New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3637858 | 48 (0.920) | 4 (0.080) | 4/252 | NT | 8.3% | coding (438/588 nt) | PP_3204 | hypothetical protein |
? | NC_002947 | = 3637894 | 43 (0.870) | coding (474/588 nt) | PP_3204 | hypothetical protein |
AGTGCCGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGA > NC_002947/3637754‑3638039 | agTGCCGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAgcg > 3:61963/1‑149 (MQ=255) ccGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAgcgc < 4:317821/146‑1 (MQ=255) ccGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAgcgc > 3:317821/1‑146 (MQ=255) cGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTa < 2:25950/149‑1 (MQ=255) cGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTa < 4:61963/149‑1 (MQ=255) cGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTa < 4:28028/149‑1 (MQ=255) gggCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTaccaac > 1:43013/1‑148 (MQ=255) aaGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGcc > 8:103178/1‑149 (MQ=255) cGATTCGAAGCACATGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGa < 7:131313/149‑1 (MQ=255) gAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAAcc < 5:56049/149‑1 (MQ=255) gAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAAACCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCCGTACCAACCATGCCTGGAGCAAcc > 3:140311/1‑149 (MQ=255) acaAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGc < 8:286364/149‑1 (MQ=255) gCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTTCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAAc < 4:60201/149‑1 (MQ=255) gCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAAc < 4:99331/149‑1 (MQ=255) gCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAACAACCGCAGCGaa > 7:255630/1‑148 (MQ=255) aTGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCCACCATCCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGAt > 8:104080/1‑149 (MQ=255) cgcaccgAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCg < 7:69544/149‑1 (MQ=255) ccgAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATg < 3:132582/149‑1 (MQ=255) cgAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATgg > 4:300759/1‑149 (MQ=255) aaaCCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTc < 6:310709/149‑1 (MQ=255) aaCCGTGGACTACGGCATGGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGGTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTc < 4:140311/148‑1 (MQ=255) ccTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCa > 3:270817/1‑149 (MQ=255) cTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCctgc < 3:286755/149‑1 (MQ=255) cGGCATCGTTAACGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGAACCAACCATCCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGCATGGTATTCATcctcctc > 2:73156/1‑147 (MQ=255) gCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGAt > 5:14835/1‑149 (MQ=255) aTCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTgg > 8:112792/1‑99 (MQ=255) aTCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTgg < 7:112792/99‑1 (MQ=255) aCCGTGGGCGAGGTCTGGCGGGGGCTGGACGTTGGCGTAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCGTGGAGCAACCGCAGCGATCAGATGTCCGGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGtt < 1:73156/148‑1 (MQ=255) aCCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGtt < 6:40701/148‑1 (MQ=255) ccGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTAt > 5:166559/1‑149 (MQ=255) cGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCa > 5:229743/1‑128 (MQ=255) cGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCa < 6:229743/128‑1 (MQ=255) aGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGcc < 2:43013/149‑1 (MQ=255) gTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACt < 7:103178/149‑1 (MQ=255) tCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTc < 4:270817/149‑1 (MQ=255) tggctggTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTc > 7:15593/1‑147 (MQ=255) ggctggTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGgtccagcaccagccagacctcgccctcggtaacgatgccgtagtccagggtttcggtgcggtgcatcagcttgt > 1:323872‑M2/1‑50 (MQ=255) ggctggTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGgtccagcaccagccagacctcgccctcggtaacgatgccgtagtccagggtttcggtgcggtgcatcagcttgt < 2:323872‑M2/124‑75 (MQ=255) tggTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAg > 1:132441/1‑149 (MQ=255) tGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGgtccagcaccagccagacctcgccctcggtaacgatgccgtagtccagggtttcggtgcggtgcatcagcttgtgcttcgaatcggctttgcccgtgccggcact < 4:154518‑M2/149‑106 (MQ=255) aTGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATg > 6:90760/1‑148 (MQ=255) aTGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTACCATGa < 2:132441/149‑1 (MQ=255) gAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTc < 6:166559/149‑1 (MQ=255) aCCTCAAACGAGGCGACATCGTGgtccagcaccagccagacctcgccctcggtaacgatgccgtagtccagggtttcggtgcggtgcatcagcttgtgcttcgaatcggctttgcccgtgccggcactcgcctcgccgatctcggcgaa > 3:154518‑M2/1‑23 (MQ=255) cTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAgc > 6:268944/1‑124 (MQ=255) cTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAgc < 5:268944/124‑1 (MQ=255) cTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTc > 5:97774/1‑149 (MQ=255) aaaCGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAACAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTcga < 8:255630/148‑1 (MQ=255) aCGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTcgacga < 5:90760/149‑1 (MQ=255) aCGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTcgacga > 7:92532/1‑149 (MQ=255) gTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGa < 3:300759/148‑1 (MQ=255) | AGTGCCGGCACGGGCAAAGCCGATTCGAAGCACAAGCTGATGCACCGCACCGAAACCCTGGACTACGGCATCGTTACCGAGGGCGAGGTCTGGCTGGTGCTGGACGATGGCGAAGTCCACCTCAAACGAGGCGACATCGTGGTCCAGCGCGGTACCAACCATGCCTGGAGCAACCGCAGCGAACAGATGGCCCGGATGGTCTTCATCCTGCTGGATGGGCGTTATGCCGAGACACTCAAGGAGCTGCTGCCATGAAGCTCGCCACGTTCGACGACGGCAGCCGCGA > NC_002947/3637754‑3638039 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |