| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 6175589 | 70 (1.340) | 5 (0.100) | 5/258 | NT | 6.8% | coding (1008/1377 nt) | atpD | ATP synthase subunit beta |
| ? | NC_002947 | = 6175633 | 69 (1.370) | coding (964/1377 nt) | atpD | ATP synthase subunit beta | |||||
GGCTTCGGACAGTTCGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAA > NC_002947/6175445‑6175736 | ggCTTCGGACAGTTCGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGt < 7:276685/148‑1 (MQ=255) gACAGTTCGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGAc > 4:94587/1‑149 (MQ=255) ttCGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCcgtgacatcgcctccc > 5:271591‑M1/1‑133 (MQ=255) ttCGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCAGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCTACCGCTg > 8:6258/1‑149 (MQ=255) tCGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTC‑TTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTggg > 6:165697/1‑149 (MQ=255) cGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTgg < 2:270310/148‑1 (MQ=255) aTACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGt < 7:51565/145‑1 (MQ=255) aTACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGt > 8:51565/1‑145 (MQ=255) aTACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGAt < 5:6754/149‑1 (MQ=255) aTACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGAt < 4:181035/149‑1 (MQ=255) aTACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCGCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCTGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGAt < 1:61659/149‑1 (MQ=255) cAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTTGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCa < 1:66911/149‑1 (MQ=255) cAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATAcc > 6:244571/1‑147 (MQ=255) tCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAg < 5:44113/149‑1 (MQ=255) cGCAATCAAGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCACAACATCCTGCACGCCACGACCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAgg < 8:212049/149‑1 (MQ=255) cAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGc > 5:91435/1‑148 (MQ=255) tgTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCa > 7:217179/1‑149 (MQ=255) tCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCTCGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACg < 5:278141/149‑1 (MQ=255) tctgcAGCGCTATAAAGAGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACgg > 2:220806/5‑149 (MQ=255) cTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGg < 7:35181‑M2/148‑2 (MQ=255) cTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGg > 3:201215‑M2/1‑147 (MQ=255) ttCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGgga < 1:110677‑M2/149‑4 (MQ=255) cAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGggac > 8:35181‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGggac > 4:106110‑M2/1‑144 (MQ=255) cAGCGCTATAAAGAGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACa < 1:220806/149‑1 (MQ=255) ctctTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGaa > 6:302840/1‑149 (MQ=255) ctctTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGaa < 7:241043/149‑1 (MQ=255) ctTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGGac > 1:254679/1‑148 (MQ=255) ctTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAac > 1:85238/1‑148 (MQ=255) tttATAGCGCTGCATAAGATACTGAACGCCACTAGCGGTATCGTAGTGCTCGTTGCCTATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCcgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgac < 6:271591‑M1/147‑54 (MQ=255) tataGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCcgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgactt < 4:231095‑M1/147‑56 (MQ=255) tataGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAacgacg > 2:120433/1‑149 (MQ=255) tataGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAacgacg > 2:115891/1‑149 (MQ=255) taGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGGACGACgg < 2:254679/148‑1 (MQ=255) gctcTGCAGAACATACTGACCGCCACGTGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGCCCTGCTGGCGCGATGTCGAGGCCAGGGGGTCGACCGCGGGGTAGATCCCCAGGTAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACgggg < 6:91435/145‑3 (MQ=255) cAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTc < 5:302840/147‑1 (MQ=255) cAGAACATACTGAACGCCAAGAGCGGTCTCGTAGTTCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGAGCGAAGTAGAGTCCAGTGGTTCGACCTCTGGGTAGATAACCAGGGAGGCGATGTCACGGTACAGAACGACGGGTGCGtac > 1:258731/1‑146 (MQ=255) aataaCATACTGAAATCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCAGATCCCGTTCGGGTCACTCAGGCGCGAAGTAGAGTCAACTGGTTCGACCGAAGGGTACATCCACAGGTACTAGATCTCACCGTCCAGAACGACGGTGCCGTcc > 8:158833/4‑148 (MQ=255) gAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAg > 4:73835/1‑149 (MQ=255) aaCATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGt < 6:84502/149‑1 (MQ=255) aaCATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGAGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGa > 2:111108/1‑130 (MQ=255) aaCATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGAGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGa < 1:111108/130‑1 (MQ=255) aCATACTTAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGATCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCCGATGGCGCGAAGGCGAGTCAAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGTGATGCTATGTCACGGGACAGAACGACGGTTGCGTCAAAGt < 2:258731/148‑1 (MQ=255) cATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTgg < 2:246354/149‑1 (MQ=255) cATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTgg < 3:294777/149‑1 (MQ=255) aCTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGg < 4:142010‑M2/119‑2 (MQ=255) aCTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGg > 3:142010‑M2/1‑118 (MQ=255) aCTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGc > 5:142586/1‑148 (MQ=255) cTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCg > 5:274620/1‑148 (MQ=255) tGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGt > 4:49343/1‑142 (MQ=255) tGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGt < 3:49343/142‑1 (MQ=255) tGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCg > 4:54190/1‑147 (MQ=255) tGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGAAACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTACAAGTGGGCg > 6:29912/1‑147 (MQ=255) aaCGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAg < 8:217179/148‑1 (MQ=255) aaCGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAg < 1:278785/148‑1 (MQ=255) aCGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTAGTTGCCGATCACGTTCGGGTACAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCCATGTCACGGCACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTg > 6:265195/1‑140 (MQ=255) aCGCCACGAGCGGTATCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGATGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGTGTAGATACCCAGGGAGTCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTg < 5:265195/140‑1 (MQ=255) cACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTc > 4:39796/1‑149 (MQ=255) cGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGc < 2:110677/149‑1 (MQ=255) tctcGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCcgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactg > 5:24183‑M1/1‑56 (MQ=255) tctcGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCcgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactg < 6:24183‑M1/101‑46 (MQ=255) gTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGt < 6:174414/116‑1 (MQ=255) gTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGt > 5:174414/1‑116 (MQ=255) gTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACgg < 6:274620/147‑1 (MQ=255) tAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGggtc > 2:91004/1‑149 (MQ=255) tAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGggtc < 3:54190/149‑1 (MQ=255) tAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGggtc < 5:165697/149‑1 (MQ=255) tAGTGCTCGTTGCCGAACACGTTCGGCTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAACGAGGTCGATGGCGACgggac > 1:12560/1‑147 (MQ=255) aGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGggtcg > 7:262903/1‑149 (MQ=255) gTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAg < 6:142586/148‑1 (MQ=255) gATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCg > 8:159314/1‑149 (MQ=255) gATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCg < 1:120433/149‑1 (MQ=255) gATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCg < 1:115891/149‑1 (MQ=255) gTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAg < 3:144061/146‑1 (MQ=255) gTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAg > 4:144061/1‑146 (MQ=255) gTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTa > 5:91113/1‑149 (MQ=255) ggTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGtat < 3:94587/149‑1 (MQ=255) ggTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGta > 8:302467/1‑148 (MQ=255) gCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGc > 5:156393/1‑133 (MQ=255) gCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGc < 6:156393/133‑1 (MQ=255) gCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGcc > 5:180926/1‑149 (MQ=255) gcgcGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTa > 5:42870/1‑149 (MQ=255) cgAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACgg > 4:95191/1‑149 (MQ=255) aaGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagtatgttctgcagcgctata < 4:231095‑M2/147‑93 (MQ=255) gTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgataggcaacgagcactacgataccgctagtggcgttcagtatcttatgcagcgctataaa < 6:271591‑M2/147‑95 (MQ=255) gTCCcgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagtatgttctgcagcgctataaagagctg > 4:106110‑M1/1‑4 (MQ=255) gTCCcgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagtatgttctgcagcgctataaagagctg > 8:35181‑M1/1‑4 (MQ=255) gTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACgg > 4:167856/1‑140 (MQ=255) gTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACgg < 3:167856/140‑1 (MQ=255) gTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATc > 2:240001/1‑148 (MQ=255) tCCcgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagtatgttctgcagcgctataaagagctgaa < 1:110677‑M1/149‑147 (MQ=255) ccgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagtatgttctgcagcgctataaagagctgaag > 3:201215‑M1/1‑1 (MQ=255) ccgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagtatgttctgcagcgctataaagagctgaag < 7:35181‑M1/148‑148 (MQ=255) ccgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagt < 4:142010‑M1/119‑119 (MQ=255) ccgtgacatcgcctccctgggtatctacccagcggtcgacccactggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgagaccgctcgtggcgttcagt > 3:142010‑M1/1‑1 (MQ=255) cAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgaga < 6:24183‑M2/101‑57 (MQ=255) cAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGggactcgacttcgcgccagctggacccgaacgtgatcggcaacgagcactacgaga > 5:24183‑M2/1‑45 (MQ=255) cAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGGCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGaa < 5:244571/148‑1 (MQ=255) | GGCTTCGGACAGTTCGTCCATACCCAGGATCGCAATGATGTCCTTCAGCTCTTTATAGCGCTGCAGAACATACTGAACGCCACGAGCGGTCTCGTAGTGCTCGTTGCCGATCACGTTCGGGTCCAGCTGGCGCGAAGTCGAGTCCAGTGGGTCGACCGCTGGGTAGATACCCAGGGAGGCGATGTCACGGGACAGAACGACGGTGGCGTCCAAGTGGGCGAAGGTGGTCGCTGGCGACGGGTCGGTCAAGTCGTCCGCAGGTACGTATACGGCCTGTACGGAGGTGATCGAA > NC_002947/6175445‑6175736 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |