New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1196535 = | 63 (1.210) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.2% | coding (596/1755 nt) | xcpQ | type II secretion pathway protein XcpQ |
? | NC_002947 | 1196595 = | 50 (1.020) | coding (656/1755 nt) | xcpQ | type II secretion pathway protein XcpQ |
TTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGCCCC > NC_002947/1196447‑1196740 | ttGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCg < 6:136875/149‑1 (MQ=255) caccggcggctggcaccaccggccggtccttgccctctgcctcacccgcgccttcaaccggcaccgccccttcctggctgagccctcGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGa > 4:181537‑M1/88‑149 (MQ=255) ggtggtGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg > 3:229510/1‑149 (MQ=255) gtggtgACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCTCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGTCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg < 6:26094/148‑1 (MQ=255) actgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCa < 8:51436/148‑1 (MQ=255) actgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAg > 6:31551/1‑149 (MQ=255) tgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGc > 7:212086/1‑148 (MQ=255) tgactgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGc > 5:214044/1‑148 (MQ=255) gctggcgcagcaggctggcgatgcgtgtcgaggttgctgcgccagCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGc > 1:4307‑M2/46‑147 (MQ=255) actgGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCa < 8:40067/148‑1 (MQ=255) gcgcagcaggctggcgatgcgttcgaggttgctgcgccagCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTAGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg < 1:37890‑M2/94‑1 (MQ=255) gcgcagcaggctggcgatgcgttcgaggttgctgcgccagCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTAGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAg > 2:37890‑M2/41‑134 (MQ=255) atgaagcTCGAACGCATCGCCAGCCTTCTGCGCGAGCTCTACCGCCCTCTAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATTCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGc < 8:155282/143‑1 (MQ=255) AGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGc > 4:89961‑M1/1‑149 (MQ=255) CAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCgg > 7:144842‑M1/1‑149 (MQ=255) gAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCgg < 5:9704/148‑1 (MQ=255) aaCGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGtt < 6:214044/149‑1 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTg > 5:196527/1‑147 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTg > 6:14985/1‑147 (MQ=255) gCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGaa < 8:212086/149‑1 (MQ=255) cATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAg < 2:310934/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAACACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGgc < 5:297021/149‑1 (MQ=255) cccAGCCTGCTGCGGCAGCTCGACCGCCCTAAAGCGGGACCGGGCATCGGCAGCACCCAGGGGAGCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGgc < 8:90742/146‑1 (MQ=255) gCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGTGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACATGCGCCATGACAATGCCGCCGAAGTGGTCAAGGAGCTGCCAGG‑GCTAAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGTAGCGGGt > 2:291622/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGt > 3:317768/1‑148 (MQ=255) ccTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGt > 6:254330/1‑148 (MQ=255) ctgctgCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGa < 3:34971/149‑1 (MQ=255) gctgccccagCTCGTCCGCCCTGAATAGGTACCGGGCAGCGGCATGACCCAGGGGATCTACTTGCGCCATTCCAATGCCGGCGAAGGGGTCAATGTGCGGCGTGGCGCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAg < 1:62695‑M2/139‑1 (MQ=255) ctgcgccagCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGTGTGAg < 4:229510‑M2/138‑1 (MQ=255) cgccagCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGTTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGCCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCa > 4:88349‑M2/7‑147 (MQ=255) cgccagCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCaga < 2:30800‑M2/143‑1 (MQ=255) cagCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAggg > 5:70029‑M2/4‑149 (MQ=255) gCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGc > 5:64099‑M2/2‑148 (MQ=255) gACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAgg < 5:254330/148‑1 (MQ=255) gACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAg < 1:304645/147‑1 (MQ=255) aCCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAc > 6:312085/1‑149 (MQ=255) cccTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAccggc > 5:308569/1‑149 (MQ=255) tCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGAccggccgg > 4:185417/1‑149 (MQ=255) gagGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCggtggt < 5:312085/149‑1 (MQ=255) ggTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGgtggtg < 5:31551/148‑1 (MQ=255) ccGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCGgctggcaccacc < 7:83910/149‑8 (MQ=255) ccGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAgc > 2:290627/1‑149 (MQ=255) ccGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAg < 6:70029/148‑1 (MQ=255) ggcagcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAgccgc < 1:319593/149‑1 (MQ=255) gcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGt < 6:196527/149‑1 (MQ=255) gcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGt > 6:48265/1‑149 (MQ=255) gcggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGt < 2:4307/149‑1 (MQ=255) tcgcagcaccttgaccacttcgccggcattggcatggcgcaagtagatcacctgggtgctgcGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTg > 4:181537‑M2/63‑149 (MQ=255) ggcagcACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTgg < 5:14985/149‑1 (MQ=255) cagcaccttgaccacttcgccggcattggcatgggcgcaagtagatcacctgggtgctgcGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGc > 1:44233‑M2/61‑149 (MQ=255) GCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGc < 6:47710‑M1/149‑1 (MQ=255) ACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCggg < 2:300870‑M1/149‑1 (MQ=255) cAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCAt > 2:28542/1‑149 (MQ=255) aTCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGcc < 1:290627/148‑1 (MQ=255) tCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTg > 7:185318/1‑149 (MQ=255) cgccggcattggcatggcgcaagtagatcacctgggtgctgcGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGa < 2:44233‑M2/106‑1 (MQ=255) cTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTgg < 1:28542/146‑1 (MQ=255) gcgcCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATa < 4:317768/147‑1 (MQ=255) ccATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACg > 6:120079/1‑146 (MQ=255) ccAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAgg > 5:136244/1‑148 (MQ=255) aaTGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTAc > 4:54067/1‑149 (MQ=255) ccGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAAt < 5:48265/149‑1 (MQ=255) ggCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGc > 6:91778/1‑149 (MQ=255) gCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGc < 1:239084/122‑1 (MQ=255) gCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGc > 2:239084/1‑122 (MQ=255) gCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACga > 2:316733/1‑133 (MQ=255) cGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCg < 5:91778/149‑1 (MQ=255) aaGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTg < 6:308569/149‑1 (MQ=255) tGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGt > 5:12775/1‑148 (MQ=255) ggTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGTCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCa > 4:204462/1‑149 (MQ=255) tCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATg < 6:64099/149‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATACCGTGGTCATGGt > 3:130375/1‑149 (MQ=255) gcGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGcccc > 6:77794‑M2/3‑148 (MQ=255) gcGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGcccc > 5:287289‑M2/3‑148 (MQ=255) | TTGGTGGTGACTGACTGGCGCAGCAACCTCGAACGCATCGCCAGCCTGCTGCGCCAGCTCGACCGCCCTCAAGAGGTACCGGGCAGCGGCAGCACCCAGGTGATCTACTTGCGCCATGCCAATGCCGGCGAAGTGGTCAAGGTGCTGCGAGG‑GCTCAGCCAGGAAGGGGCGGTGCCGGTTGAAGGCGCGGGTGAGGCAGAGGGCAAGGACCGGCCGGTGGTGCCAGCCGCCGGTGGCTCGGGCATCCGCCTGGAATACGAAGAAGGTACCAATGCCGTGGTCATGGTCGGCCCC > NC_002947/1196447‑1196740 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |