New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 379962 | 46 (0.880) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 8.1% | coding (259/1107 nt) | gbcB | glycine‑betaine dioxygenase subunit |
? | NC_002947 | = 380031 | 47 (0.940) | coding (328/1107 nt) | gbcB | glycine‑betaine dioxygenase subunit |
AGATCGAAGGCAAGCCCGTGATGCGGTCCTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTACGACACCAATGCCAACGTCGACATGGTGTTCG > NC_002947/379885‑380178 | agaTCGAAGGCAAGCCCGTGATGCGGTCCTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcg > 4:282262‑M2/1‑147 (MQ=255) tCGAAGGCAAGCCCGTGATGCGGTCCTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcggtg < 2:238366‑M2/149‑6 (MQ=255) aaGGCAAGCCCGTGATGCGGTCCTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcg > 6:248003‑M2/1‑141 (MQ=255) aaGGCAAGCCCGTGATGCGGTCCTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcg < 5:248003‑M2/143‑3 (MQ=255) cGTGATGCGGTCCTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTgg < 1:238366/149‑1 (MQ=255) cTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAAc < 8:126599/148‑1 (MQ=255) cacCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcggt < 7:249114‑M2/120‑5 (MQ=255) cacCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcggt > 8:249114‑M2/1‑116 (MQ=255) cATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATc > 4:30840/1‑148 (MQ=255) aTCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGa > 6:249651/1‑149 (MQ=255) tctcCAGTTCGCCGTCTGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGAc > 8:170649/1‑149 (MQ=255) gttctgCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTccc < 7:18582/144‑1 (MQ=255) gTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCct > 2:315327/1‑149 (MQ=255) cGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCctgct > 5:95084/1‑149 (MQ=255) gCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCctgctg < 3:135036/149‑1 (MQ=255) ccGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACCCCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTccc > 8:18582/1‑143 (MQ=255) cGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTgg > 5:281398/1‑148 (MQ=255) tCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTAGCaa < 5:249651/149‑1 (MQ=255) gTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGt < 8:67649/149‑1 (MQ=255) tGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcggtgatcgagaagctgtagggcactgacggcgaactggagatggtgtaggaccg < 4:141936‑M2/148‑56 (MQ=255) cTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTg > 1:246792/1‑148 (MQ=255) ttCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTc > 3:304041/1‑108 (MQ=255) ttCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTc < 4:304041/108‑1 (MQ=255) ttCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTc > 3:247741/1‑149 (MQ=255) ctcGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTc < 1:315327/147‑1 (MQ=255) gATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGggc < 6:95084/148‑1 (MQ=255) tCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcggtgatcgagaagctgtagggcactgacggcgaactggagatggtgtaggaccgcatcacgggcttgccttc < 6:318063‑M2/148‑74 (MQ=255) tCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGt < 5:109626/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTa < 3:30840/148‑1 (MQ=255) aaGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTAt > 1:245323/1‑149 (MQ=255) aaGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTAt > 5:21067/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTa < 2:246792/149‑1 (MQ=255) gcgTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTAcc > 8:45868/1‑149 (MQ=255) cGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTg < 4:155932/149‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGAt < 7:45868/149‑1 (MQ=255) gtgtCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATg < 6:21067/147‑1 (MQ=255) tCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGgcgcg > 4:48977/1‑149 (MQ=255) gAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTg < 2:206595/97‑1 (MQ=255) gAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTg > 1:206595/1‑97 (MQ=255) gAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGgcgcgc < 7:170649/148‑1 (MQ=255) cTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcggtgatcgagaagctgtagggcactgacggcgaactggagatggtgtaggaccgcatcacgggcttgccttcgatctccagctccagggtaacgaactgccctggcttga > 3:141936‑M2/1‑38 (MQ=255) cTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCt > 2:122742/1‑148 (MQ=255) tGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCaa < 1:201492/85‑1 (MQ=255) tGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCaa > 2:201492/1‑85 (MQ=255) tGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTAc > 1:59778/1‑149 (MQ=255) tGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTAc > 3:34471/1‑149 (MQ=255) cATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCcggtgatcgagaagctgtagggcactgacggcgaactggagatggtgtaggaccgcatcacgggcttgccttcgatctccagctccagggtaacgaactgccctggcttgaagaaga > 5:318063‑M2/1‑31 (MQ=255) cATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTAc < 4:34471/147‑1 (MQ=255) cacCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTa < 1:253894/141‑1 (MQ=255) cacCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTa > 2:253894/1‑141 (MQ=255) cacCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCAATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTACGACAcc > 4:151161/1‑148 (MQ=255) acCATGTACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTgg < 5:234070/135‑1 (MQ=255) acCATGAACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTgg > 6:234070/1‑135 (MQ=255) cACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTACGACACCAATGCCaa < 3:48977/149‑1 (MQ=255) cgcCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTAGGACACCAATGCCAACGTCGACa < 2:245323/149‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCGGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTACGACACCAATGCCAACGTCGACATg < 2:112978/149‑1 (MQ=255) gAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTACGACACCAATGCCAACGTCGACATGgt < 5:317282/149‑1 (MQ=255) gCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTACGACACCAATGCCAACGTCGACATGGTGTTCg > 8:25182/1‑149 (MQ=255) | AGATCGAAGGCAAGCCCGTGATGCGGTCCTACACCATCTCCAGTTCGCCGTCAGTGCCCTACAGCTTCTCGATCACCGTCAAGCGCGTGCCGGGTGGCCTGGTGTCGAACTTCCTGCATGACACCATGCACGAAGGCGCCGAGCTGCCGGTGCACGGCCCGGTGGGGCTGTTCAACGCCATCGACTTCCCTGCTGGCAAGGTGCTGTACCTGTCGGGCGGCGTCGGTATTACCCCAGTGATGTCGATGGCGCGCTGGTTCTACGACACCAATGCCAACGTCGACATGGTGTTCG > NC_002947/379885‑380178 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |