New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3479286 | 55 (1.060) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 7.1% | coding (1933/2496 nt) | PP_3090 | OmpA domain‑containing protein |
? | NC_002947 | = 3479308 | 52 (1.050) | coding (1911/2496 nt) | PP_3090 | OmpA domain‑containing protein |
AGGAAGGCGTTGTCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGGCGCGGTTGTCATGGGGCA > NC_002947/3479162‑3479453 | aGGAAGGCGTTGTCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGat > 5:115890‑M2/1‑147 (MQ=255) gAAGGCGTTGGCGAGGATGCGCGGGACCTCTGGCTCACGGATCGGGGCGCTATAGCACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTCGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGatgg > 3:215506‑M2/1‑145 (MQ=255) aaGGCGTTGTCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGatggc > 6:312678‑M2/1‑144 (MQ=255) gTTGGCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGt < 1:117996/149‑1 (MQ=255) gTCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTAc > 3:72736/1‑148 (MQ=255) gTCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTAc < 5:212772/148‑1 (MQ=255) gTCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTAc < 8:88558/148‑1 (MQ=255) gTCGAGGAAGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTAc < 5:191610/148‑1 (MQ=255) tCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTAc > 2:326404/1‑147 (MQ=255) gAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCag > 8:180882/1‑148 (MQ=255) cgcgGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCg < 5:140500/148‑1 (MQ=255) cgcgGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCg < 7:180882/148‑1 (MQ=255) cATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTg < 2:310466/148‑1 (MQ=255) aTCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTgcg > 2:202015/1‑149 (MQ=255) tCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTgcgc > 1:46237/1‑149 (MQ=255) tCTGGCTCACAGATCTAATCGCTATAAAACATGATCTAACGGCTGACATACAGGTAGTCCTAGTTGCCACCGGCCTCCCTGCCAGCGGCGGCCATGATCTTGACGGTATGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGAACCAGTAGTCCGGCAGGTgcg > 8:48543/1‑148 (MQ=255) cTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGTTCTGGCGGCTGTCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCTATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTga < 7:48543/149‑1 (MQ=255) cTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCtt > 1:290680/1‑147 (MQ=255) cTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCtt < 2:290680/147‑1 (MQ=255) tCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAg > 6:51605/1‑137 (MQ=255) aCGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTgaga > 6:31994/1‑148 (MQ=255) ggATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCtt < 2:314493/142‑1 (MQ=255) ggATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCtt > 1:314493/1‑142 (MQ=255) gATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCtt > 6:147303/1‑141 (MQ=255) gATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCtt < 5:147303/141‑1 (MQ=255) cTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGatggccg > 5:240146‑M2/1‑103 (MQ=255) cTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGatggccg < 6:240146‑M2/110‑8 (MQ=255) ggTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCggg > 3:121067/1‑149 (MQ=255) gTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGt > 4:261017/1‑149 (MQ=255) cTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCgg > 5:140654/1‑148 (MQ=255) cTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGc < 1:125476/149‑1 (MQ=255) cTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGGCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTGGAGAAACGCCGGGTCGGc < 7:4593/149‑1 (MQ=255) tataGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCa > 7:96727/1‑149 (MQ=255) cGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTcgc > 7:11440/1‑149 (MQ=255) cGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTcgc < 2:262602/149‑1 (MQ=255) tGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGgaga > 2:150563/1‑148 (MQ=255) gCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAg < 8:96727/149‑1 (MQ=255) aCAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAg < 8:211433/145‑1 (MQ=255) aCAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAg > 7:211433/1‑145 (MQ=255) aGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCAc < 8:11440/149‑1 (MQ=255) aGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCAc > 1:303733/1‑149 (MQ=255) gTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGCGAGGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCGTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCAc > 1:257123/1‑149 (MQ=255) gTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCAc < 1:144016/147‑1 (MQ=255) gTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCAc > 2:144016/1‑147 (MQ=255) gTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTaa < 3:261017/148‑1 (MQ=255) gTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAg > 2:233026/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAgtgt > 6:296366/1‑149 (MQ=255) tGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTc > 3:292799/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGgccgc > 2:56035/1‑149 (MQ=255) cTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTc < 5:31994/149‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTcc < 6:140654/147‑1 (MQ=255) gCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCg < 4:121067/148‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGatggccgccgctggcagcgaggccggtggcaaccaggactacctgtatgccagccgccagatcacgttctatagcgaccagatccgtgagccagatgtaccgcgcatcctc < 6:108984‑M2/149‑112 (MQ=255) tGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGaaa > 6:133377/1‑149 (MQ=255) gcggcggcgATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGc < 8:290947/149‑1 (MQ=255) gcggcgGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGc < 4:72736/149‑1 (MQ=255) gcggcCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGatggccgccgctggcagcgaggccggtggcaaccaggactacctgtatgccagccgccagatcacgttctatagcgaccagatccgtgagccagatgtaccgcgcatcct > 3:51164‑M2/1‑30 (MQ=255) gcggcCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGatggccgccgctggcagcgaggccggtggcaaccaggactacctgtatgccagccgccagatcacgttctatagcgaccagatccgtgagccagatgtaccgcgcatcct < 4:51164‑M2/140‑111 (MQ=255) aTGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTg > 6:108107/1‑149 (MQ=255) tGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTgg < 1:202015/149‑1 (MQ=255) tGCTCTTGCCGGGCTGGC‑‑GGGCGATGGCGGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTgg < 2:257123/149‑1 (MQ=255) gCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGgcgc < 2:303733/146‑1 (MQ=255) gCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGGCGCgg < 5:108107/148‑1 (MQ=255) ccGGTCTGGC‑‑GGGCGatggccgccgctggcagcgaggccggtggcaaccaggactacctgtatgccagccgccagatcacgttctatagcgaccagatccgtgagccagatgtaccgcgcatcctcgacaacgccttcctgatgtcca > 5:108984‑M2/1‑15 (MQ=255) ccGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGACTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCCGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGGCGCGGtt > 8:161595/1‑149 (MQ=255) cTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGGCGCGGTTGTCAt > 5:310998/1‑149 (MQ=255) gc‑‑gggcgATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGGCGCGGTGGTCATggg > 4:240285/1‑149 (MQ=255) ggcgATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGGCGCGGTTGTCATGGGGCa < 6:310998/149‑1 (MQ=255) | AGGAAGGCGTTGTCGAGGATGCGCGGTACATCTGGCTCACGGATCTGGTCGCTATAGAACGTGATCTGGCGGCTGGCATACAGGTAGTCCTGGTTGCCACCGGCCTCGCTGCCAGCGGCGGCCATGCTCTTGCCGGTCTGGC‑‑GGGCGATGGCCGGGTACCAGTAGTCCGGCAGGTGCGCCTTGAGAAACGCCGGGTCGGCATGCTCGCGCTGGCCCGGAGAAAGCATCACGTAAGTGTCCAGGGCCGCCTTTCCGAAATTGGCGATCGACTGGGCGCGGTTGTCATGGGGCA > NC_002947/3479162‑3479453 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |