New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3010263 = | 46 (0.880) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 6.7% | intergenic (‑1169/‑499) | PP_2628/PP_2631 | ABC transporter ATP‑binding protein/cellulose biosynthesis protein BcsF/YhjT |
? | NC_002947 | 3010295 = | 41 (0.840) | intergenic (‑1201/‑467) | PP_2628/PP_2631 | ABC transporter ATP‑binding protein/cellulose biosynthesis protein BcsF/YhjT |
CTGCGTTATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCC > NC_002947/3010148‑3010443 | cTGCGTTATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCtt > 6:206276/1‑149 (MQ=255) cTGCGTTATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCtt > 4:143875/1‑149 (MQ=255) cGTTATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGc < 1:115060/148‑1 (MQ=255) gTTATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTg < 5:237025/149‑1 (MQ=255) gTTATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTg > 7:229815/1‑149 (MQ=255) cttATCAAGCCGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGGGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTGACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTg < 4:39264/148‑1 (MQ=255) ttATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTgg > 3:101794/1‑149 (MQ=255) tggacgatttcgccgttgcgcaccccgtgccacatgctttgcacggcatcggcgaacgcccgtggcgctaccaacccgcagatggccagcggccgcaggcgtgccagcaaGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTgg > 6:35122‑M1/111‑149 (MQ=255) tCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCGAGATCGTGCCGTTCGGTGGACAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCa > 1:252593/1‑149 (MQ=255) gACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCGAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCt < 4:16379/149‑1 (MQ=255) aCGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTg > 4:137060/1‑149 (MQ=255) cGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGc < 7:23514/149‑1 (MQ=255) ttGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCt > 7:269599/1‑149 (MQ=255) ctgctgGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTgg < 3:143875/148‑1 (MQ=255) ctgctgGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGc < 2:55752/149‑1 (MQ=255) gtgCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTg > 6:29589/1‑149 (MQ=255) ttccagccagATCGTGCCGTTCTGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATTGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCAACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTACGGGTTgg < 4:205365/147‑1 (MQ=255) tgCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCAGCGGCCGCAGGcgtgcc < 4:87003/140‑6 (MQ=255) tgCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCAGCGGCCGCAGGcgtgcc > 3:87003/1‑135 (MQ=255) cagccagATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAg > 6:197562/1‑149 (MQ=255) agccagATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAgc < 5:197562/149‑1 (MQ=255) gccagATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAgcg < 8:269599/149‑1 (MQ=255) agATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCa > 2:277435/1‑149 (MQ=255) tCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCGTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACgg < 3:314041/149‑1 (MQ=255) gTGCCGTTCGGG‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGc < 4:83537/149‑1 (MQ=255) tGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCg > 6:202523/1‑149 (MQ=255) ccGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGtt > 2:78608/1‑149 (MQ=255) ccGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGt < 5:199086/148‑1 (MQ=255) gT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGAt < 5:29589/149‑1 (MQ=255) cAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCg < 5:202523/149‑1 (MQ=255) ttGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGc > 7:67937/1‑148 (MQ=255) aCGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCa > 2:46960/1‑149 (MQ=255) gCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCAtg < 5:206276/149‑1 (MQ=255) gCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCAAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACATGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCAtg > 2:70847/1‑149 (MQ=255) gACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACg > 3:293511/1‑149 (MQ=255) tAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTgcg > 6:104314/1‑148 (MQ=255) ccAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGaaa > 7:31145/1‑149 (MQ=255) aGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATc > 7:233043/1‑149 (MQ=255) ttACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTcc < 1:277435/149‑1 (MQ=255) ccagcaaggcgtcgaagtcggttggcaggtgtcgacgccTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTcca > 6:35122‑M2/40‑149 (MQ=255) ggcgtcgaagtcggttggcaggtgtcgacgccTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATg < 1:172497‑M2/64‑1 (MQ=255) ggcgtcgaagtcggttggcaggtgtcgacgccTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATg > 2:172497‑M2/33‑96 (MQ=255) GTCGACACCTGCCTACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAATGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTg > 1:70847‑M1/1‑149 (MQ=255) GTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGCAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTg > 2:252593‑M1/1‑149 (MQ=255) GACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGgt > 1:46960‑M1/1‑148 (MQ=255) cacCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGtt < 4:293511/149‑1 (MQ=255) cacCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGGTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGtt < 4:101794/149‑1 (MQ=255) tGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGt > 3:310231/1‑149 (MQ=255) cAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGc < 4:51653/116‑1 (MQ=255) cAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGc > 3:51653/1‑116 (MQ=255) cAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCg > 4:139828/1‑149 (MQ=255) aCTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCgcct > 6:175362/1‑149 (MQ=255) cTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCgcctg < 8:233043/149‑1 (MQ=255) cgacgccTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCgcctggc < 8:67937‑M2/141‑1 (MQ=255) cgccTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGa > 4:221086‑M2/5‑149 (MQ=255) ttGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGAcccc > 7:136578/1‑149 (MQ=255) ttGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGAcccc > 3:298546/1‑149 (MQ=255) | CTGCGTTATCAAGACGAACAGTTGCTGCTGGCTTGTGGTGCCAGCCAGATCGTGCCGTTCGGT‑GCCAGCTTGTCACGCTTCCTGACCATGGTAGAGAGCATCCAGGGTTACGTCTGGCGTCGACACCTGCCAACCGACTTCGACGCCTTGCTGGCACGCCTGCGGCCGCTGGCCATCTGCGGGTTGGTAGCGCCACGGGCGTTCGCCGATGCCGTGCAAAGCATGTGGCACGGGGTGCGCAACGGCGAAATCGTCCACCAGTTGCTGGTGTTGCGTCCGGCGCCTGGCCTGACCCC > NC_002947/3010148‑3010443 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |