New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2845382 = | 37 (0.710) | 4 (0.080) | 4/254 | NT | 10.3% | coding (367/1029 nt) | PP_2496 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | 2845422 = | 34 (0.680) | coding (327/1029 nt) | PP_2496 | hypothetical protein |
CCTGGTCGTTGCCCTTGAGTGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATGGCGTCCGACTTGAAGTGCACTGGGCTTTCCATGATCTGC > NC_002947/2845277‑2845569 | ggccatctgggcgcgatccactccttccccgagcagaaggtgctcttccgttcggacaccaagggaccgctgtcagtggtctcgcagcgctatcacaccgtgcagCCTCGGTCAGGTCACGTTAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGc > 1:180816‑M1/106‑149 (MQ=255) gTTGCCCTTGAGTGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGgtgt > 4:45780/1‑149 (MQ=255) gTTGCCCTTGAGTGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGAACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATCAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGgtgt > 8:302024/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGAGTGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGa < 4:240498/148‑1 (MQ=255) gTGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTg < 3:45780/148‑1 (MQ=255) tGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGc > 3:200611/1‑148 (MQ=255) tGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGc < 4:291607/148‑1 (MQ=255) gcgcCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGAc > 6:39168/1‑149 (MQ=255) cTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCa > 8:288719/1‑146 (MQ=255) cTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCa < 7:288719/146‑1 (MQ=255) aGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCg < 1:59132/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTg < 5:39168/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTgg > 6:119651/1‑149 (MQ=255) cccAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGc < 6:130602/119‑1 (MQ=255) cccAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGc > 5:130602/1‑119 (MQ=255) cAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGCCCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCgc > 4:240196/1‑148 (MQ=255) cAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCg > 5:311354/1‑148 (MQ=255) cTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACgg > 6:256735/1‑148 (MQ=255) aCCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCa > 3:227757/1‑149 (MQ=255) cGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTCTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCAcc > 7:49843/1‑149 (MQ=255) gCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCAcc > 7:226783/1‑148 (MQ=255) cAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAg < 4:227757/149‑1 (MQ=255) cGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAg < 7:18644/149‑1 (MQ=255) gTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTg < 5:119651/149‑1 (MQ=255) tCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCtt < 5:69908/128‑1 (MQ=255) tCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACAtt > 6:69908/1‑128 (MQ=255) tCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGt > 8:188642/1‑112 (MQ=255) tCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGt < 7:188642/112‑1 (MQ=255) gTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGcc < 6:311354/147‑1 (MQ=255) ccGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATg > 5:114135/1‑149 (MQ=255) ggAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGc < 4:200611/149‑1 (MQ=255) gcagcctcgggaagtactcgaattttaacgtgacctgaccgaggCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTCCCTTGGTGTCCGAACGGAAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGcc > 1:180816‑M2/45‑149 (MQ=255) aCCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGTCCGAt < 8:226783/149‑1 (MQ=255) cctcgggaagtactcgaattttatcgtgacctgaccgaggCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCgcgc < 4:260675‑M2/95‑1 (MQ=255) cctcgggaagtactcgaattttatcgtgacctgaccgaggCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCgcgc > 3:260675‑M2/41‑135 (MQ=255) CCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATg > 5:256735‑M1/1‑149 (MQ=255) CTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATgg < 8:190058‑M1/149‑1 (MQ=255) CTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATgg < 8:194990‑M1/149‑1 (MQ=255) gtagtactcgtattttatcgtgacctgaccgaggCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTTGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATGGCGTcc < 2:180816‑M2/115‑1 (MQ=255) aCGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATGGCGTCCGACTTg < 7:302024/148‑1 (MQ=255) aTAAAATTCGTGTCCTTCCCGAGGCGGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATGGCGTCCGACTTGAAGt < 6:55020/149‑1 (MQ=255) gAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGTAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATGGCGTCCGACTTGAAGTGCACTGGGc > 6:144700/1‑149 (MQ=255) gCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATGGCGTCCGACTTGAAGTGCACTGGGCTTTCCATGATCTGc < 6:114135‑M2/148‑1 (MQ=255) | CCTGGTCGTTGCCCTTGAGTGCAGCGCCCTGCCCAGTACGCGCCAGCGCCCAGAACTTGCGACCGCCCTTGAGCACGCCAGCGGTTTCCAGCTCGTAGCCGGAGACCTCGGTCAGGTCACGATAAAATTCGAGTACTTCCCGAGGCTGCACGGTGTGATAGCGCTGCGAGACCACTGACAGCGGTGCCTTGGTGTCCGAACGGTAGAGCACCTTCTGCTCGGGGAAGGAGTGGATCGCGCCCAGATGGCCGATGGCGTCCGACTTGAAGTGCACTGGGCTTTCCATGATCTGC > NC_002947/2845277‑2845569 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |