New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1312668 = | 52 (1.000) | 4 (0.080) | 4/248 | NT | 7.1% | coding (1989/2847 nt) | rapA | RNA polymerase‑associated protein RapA |
? | NC_002947 | 1312776 = | 56 (1.150) | coding (1881/2847 nt) | rapA | RNA polymerase‑associated protein RapA |
GCCGGAATTGAGTTCCAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGATCCGGTCAAG > NC_002947/1312629‑1312919 | gccgGAATTGAGTTCCAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGt > 3:166514/1‑149 (MQ=255) gccgGAATTGAGTTCCAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGt > 5:14437/1‑149 (MQ=255) gccgGAATTGAGTTCCAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGt > 3:279112/1‑149 (MQ=255) cctcaacacctgccccaccggcaatgccctgcagcacCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGt > 2:161563‑M1/38‑147 (MQ=255) gAATTGAGTTCCAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGtgctg < 7:213263/149‑1 (MQ=255) ttGAGTTCCAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAg < 8:39944/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTg > 2:179542/1‑149 (MQ=255) cagGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCgg < 7:222861/149‑1 (MQ=255) agGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGAGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTTCCGGt > 7:278656/1‑149 (MQ=255) gCGGTCACGGCGAGTGTTCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGGCACGAGTGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCTAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTgg < 7:189679/149‑1 (MQ=255) gCGGGCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTgg < 8:252695/149‑1 (MQ=255) tCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTgggg > 2:199681/1‑147 (MQ=255) aCGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAgg > 7:78922/1‑149 (MQ=255) ccAGTGTGCAGTTCGGATTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGACACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGtt > 8:174521/1‑149 (MQ=255) aGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGa < 7:240680/149‑1 (MQ=255) accagttcggcccacgcctgctgccgctgctcgaaggcggcgaaaacaaggcctgggataccctggtggccgacgcccgcagcgaacgcgaacgcctggaagccgaactgGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAgg > 2:161563‑M2/111‑147 (MQ=255) AGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGc < 6:141370‑M1/149‑1 (MQ=255) AGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGc < 6:151632‑M1/149‑1 (MQ=255) GTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCCGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCg < 6:261894‑M1/149‑1 (MQ=255) TTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGt < 5:30365‑M1/149‑1 (MQ=255) TTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGt < 7:67200‑M1/149‑1 (MQ=255) gttcggcccacgcctgctgccgctgctcgaaggcggcgaaaacaaggcctgggataccctggtggccgacgcccgcagcgaacgcgaacgcctggaagccgaactgGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCg > 2:237470‑M2/107‑149 (MQ=255) CGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGtt > 6:30365‑M1/1‑148 (MQ=255) cAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCtt < 6:222577/149‑1 (MQ=255) cAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCtt > 6:131846/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGCTACGCGTTCGAGCAGCGGCTGAAGGCGTGGGCCGAAGTGGTGATGCAGGGAATTCCCGTTGGGGAAGGGGTGGAGGAAGCCTTTGAcccgt > 1:93820/1‑147 (MQ=255) aGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTc > 5:8137/1‑149 (MQ=255) aGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTc > 1:298120/1‑149 (MQ=255) gcgttcgcgttcGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGt < 6:41280/149‑1 (MQ=255) cgttcgcgttcgCTGCGGTCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTg < 3:218755/149‑1 (MQ=255) tcgcgttcgcTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTa > 7:227860/1‑149 (MQ=255) ctgccgctgctcgaaggcggcgaaaacaaggcctgggataccctggtggccgacgcccgcagcgaacgcgaacgcctggaagccgaactgGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTgg < 1:237470‑M2/58‑1 (MQ=255) gcTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGa < 5:90127/149‑1 (MQ=255) cTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGaa < 2:172996/149‑1 (MQ=255) ctcgaaggcggcgaaaacaaggcctgggataccctggtggccgacgcccgcagcgaacgcgaacgcctggaagccgaactgGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTg < 1:161563‑M2/66‑1 (MQ=255) cGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCGTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAg < 4:166514/149‑1 (MQ=255) gCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGAGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGgcg < 3:181078/149‑1 (MQ=255) cGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGgcgc < 8:69683/149‑1 (MQ=255) ggCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCtt < 6:14437/149‑1 (MQ=255) tccaccaGTGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CTCCTTCGTGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTTCCTGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTTAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGTCGCTCTTg < 2:298120/148‑1 (MQ=255) gCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTg > 4:90645/1‑149 (MQ=255) accaGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCgg < 5:141370/149‑1 (MQ=255) gTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTc < 8:227860/149‑1 (MQ=255) gTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTc < 1:9205/149‑1 (MQ=255) cctggCCGTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGTAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACGACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTGCTGCa < 4:279112/146‑1 (MQ=255) ccTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTAc < 5:131846/149‑1 (MQ=255) cTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACg > 1:152465/1‑149 (MQ=255) ttGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGc > 8:101835/1‑141 (MQ=255) ttGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGc < 7:101835/141‑1 (MQ=255) ttttCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGAt < 1:199681/149‑1 (MQ=255) ctgctgc‑‑cgccTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGAt > 6:310833/6‑149 (MQ=255) cgc‑‑cgcCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACg < 5:312680/141‑1 (MQ=255) cgc‑‑cgcCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACg > 6:312680/1‑141 (MQ=255) gc‑‑cgccTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGc < 5:261894/148‑1 (MQ=255) gccTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACt < 7:174521/149‑1 (MQ=255) ccTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGAtgt < 5:83307/142‑1 (MQ=255) ccTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGAtgt > 6:83307/1‑142 (MQ=255) ttCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGa > 4:113750/1‑149 (MQ=255) gAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGAtgt > 1:209504/1‑137 (MQ=255) gAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGAtgt < 2:209504/137‑1 (MQ=255) agcagcGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAgt < 5:201297/149‑1 (MQ=255) cagcGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAgtgt < 3:90645/149‑1 (MQ=255) cGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAgtgt > 6:323867/1‑146 (MQ=255) cGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAgtgt < 5:323867/146‑1 (MQ=255) cagcagGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCggg > 7:202897/1‑106 (MQ=255) cagcagGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCggg < 8:202897/106‑1 (MQ=255) agcagGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTg > 2:264216/1‑149 (MQ=255) cagGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTATCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGc < 1:264216/149‑1 (MQ=255) gCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGa > 5:104368/1‑149 (MQ=255) gCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGa > 7:304870/1‑149 (MQ=255) gTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGATc > 4:124122/1‑149 (MQ=255) tGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGATcc < 3:113750/149‑1 (MQ=255) ccgaactgGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGATCCGGTc < 6:8137‑M2/141‑1 (MQ=255) aactgGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGATCCGGTCAAg > 2:243545‑M2/6‑149 (MQ=255) | GCCGGAATTGAGTTCCAGCAGGCGGTCACGGCCAGTGTGCAGTTCGGCTTCCAGGCGTTCGCGTTCGCTGCGGGCGTCGGCCACCAGGGTATCCCAGGCCTTGTTTTCGC‑‑CGCCTTCGAGCAGCGGCAGCAGGCGTGGGCCGAACTGGTGCTGCAGGGCATTGCCGGTGGGGCAGGTGTTGAGGAAGGCGTTGAGCCCTTCGTGGTACCACTGGAACAGGCGCTCTTGCGGGCTGTCCTGCAGGTACGGGATGTGCAACTGGATAGTGTGCTTCTGGCCGATCCGGTCAAG > NC_002947/1312629‑1312919 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |