New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5874873 | 55 (1.060) | 7 (0.140) | 4/258 | NT | 12.7% | coding (1298/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
? | NC_002947 | = 5874924 | 43 (0.850) | coding (1247/1515 nt) | ilvA‑II | threonine deaminase |
CTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGTTCGGTCAGTTGCTGCACCAGC > NC_002947/5874727‑5875019 | cTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGc > 8:247325/1‑149 (MQ=255) ggCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCggg < 8:227220/149‑1 (MQ=255) tGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGaa < 2:218132/149‑1 (MQ=255) tGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGaa < 6:255982/149‑1 (MQ=255) gTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAgcgc < 3:129466/149‑1 (MQ=255) gTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAgcg > 7:27402/1‑148 (MQ=255) cctccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCAcc < 6:230061/149‑1 (MQ=255) ctccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGCGGGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATACGAAGCGCGGCAc > 1:248705/1‑148 (MQ=255) tccGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCTGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCAt > 4:272886/1‑149 (MQ=255) ggCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCTGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtc < 3:272886/149‑1 (MQ=255) gCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtc < 1:61002/142‑1 (MQ=255) gCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtc > 2:61002/1‑142 (MQ=255) cAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAGTTGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCt < 1:235731/148‑1 (MQ=255) cAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCt < 6:159863/147‑1 (MQ=255) aGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGc < 5:131893/149‑1 (MQ=255) ccccGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaat > 1:79712‑M1/1‑107 (MQ=255) ccccGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCCGCACCATTTCGTCGCTGGCAc > 3:191077/1‑149 (MQ=255) ccccGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtcgt < 4:154068/140‑1 (MQ=255) ccccGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtcgt > 3:154068/1‑140 (MQ=255) ccccGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCAc > 8:139502/1‑149 (MQ=255) gCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑AGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGc > 5:136645/1‑149 (MQ=255) caccacGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattcccc > 2:1773‑M1/1‑101 (MQ=255) caccacGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattcccc > 2:7107‑M1/1‑101 (MQ=255) accacGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGa < 4:310656/149‑1 (MQ=255) cacGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGt > 7:25276/1‑149 (MQ=255) gcgcCCGTCAGCCTCGCCATGGTTGA‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGTAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCactcggccggtgccagcgacgaaattgtgctgcgcttcgaattccccgcgcggc < 7:292449‑M1/149‑55 (MQ=255) gcgcCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTggc < 5:148728‑M2/149‑4 (MQ=255) gcCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattccccgagcggcca < 1:7107‑M1/149‑57 (MQ=255) gcCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattccccgagcggcca < 1:1773‑M1/149‑57 (MQ=255) gcCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattcccagagcggcca < 2:79712‑M1/149‑57 (MQ=255) gcCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGgccg > 3:172991/1‑149 (MQ=255) gTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGa < 8:25276/149‑1 (MQ=255) tCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGAc > 2:173790/1‑149 (MQ=255) gcCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGAc < 7:156003/149‑1 (MQ=255) cATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtcgtcg > 8:178990/1‑113 (MQ=255) cATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTtcgtcg < 7:178990/113‑1 (MQ=255) cATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTgg > 2:77413‑M2/1‑129 (MQ=255) cATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTgg < 1:77413‑M2/131‑3 (MQ=255) tGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAat < 2:248705/149‑1 (MQ=255) c‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCg > 1:116802/1‑114 (MQ=255) c‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCg < 2:116802/114‑1 (MQ=255) tAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCtt < 4:172991/149‑1 (MQ=255) ggAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGgccgcc < 5:144995/121‑1 (MQ=255) ggAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGgccgcc > 6:144995/1‑121 (MQ=255) gAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGcc > 7:101537/1‑148 (MQ=255) 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ccAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTc < 7:247325/148‑1 (MQ=255) gcgcCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGAt < 6:148728/149‑1 (MQ=255) gcccgcccAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCg < 7:72893/149‑1 (MQ=255) ccAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAAcc > 5:80537/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAAcc > 5:75818/1‑149 (MQ=255) 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gAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGtt < 1:111812/149‑1 (MQ=255) cgTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGATTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGTTCg < 4:191077/148‑1 (MQ=255) gAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCAGCCGACCATATGACGAATATGCAGGTTGGCCAATTCCTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGTTCGGt > 2:238191/1‑147 (MQ=255) aCAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGTTCGGTCAGt < 1:110060/149‑1 (MQ=255) aG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCAGACCATATGACGAATATGAAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGTTCGGTCAGtt > 8:197661/1‑148 (MQ=255) g‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGTCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGTTCGGTCAGTtgc < 7:139502/149‑1 (MQ=255) tGGCCGCTCTGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggc < 2:79712‑M2/149‑94 (MQ=255) tGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggc < 1:7107‑M2/149‑94 (MQ=255) tGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggc < 1:1773‑M2/149‑94 (MQ=255) gCCactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattccccgagcggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatggcgcggctgacgggcgc < 5:148728‑M1/149‑147 (MQ=255) gCCGCGCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACAATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTggccaggggcactgttcaacttactcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactacctcaaccatggcgaggctgacgggcgc < 7:292449‑M2/149‑96 (MQ=255) ccactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattccccgagcggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatg > 2:77413‑M1/1‑2 (MQ=255) ccactcggccggtgccagcgacgaaatggtgctgcgcttcgaattccccgagcggccaggggcactgttcaacttcctcaacaagctgggcgggcgctggaacatctcgatgttccactaccgcaaccatg < 1:77413‑M1/131‑130 (MQ=255) | CTGCCGGCACCAGGTGACGTTCGTCCTCCGGCACCTGCAGCCCCGCCACCACGCGCCCGTCAGCCGCGCCATGGTTGC‑GGTAGTGGAACATCGAGATGTTCCAGCGCCCGCCCAGCTTGTTGAGGAAGTTGAACAG‑TGCCCCTGGCCGCTCGGGGAATTCGAAGCGCAGCACCATTTCGTCGCTGGCACCGGCCGAGTGGCCGCCGACCATATGACGAATATGCAGCTTGGCCAATTCGTTGTCGGTCAGATCGGTAACCGGGAAGCCCTGTTCGGTCAGTTGCTGCACCAGC > NC_002947/5874727‑5875019 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |