| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5385515 | 71 (1.360) | 4 (0.080) | 4/258 | NT | 5.2% | coding (246/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase |
| ? | NC_002947 | = 5385542 | 78 (1.550) | coding (273/1146 nt) | lldD | L‑lactate dehydrogenase | |||||
CATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACTCAAGGACCGCGGCTTCATGCGCAATGCC > NC_002947/5385401‑5385689 | cATCGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCATTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCAc < 8:171057/149‑1 (MQ=255) cGCCCTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCAcgcg > 8:293516/1‑149 (MQ=255) cccTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGCAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCCCCGGCATGTACGCCCGCCGGGGCGAAGTGCAGGCCGCAcgcg > 6:323614/1‑147 (MQ=255) cTGCGCCAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAgc > 6:247585/1‑149 (MQ=255) ccAGCGCGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGcggcgg > 4:90217/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGccc < 3:94412/149‑1 (MQ=255) gTGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATgg > 1:26894/1‑149 (MQ=255) tGCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGc < 7:293516/149‑1 (MQ=255) gCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATgg > 1:251660/1‑147 (MQ=255) gCTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATgg < 2:251660/147‑1 (MQ=255) cTGAACAACATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCAt > 3:88768/1‑149 (MQ=255) aacaacATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATccc > 4:7752/1‑149 (MQ=255) aacaacATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATccc > 6:71415/1‑149 (MQ=255) aacaacATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATccc > 4:107324/1‑149 (MQ=255) aacaacATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATccc > 4:3295/1‑149 (MQ=255) aacaacATGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATc < 5:247585/147‑1 (MQ=255) caacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGt > 4:226103/1‑149 (MQ=255) caacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGt > 7:54263/1‑149 (MQ=255) aacaTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGtt < 6:189785/149‑1 (MQ=255) caTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATc > 5:99767/1‑142 (MQ=255) caTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATc < 6:99767/142‑1 (MQ=255) aTGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCAc > 7:92743/1‑149 (MQ=255) tGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCAcc < 2:305036/149‑1 (MQ=255) tGTCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCAcc < 7:7103/149‑1 (MQ=255) tCCGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCAt < 3:3295/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCAt < 3:7752/148‑1 (MQ=255) cGAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGt > 3:179948/1‑149 (MQ=255) gAGCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCAGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTc > 3:165991/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGa > 3:81999/1‑149 (MQ=255) gCTCAGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGa < 3:203867/149‑1 (MQ=255) aGCCTGGAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACtgt > 1:9245/1‑149 (MQ=255) gAAACCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGgt < 2:26894/149‑1 (MQ=255) aaCCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGgtgt > 3:270983/1‑149 (MQ=255) aCCAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGtgtg > 8:203185/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGcc < 4:263212/149‑1 (MQ=255) cTGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGAt < 3:21147/149‑1 (MQ=255) tGTTCGACGAAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATc > 8:48474/1‑149 (MQ=255) gacgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCgaag > 1:206115/1‑148 (MQ=255) acgaAACCCTGAGCTTGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACTCGCAGAGGCGGCCCATGTCATCCCGTTCACCATg < 3:103314/119‑1 (MQ=255) acgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCgaagaa < 2:206115/149‑1 (MQ=255) acgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACAGTGTCGGTGTGCCCGATCgaag > 8:266560/1‑147 (MQ=255) acgaAACCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCAAGTACGCCAGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATg > 4:103314/1‑119 (MQ=255) aacggtGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTgg < 7:55534/144‑1 (MQ=255) aCCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGc < 4:270983/149‑1 (MQ=255) aCCCTGAGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGc < 5:31622/149‑1 (MQ=255) aGCATGCCGGTGGCCTTGGCCCCGGTCGGCCTCACCGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGa < 6:203962/112‑1 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> 6:180133/1‑141 (MQ=255) cGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCt < 5:180133/141‑1 (MQ=255) cGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTAc > 3:88788/1‑149 (MQ=255) cGGCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTAc < 3:199081/149‑1 (MQ=255) ggCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGgccggtgaggccgaccggggccaaggccaccggcatgctcagggtttcgtcgaacagcttg < 4:130355‑M2/91‑62 (MQ=255) ggCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGgccggtgaggccgaccggggccaaggccaccggcatgctcagggtttcgtcgaacagcttg > 3:130355‑M2/1‑30 (MQ=255) gCATGTACGCCCGCCGTGGCGAAGTGCAGGCCGCACGCGCAGCGGCGGCCCATGGCATCCCGTTCACCATGTCGACTGTGTCGGTGTGCCCGATCGAAGAAGTGGCACCCGCCATCAACCGGCCGATGTGGTTCCAGCTGTATGTACt > 1:305480/1‑148 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |