| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 3364666 = | 58 (1.110) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 6.7% | coding (560/879 nt) | PP_2961 | LysR family transcriptional regulator |
| ? | NC_002947 | 3364702 = | 55 (1.100) | coding (524/879 nt) | PP_2961 | LysR family transcriptional regulator | |||||
ATGCCCAGGCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATGCGGATGGCCAGGTCGA > NC_002947/3364519‑3364810 | aTGCCCAGGCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTtgtg < 4:22370/149‑1 (MQ=255) tgaacgattacaacgaagacctgctcatggaaaacatcgacctggccatccgcattggtttggtgaagagcgaggggctggtggccgtgcccctgggcaccagcacacggcgagtctatgctgcaccggcctatctcgatcgccaTGGc < 1:111713‑M1/4‑1 (MQ=255) tgaacgattacaacgaagacctgctcatggaaaacatcgacctggccatccgcattggtttggtgaagagcgaggggctggtggccgtgcccctgggcaccagcacacggcgagtctatgctgcaccggcctatctcgatcgccaTGGc < 6:308126‑M1/4‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCt > 1:210147/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTtgtg < 1:146959/144‑1 (MQ=255) cAGGCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTtgtg > 2:146959/1‑144 (MQ=255) ggCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGGCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGcc < 1:284992/149‑1 (MQ=255) gCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCa < 4:132405/149‑1 (MQ=255) cGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTcg < 8:7808/149‑1 (MQ=255) gAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTcgg > 2:106166/1‑149 (MQ=255) aCCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCggg < 5:5877/149‑1 (MQ=255) cATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑t > 7:235679/1‑149 (MQ=255) gAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGtgga > 8:302963/1‑148 (MQ=255) gCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGtggctggc > 7:257396/1‑148 (MQ=255) tCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATg > 3:259281/1‑149 (MQ=255) catcgacctggccatccgcattggtttggtgaagagcgagcggctggtggccgtgcccctgggcaccagcacacggcgagtctatgctgcaccggcctatctcgatcgccaTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATg > 1:245879‑M1/112‑149 (MQ=255) tcgacctggccatccgcattggtttggtgaagagcgaggggctggtggccgtgcccctgggcaccagcacacggcgagtctatgctgcaccggcctatctcgatcgccaTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGc > 5:88859‑M1/110‑149 (MQ=255) gCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGTCATgg < 3:87770/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGa > 4:215861/1‑142 (MQ=255) gCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGa < 3:215861/142‑1 (MQ=255) tGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAg < 8:257396/149‑1 (MQ=255) aCGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCgg > 3:39995/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTgca < 2:118683/148‑1 (MQ=255) ccTTTGATTACAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCGCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGGCTGCCTGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGTTTGGCCGGGgcag > 8:293964/1‑148 (MQ=255) cTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTgcagca > 3:17457/1‑149 (MQ=255) tGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCAt < 8:279575/147‑1 (MQ=255) gATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGa > 7:88044/1‑149 (MQ=255) ttGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACt > 8:4774/1‑149 (MQ=255) tCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCgtgt > 5:70476/1‑149 (MQ=255) tCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCgtgt > 6:1582/1‑149 (MQ=255) cAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGtgtg > 4:106998/1‑149 (MQ=255) aaGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCgtgt < 4:252829/147‑1 (MQ=255) gTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTg < 2:126179/149‑1 (MQ=255) tggtggccgtgcccctgggcaccagcacacggcgagtctatgctgcaccggcctatctcgatcgccaTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATgg > 2:209469‑M1/68‑106 (MQ=255) tggtggccgtgcccctgggcaccagcacacggcgagtctatgctgcaccggcctatctcgatcgccaTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATgg < 1:209469‑M1/39‑1 (MQ=255) cTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGt < 2:210147/148‑1 (MQ=255) cACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAgg < 4:17457/149‑1 (MQ=255) aCGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAggg > 3:123930/1‑149 (MQ=255) ggTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCCGCCCGCCCGCCCGGC‑GCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACgg < 1:106166/149‑1 (MQ=255) gTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCAAGGGGCACGGc > 2:253499/1‑149 (MQ=255) tGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCgtt < 7:239745/107‑3 (MQ=255) tGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCgat > 8:239745/1‑105 (MQ=255) tGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGcc > 2:310576/1‑149 (MQ=255) gTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGccacca < 7:4774/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATa < 5:318862/109‑1 (MQ=255) gCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATa > 6:318862/1‑109 (MQ=255) ccAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGcc > 2:217384/1‑149 (MQ=255) ccAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGcc > 8:184175/1‑149 (MQ=255) gCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCt < 8:29104/149‑1 (MQ=255) gTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGc < 8:88044/149‑1 (MQ=255) tCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGct > 8:138396/1‑149 (MQ=255) gTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGctct > 7:193537/1‑149 (MQ=255) tAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCtt < 7:184175/149‑1 (MQ=255) gCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCac > 5:308126/1‑148 (MQ=255) cTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGTCGCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCac < 1:217384/148‑1 (MQ=255) cTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCacc > 8:126180/1‑148 (MQ=255) aagcaagGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCaccaaac < 8:193537/149‑1 (MQ=255) aagcaagGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCaccaaac > 1:52081/1‑149 (MQ=255) aagcaagGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGAC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCa > 4:307043/1‑143 (MQ=255) aagcaagGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGAC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCa < 3:307043/143‑1 (MQ=255) gcaagGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGCGTCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCaccaaac > 1:67226/1‑148 (MQ=255) agGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATg < 7:126180/149‑1 (MQ=255) gAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCCCCAAACCAATGCGGa > 6:241983/1‑149 (MQ=255) aaGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATg < 5:66734/144‑1 (MQ=255) aaGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATg > 6:66734/1‑144 (MQ=255) ggCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATGCGGATgg > 1:326196/1‑149 (MQ=255) cGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATGCGGATGGc > 6:216921/1‑148 (MQ=255) gTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATGCGGATGGCCAGGTCGa < 5:1582/149‑1 (MQ=255) | ATGCCCAGGCCTCCGAGGACCATCTCACGAATGGCCTCGCTGTTGTTGCTGGTGACGTTGCCTTTGATTGCAACCTCAAGTGCTTCGCCACGATGGGTGAAGTGCCAGCGGTCGTAATGCTCAAGCAAGGTGAAGGCGATGCAGTTGTGGCCTGCCAGTTCGGCGGGC‑TCGCGTGGCTGGCCATGGCGATCGAGATAGGCCGGTGCAGCATAGACTCGCCGTGTGCTGGT‑GCCCAGGGGCACGGCCACCAGCCCCTCGCTCTTCACCAAACCAATGCGGATGGCCAGGTCGA > NC_002947/3364519‑3364810 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |