| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5385515 | 71 (1.360) | 4 (0.080) | 4/258 | NT | 5.2% | coding (246/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 5385542 | 78 (1.550) | coding (273/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase | |||||
ACCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACT > NC_002947/5385369‑5385661 | acCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCAt > 1:305036/1‑149 (MQ=255)acCCTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCAt > 3:263094/1‑149 (MQ=255) ccTGCGCCACAACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATg > 4:94412/1‑148 (MQ=255) acaACGTCTCGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTAcgcccgc > 4:21147/1‑149 (MQ=255) cGGACCTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGaa > 8:7103/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTgg > 4:58972/1‑141 (MQ=255) ccTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTgg < 3:58972/141‑1 (MQ=255) ccTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGc < 4:180247/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGGCATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTg > 1:126657/1‑147 (MQ=255) cATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCATTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCAc < 8:171057/149‑1 (MQ=255) cGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCAcgcg > 8:293516/1‑149 (MQ=255) cccTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGCAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCCCCGGCATGTACGCCCGCCGGGGCGAAGTGCAGGCCGCAcgcg > 6:323614/1‑147 (MQ=255) cTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAgc > 6:247585/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGcggcgg > 4:90217/1‑149 (MQ=255) cAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCctgcacttcgccacggcgggcgtacatgccggtga < 2:20951‑M1/137‑36 (MQ=255) cAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCctgcacttcgccacggcgggcgtacatgccggtga > 1:20951‑M1/1‑102 (MQ=255) gcgcGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGccc < 3:94412/149‑1 (MQ=255) gTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATgg > 1:26894/1‑149 (MQ=255) tGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGc < 7:293516/149‑1 (MQ=255) 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aacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGtt < 6:189785/149‑1 (MQ=255) caTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATc > 5:99767/1‑142 (MQ=255) caTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATc < 6:99767/142‑1 (MQ=255) aTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCAc > 7:92743/1‑149 (MQ=255) tGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCAcc < 2:305036/149‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |