| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4447126 = | 33 (0.630) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 7.7% | coding (439/1149 nt) | nicC | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase |
| ? | NC_002947 | 4447167 = | 40 (0.800) | coding (398/1149 nt) | nicC | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase | |||||
GCATGCTGTGCCAGGTTCACCCCGCGAATCAGTGCACGGTGCGCGACCCAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTAGGCAGCGCCG > NC_002947/4446978‑4447268 | attacctgtctcgcattccgctgggcgaggttgcccgccgcgaatactgcgctgcctacatcaccatccaccgttgcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaatagatc > 6:83126‑M1/149‑149 (MQ=255)attacctgtcgcgcattccgctgggcgagtttgcccgccgcgaatacggcgctgcctacatcaccatccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaaaagatc > 8:299250‑M1/149‑149 (MQ=255) tacctgtcgcgcattccgctgggcgagtttgcccgccgcgaatacggcgctgcctacatcaccatccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaaaagatcgt < 3:179355‑M1/3‑1 (MQ=255) cctgtcgcgcattccgctgggcgagtttgcccgccgcgaatacggcgctgcctacatcaccatccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaaaagatcgtc < 8:90996‑M1/4‑1 (MQ=255) ttCACCCCGCGAATCAGTGCACGGTGCGCGACCCAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAg < 5:84318/149‑1 (MQ=255) aTCAGTGCACGTGGCGCGACCCAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTc < 8:303105/149‑1 (MQ=255) aTCAGTGCACGGTGCGCGACCCAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTc < 5:290464/149‑1 (MQ=255) gTGCACGGTGCGCGACCCAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCt < 4:86482/149‑1 (MQ=255) ccgccgcgaatacggcgctgcctacatcaccatccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaaaagatcgt < 6:125982‑M1/3‑1 (MQ=255) ccgccgcgaatacggcgctgcctacatcaccatccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaaaagatcgt > 5:125982‑M1/115‑117 (MQ=255) gcgACCCAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGAt > 2:267008/1‑149 (MQ=255) cccAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCGAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCttt > 4:142619/1‑149 (MQ=255) gcgctgcctacatcaccatccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttctgcaagcgcctggaaaagatCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTc > 6:258850‑M1/101‑149 (MQ=255) cAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTc > 5:320146/1‑149 (MQ=255) aGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTg > 8:190003/1‑149 (MQ=255) taTCGGAGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGCTCTTCGAGTGGATGCCGTCTGCCCCGATGACGATGTCGGCCAGGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGTACTTGGTCTCCTTCGTCGACGATCTTTTCGATGCGCTTg < 2:288874/147‑1 (MQ=255) aTCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGcc > 4:179355/1‑149 (MQ=255) tCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCg < 8:164479/149‑1 (MQ=255) cgcTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCTAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGt < 3:142619/149‑1 (MQ=255) tccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaaaagatCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTcgacga < 8:24752‑M1/42‑1 (MQ=255) tccaccgtggcgacctgcacgccctgcagatcgaggccatccagccgggcaccgtgcacttcggcaagcgcctggaaaagatCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTcgacga > 7:24752‑M1/83‑124 (MQ=255) cccccAGCATCTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTg < 5:85375/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTTGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGccc < 3:139526/149‑1 (MQ=255) ccAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCTACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGccc > 2:68962/1‑149 (MQ=255) ccAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGccc > 3:241778/1‑149 (MQ=255) ctTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATg > 8:188407/1‑149 (MQ=255) ttCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAg < 6:126728/114‑1 (MQ=255) aCGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCAGGATGGCCt > 8:234172/1‑149 (MQ=255) ggATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCAGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTc > 4:104072/1‑148 (MQ=255) tCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATc > 7:262313/1‑149 (MQ=255) cGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGc < 2:61759/148‑1 (MQ=255) gATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGGTCTGCAGGGCGt > 7:97132/1‑149 (MQ=255) ggacccGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGTTGCCGTCGGCGAAGTCAAGGCTCACTTGGTCAACCTGGTCGACGATCTTTTCCATGCGCTTGACGAAGTGCACTGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCACGCCCTGCAGATCga < 6:219769/146‑2 (MQ=255) cccGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCAc > 1:146238/1‑149 (MQ=255) gATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGt < 7:234172/149‑1 (MQ=255) tGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGGCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTg < 2:113051/149‑1 (MQ=255) gCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATg > 7:90996/1‑147 (MQ=255) gCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTa < 4:241778/149‑1 (MQ=255) ccACTGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCAGTTTGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCTTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTAg < 2:156407/149‑1 (MQ=255) cACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTAgg > 6:141372/1‑149 (MQ=255) cGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTAGGCa < 6:320146/149‑1 (MQ=255) gggTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTACCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTAGGCAGCGCCg < 1:267008/149‑1 (MQ=255) ggTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTAGGCAGCGCCg > 4:1112/1‑148 (MQ=255) | GCATGCTGTGCCAGGTTCACCCCGCGAATCAGTGCACGGTGCGCGACCCAGCCGCTGTAGATCGGCGCTTCAGCCCCCAGCAACTCTTCACGGATCTTCGAGTGGATGCCGTCGGCCCCGATGACGATGTCGGCCACGGTGTGGGTGCCGTCGGCGAAGTCCAGGCGCACTTGGTCACCTTCGTCGACGATCTTTTCCAGGCGCTTGCCGAAGTGCACGGTGCCCGGCTGGATGGCCTCGATCTGCAGGGCGTGCAGGTCGCCACGGTGGATGGTGATGTAGGCAGCGCCG > NC_002947/4446978‑4447268 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |