New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1196535 = | 63 (1.210) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.2% | coding (596/1755 nt) | xcpQ | type II secretion pathway protein XcpQ |
? | NC_002947 | 1196595 = | 50 (1.020) | coding (656/1755 nt) | xcpQ | type II secretion pathway protein XcpQ |
CTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGC > NC_002947/1196387‑1196683 | cTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGggcagcgg > 2:62695/1‑149 (MQ=255) cTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGggcagcgg > 8:3200/1‑149 (MQ=255) tCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGggcagcgg > 8:144842/1‑148 (MQ=255) ggggccgaccatgaccacggcattggtaccttcttcgtattccaggcggatgcccgagccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcgc > 5:287289‑M1/147‑148 (MQ=255) ggggccgaccatgaccacggcattggtaccttcttcgtattccaggcggatgcccgagccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcgc > 6:77794‑M1/147‑148 (MQ=255) aaaCCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGggcagcggc < 6:235961/147‑1 (MQ=255) cGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTAGACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCAcc > 1:30800/1‑149 (MQ=255) aTCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGC‑CCGCCATCAAGAGGTACAGGGCAGCGGCAGCACACAg > 8:83910/1‑147 (MQ=255) tCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTg < 5:269695/149‑1 (MQ=255) cGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGa > 5:136875/1‑149 (MQ=255) aCCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATc > 7:253260/1‑149 (MQ=255) aCCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATc > 1:126203/1‑149 (MQ=255) ccGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCt > 3:25192/1‑148 (MQ=255) ccGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTa > 5:228823/1‑149 (MQ=255) gcgAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGgcagca > 6:26143/1‑134 (MQ=255) gcgAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGgcagca < 5:26143/134‑1 (MQ=255) gcgAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACt > 4:34971/1‑149 (MQ=255) cgAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACtt < 4:25192/149‑1 (MQ=255) aGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGATCCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTg < 1:239456/149‑1 (MQ=255) aGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgc < 7:3200/149‑1 (MQ=255) gTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgcg > 8:240475/1‑149 (MQ=255) gTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGAAACCTAGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgcg > 5:26094/1‑149 (MQ=255) ttGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTgcgc < 2:126203/149‑1 (MQ=255) gggTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑At < 8:253260/149‑1 (MQ=255) attaCACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCaa > 1:310934/1‑149 (MQ=255) ttaCACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCt > 8:168845/1‑132 (MQ=255) ttaCACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAAt > 2:319593/1‑149 (MQ=255) acacCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGc > 3:89961/1‑149 (MQ=255) acacCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGc > 7:25989/1‑149 (MQ=255) ccGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCgg < 1:287150/149‑1 (MQ=255) tccaggcggatgcccgagccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCg < 2:44233‑M1/42‑1 (MQ=255) ggcggcGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTgg > 4:297333/1‑149 (MQ=255) ggcggcGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTgg < 7:83169/149‑1 (MQ=255) gcggcgCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGt < 6:228823/149‑1 (MQ=255) cggcgCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTc < 8:25989/149‑1 (MQ=255) gcACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAgg > 7:40067/1‑149 (MQ=255) gcACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAgg < 7:240475/149‑1 (MQ=255) cAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTAGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCTCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGtgct > 7:155282/1‑149 (MQ=255) ttGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCg < 6:136875/149‑1 (MQ=255) gccaccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGtgctg > 1:44233‑M1/90‑149 (MQ=255) ggtggtGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg > 3:229510/1‑149 (MQ=255) caccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGa > 4:181537‑M1/88‑149 (MQ=255) gtggtgACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCTCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGTCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg < 6:26094/148‑1 (MQ=255) actgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCa < 8:51436/148‑1 (MQ=255) actgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAg > 6:31551/1‑149 (MQ=255) tgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGc > 7:212086/1‑148 (MQ=255) tgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGc > 5:214044/1‑148 (MQ=255) gctggcgcagcaggctggcgatgcgtgtcgaggttgctgcgccagCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGc > 1:4307‑M2/46‑147 (MQ=255) actgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCa < 8:40067/148‑1 (MQ=255) gcgcagcaggctggcgatgcgttcgaggttgctgcgccagCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTAGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg > 2:37890‑M2/41‑134 (MQ=255) gcgcagcaggctggcgatgcgttcgaggttgctgcgccagCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTAGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg < 1:37890‑M2/94‑1 (MQ=255) atgaagcTCGAACGCATCGCCAGCCTTCTGCGCGAGCTCTA‑CCGCCCTCTAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATTCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGc < 8:155282/143‑1 (MQ=255) AGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGc > 4:89961‑M1/1‑149 (MQ=255) CAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCgg > 7:144842‑M1/1‑149 (MQ=255) gAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCgg < 5:9704/148‑1 (MQ=255) aaCGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGtt < 6:214044/149‑1 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTg > 6:14985/1‑147 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTg > 5:196527/1‑147 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGaa < 8:212086/149‑1 (MQ=255) cATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAg < 2:310934/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAACACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGgc < 5:297021/149‑1 (MQ=255) cccAGCCTGCTGCGGCAGCTCGA‑CCGCCCTAAAGCGGGACCGGGCATCGGCAGCACCCAGGGGAGCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGgc < 8:90742/146‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGTGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACATGCGCC‑ATGACAATGCCGCCGAAGTGGTCAAGGAGCTGCCAGG‑GCTAAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGTAGCGGGt > 2:291622/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGt > 6:254330/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGt > 3:317768/1‑148 (MQ=255) ctgctgCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGa < 3:34971/149‑1 (MQ=255) gctgccccagCTCGT‑CCGCCCTGAATAGGTACCGGGCAGCGGCATGACCCAGGGGATCTACTTGCGCC‑ATTCCAATGCCGGCGAAGGGGTCAATGTGCGGCGTGGCGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAg < 1:62695‑M2/139‑1 (MQ=255) ctgcgccagCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGTGTGAg < 4:229510‑M2/138‑1 (MQ=255) cgccagCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGTTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGCCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCa > 4:88349‑M2/7‑147 (MQ=255) cgccagCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCaga < 2:30800‑M2/143‑1 (MQ=255) cagCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAggg > 5:70029‑M2/4‑149 (MQ=255) gCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGc > 5:64099‑M2/2‑148 (MQ=255) gA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAgg < 5:254330/148‑1 (MQ=255) gA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAg < 1:304645/147‑1 (MQ=255) a‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAc > 6:312085/1‑149 (MQ=255) cccTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAccggc > 5:308569/1‑149 (MQ=255) tCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAccggccgg > 4:185417/1‑149 (MQ=255) gagGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggtggt < 5:312085/149‑1 (MQ=255) ggTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGgtggtg < 5:31551/148‑1 (MQ=255) ccGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCGgctggcaccacc < 7:83910/149‑8 (MQ=255) ccGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAgc > 2:290627/1‑149 (MQ=255) ccGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAg < 6:70029/148‑1 (MQ=255) ggcagcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAgccgc < 1:319593/149‑1 (MQ=255) gcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGt < 6:196527/149‑1 (MQ=255) gcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGt < 2:4307/149‑1 (MQ=255) gcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGt > 6:48265/1‑149 (MQ=255) ggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTgg < 5:14985/149‑1 (MQ=255) GCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGc < 6:47710‑M1/149‑1 (MQ=255) | CTCAAACCGCTGATCGACCCGCGAGTTGGGGTTATTACACCGTACCCGGCGGCGCACCAGTTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGA‑CCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCC‑ATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGC > NC_002947/1196387‑1196683 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |