149 (MQ=255) cGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCcg > 7:249612/1‑149 (MQ=255) | CTTATCAGATGGCCTTCCGTGACGAGCTGACTGGCCTGCCGGGGCGCCGTGCGCTGAACGAGCGCATGCAGCGCCTGGGGCGTAACTATGTGATCGCCAT‑GACCGATGTCGACCACTTCAAGAAATTCAATGACACCCACGGCCACGATGTCGGTGACCAGGT‑GCTGCGGTTGGTCGCCAGCCGCTTGTCCAAGGTCACCGGCGGTGGCCGTGCCTACCGTTATGGCGGGGAGGAGTTCGCCCTGGTGTTCGCCGGCAAGACCGCCGCGGAATGCGTGCCGCATGTGGAAGCCG > NC_002947/448134‑448427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |