New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2460351 = | 47 (0.900) | 5 (0.100) | 4/250 | NT | 10.7% | coding (453/480 nt) | PP_2153 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2460402 = | 39 (0.800) | coding (402/480 nt) | PP_2153 | hypothetical protein |
TTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATTTTCACTTTCACCCGGGTACCGG > NC_002947/2460254‑2460550 | ttCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGt > 2:141912/1‑149 (MQ=255) ctgcgcggcaaggtcacccattgcgaccctcgcccgaagggcggcttcgaggtcggtaccgagttcatcgacatgaccgacgcccaacgacaaCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTg > 5:57445‑M1/94‑147 (MQ=255) ggCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTg < 5:224259/148‑1 (MQ=255) gcgcCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTggg > 6:144948/1‑149 (MQ=255) ccGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTAGTTCAGTTCCAGCTGCTGTCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCATTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGt > 8:126147/1‑149 (MQ=255) gTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTc > 6:77084/1‑148 (MQ=255) gATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGAt < 1:141912/148‑1 (MQ=255) gttcgttcCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTAcc > 3:306092/1‑148 (MQ=255) ttcgttcCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGa > 7:234447/1‑149 (MQ=255) ttcCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGGTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGGCAGCAGTTGTCGTTCGGCGTCGGTCATGTCTATGACATCGGTACCGACCTc > 8:109985/1‑149 (MQ=255) ttCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAg > 7:136883/1‑149 (MQ=255) tCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGaa < 7:161603/147‑1 (MQ=255) tCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGaa < 7:157144/147‑1 (MQ=255) tCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGaa > 8:157144/1‑147 (MQ=255) tCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGaa > 8:161603/1‑147 (MQ=255) aaaTCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAgccg < 5:144948/149‑1 (MQ=255) ggAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAGCTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCg > 3:37407/1‑149 (MQ=255) gAAAAATTGGCCCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTCCCGCCCGCGAAGCCGCCCTCCgg > 2:227196/1‑149 (MQ=255) aaaaTTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCggg < 4:306092/148‑1 (MQ=255) tCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCg > 5:134581/1‑148 (MQ=255) ggaggCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAAt < 8:136883/149‑1 (MQ=255) gTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCt > 6:15458/1‑149 (MQ=255) tCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGCCCtt > 8:25702/1‑149 (MQ=255) gTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGc < 6:134581/149‑1 (MQ=255) tCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCcg > 2:241477/1‑149 (MQ=255) ttCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCgca < 7:126147/149‑1 (MQ=255) ccAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCgcag > 5:303640/1‑148 (MQ=255) caactgctggcccgatacatcctgcagcgccagcaacaacaacggcgccagcagTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTTCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCgcag > 5:57445‑M2/55‑147 (MQ=255) aGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGGCGCAATGGGTGACCTTGcc < 4:246859/140‑1 (MQ=255) gctgctGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCgcagcag > 7:16924/1‑148 (MQ=255) ctgctggcccgatacatcctgcagcgccagcaacaacaacggcgccagcagTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTc < 5:79537‑M2/69‑1 (MQ=255) ctgctggcccgatacatcctgcagcgccagcaacaacaacggcgccagcagTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTc > 6:79537‑M2/52‑120 (MQ=255) ctgctggcccgatacatcctgcagcgccagcaacaacaacggcgccagcagTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCgcagcag > 3:143360‑M2/52‑147 (MQ=255) GCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGt > 5:77084‑M1/1‑149 (MQ=255) GCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGACGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGt > 1:227196‑M1/1‑149 (MQ=255) gcCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTgg < 1:241477/149‑1 (MQ=255) gcCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTgg < 6:303640/149‑1 (MQ=255) ccgatacatcctgcagcgccagcaacaacaacggcgccagcagTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTgg < 4:143360‑M2/106‑1 (MQ=255) ccGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAgg < 2:113585/108‑1 (MQ=255) ccGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAgg > 1:113585/1‑108 (MQ=255) ttgttgttgCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGgcgc > 8:210695/1‑149 (MQ=255) gttgCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCgg > 5:30996/1‑148 (MQ=255) gcgcTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAg < 3:48314/147‑1 (MQ=255) cgcTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCAc > 6:79416/1‑149 (MQ=255) cTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCa < 7:109985/149‑1 (MQ=255) gATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATtttca > 6:319905/1‑149 (MQ=255) gATGTATCGGGCCAGAAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACTGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATtttca > 6:151036/1‑149 (MQ=255) tATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGATCTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATtttcacttt < 4:37407/149‑1 (MQ=255) aTCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGcgcgcg < 6:71554/126‑1 (MQ=255) aTCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGcgcgcg > 5:71554/1‑126 (MQ=255) gccagcagTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATTTTCACTTTCACCCg < 7:95908‑M2/141‑1 (MQ=255) ttGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATtttcac > 2:286583/1‑132 (MQ=255) ttGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATtttcac < 1:286583/132‑1 (MQ=255) ttGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATTTTCACTTTCACCCGGGTACCgg > 7:376/1‑149 (MQ=255) | TTCGCCCTTGGCGCCGCGATGGCCGTAGATCAGGGTCACGTTCGTTCCTTCAAATCAGGGAAAAATTGGCTCAGGAGGCGGGGTCGTTCAGTTCCAGCTGCTGGCGCCGTTGTTGTTGCTGGCGCTGCAGGATGTATCGGGCCAGCAGTTGTCGTTGGGCGTCGGTCATGTCGATGAACTCGGTACCGACCTCGAAGCCGCCCTCCGGGCGAGGGTCGCAATGGGTGACCTTGCCGCGCAGCAGCAGGCCGTGGGCGCGCGGCATCAGCACCATTTTCACTTTCACCCGGGTACCGG > NC_002947/2460254‑2460550 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |