New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5164208 | 76 (1.460) | 4 (0.080) | 4/258 | NT | 5.3% | coding (3672/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
? | NC_002947 | = 5164246 | 69 (1.370) | coding (3634/3906 nt) | hrpA | ATP‑dependent helicase HrpA |
GATATTCTTCCAGCCACCAGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTC > NC_002947/5164063‑5164354 | gATATTCTTCCAGCCACCAGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGa < 5:18321/147‑1 (MQ=255) gATATTCTTCCAGCCACCAGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGa < 2:140189/147‑1 (MQ=255) ttcCAGCCACCAGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTtctc > 4:104684/1‑147 (MQ=255) cAGCCACCAGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGgc < 2:183524/149‑1 (MQ=255) accaGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACTGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGa < 5:14360/141‑1 (MQ=255) accaGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACTGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGa > 6:14360/1‑141 (MQ=255) caGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTc < 5:222001/149‑1 (MQ=255) aGCGGTAGACGGTCAGTTGCTCTTCGCGGTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGGCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCGGCTCCACAGCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCa < 2:310864/149‑1 (MQ=255) gCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCaa < 4:189200/149‑1 (MQ=255) gCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCaa > 4:313122/1‑149 (MQ=255) acccGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGcc > 2:148196/4‑149 (MQ=255) cacGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCt > 1:74495/1‑149 (MQ=255) cacGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCt > 7:131065/1‑149 (MQ=255) acGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCtt > 1:230483/1‑149 (MQ=255) ggTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCtt > 2:180283/1‑147 (MQ=255) ggTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGa < 4:296399/149‑1 (MQ=255) gTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAg < 8:131065/149‑1 (MQ=255) tCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAgg > 5:278319/1‑149 (MQ=255) aGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGt > 6:127014/1‑148 (MQ=255) tCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGcgg < 4:258036‑M2/149‑4 (MQ=255) aTCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCTCCCACAGGTTGGCCAATTCCCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGagtttctcaaggcggttgaattgcgcctcgagaaactcggc < 1:104058‑M1/147‑42 (MQ=255) tCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCaa < 1:148196/149‑1 (MQ=255) gcTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTcc < 3:305170/149‑1 (MQ=255) cTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGcgttacctcaaggcggttgaattgcgcctcgagaaactcggctcgcaag < 5:131944‑M1/149‑50 (MQ=255) cTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACAGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCt < 7:57949/149‑1 (MQ=255) cTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGcgttacctcaaggcggttgaattgcgcctcgagaaactcggctcgcaa < 4:41074‑M1/143‑49 (MQ=255) cTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGcgttacctcaaggcggttgaattgcgcctcgagaaactcggctcgcaa > 3:41074‑M1/1‑95 (MQ=255) cTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAAc < 2:230483/149‑1 (MQ=255) cTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAAc < 3:163829/149‑1 (MQ=255) cTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAAc < 3:267374/149‑1 (MQ=255) ttCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTGCTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAAc > 5:26870/1‑148 (MQ=255) ttCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAAcc > 3:10117/1‑149 (MQ=255) cTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACcaca < 4:10117/149‑1 (MQ=255) tGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCacac > 1:175712/1‑149 (MQ=255) gggCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACAcc > 3:174710/1‑149 (MQ=255) gCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGaa > 2:273220/1‑136 (MQ=255) gCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGaa < 1:273220/136‑1 (MQ=255) gCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAAc > 6:16319/1‑137 (MQ=255) gCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAAc < 5:16319/137‑1 (MQ=255) gCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGc > 5:237761/1‑149 (MQ=255) gTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGttt > 1:58416/1‑149 (MQ=255) gTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGttt > 6:117696/1‑149 (MQ=255) gTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGtt < 3:139820/148‑1 (MQ=255) tCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTc < 6:278319/149‑1 (MQ=255) ggCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCt > 2:22244/1‑125 (MQ=255) ggCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCt < 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gCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGaa < 5:239505/149‑1 (MQ=255) cTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGc > 3:251646/1‑149 (MQ=255) ttGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGcc > 8:136427/1‑149 (MQ=255) gTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCg > 7:255727/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCggg < 4:174710/148‑1 (MQ=255) 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ttGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGcc < 2:74495/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGcc > 3:24190/1‑149 (MQ=255) gCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAg < 3:104684/149‑1 (MQ=255) ccAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAgc < 7:136427/149‑1 (MQ=255) ccAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAgc < 3:313122/149‑1 (MQ=255) 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acacCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCg > 3:128565/1‑149 (MQ=255) acCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGtt < 3:258036/149‑1 (MQ=255) ggTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGt < 4:24190/149‑1 (MQ=255) gTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGt > 7:218820/1‑140 (MQ=255) gTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGt < 8:218820/140‑1 (MQ=255) ttCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGCAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCAc > 6:16096/1‑149 (MQ=255) ttCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCAc > 7:99/1‑149 (MQ=255) cTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGcggctcgcaagtacagaaggaccgggtgtggagcggcgaattggccaacctgtgggcgcagtacaaggcccgtgccgacaagcatgcccaggaaggcaag < 5:131944‑M2/149‑101 (MQ=255) cTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTgg > 5:199401/1‑149 (MQ=255) ttGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGcggctcgcaagtacagaaggaccgggtgtggagcggcgaattggccaacctgtgggcgcagtacaaggcccgtgccgacaagcatgcccaggaag < 4:41074‑M2/143‑96 (MQ=255) ttGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGcggctcgcaagtacagaaggaccgggtgtggagcggcgaattggccaacctgtgggcgcagtacaaggcccgtgccgacaagcatgcccaggaag > 3:41074‑M2/1‑48 (MQ=255) gCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTAGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGCGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCt > 3:140805/1‑148 (MQ=255) cGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCt > 7:123407/1‑147 (MQ=255) gAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTAAGGTAACACGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAg > 3:135947/1‑149 (MQ=255) aGCCGATTTTCTCGAGGAGCAATTCAACGGCCTTTAGGTAACGCTGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAgg < 4:251646/149‑1 (MQ=255) gCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGA‑AACTcggctcgcaagtacagaaggaccgggtgtggagcggggaattggccaacctgtgggagcagtacaaggcccgtgccgacaagcatgcccaggaaggcaagcgcgat < 1:104058‑M2/147‑107 (MQ=255) ccGcgttacctcaaggcggttgaattgcgcctcgagaaactcggctcgcaagtacagaaggaccgggtgtggagcggcgaattggccaacctgtgggcgcagtacaaggcccgtgccgacaagcatgcccaggaaggcaagcgcgatga < 4:258036‑M1/149‑147 (MQ=255) | GATATTCTTCCAGCCACCAGCGGTACACGGTCAGTTGCTCATCGCGCTTGCCTTCCTGGGCATGCTTGTCGGCACGGGCCTTGTACTGCGCCCACAGGTTGGCCAATTCGCCGCTCCACACCCGGTCCTTCTGTACTTGCGAGCCGAGTTTCTCGAGGCGCAATTCAACCGCCTTGAGGTAACGCGGCAACTCCTTGAACCACACCCCAGGCGTTTCGCGTACGAAGCCCGGGTACACCAGGTTGCCTAGCTGCTGCTTGATGTCGTTCAGTGCCACCGCTTGGCTCAGGTC > NC_002947/5164063‑5164354 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |