New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3825683 | 27 (0.520) | 4 (0.080) | 4/256 | NT | 12.5% | coding (363/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
? | NC_002947 | = 3825702 | 30 (0.600) | coding (344/1020 nt) | ptxS | 2‑ketogluconate utilization repressor |
TCCACATTCAGCTCGGGCAATTGGCGGTCGACCAGCACCATGGGGATGTCACGCTGCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTT > NC_002947/3825555‑3825850 | tCCACATTCAGCTCGGGCAATTGGCGGTCGACCAGCACCATGGGGATGTCACGCTGCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCTGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTc > 8:115958‑M2/1‑148 (MQ=255) aTGGGGATGTCACGCTGCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCt < 4:239064/149‑1 (MQ=255) ggggATGTCACGCTGCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGcaca > 6:13288/1‑137 (MQ=255) ggggATGTCACGCTGCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGcaca < 5:13288/137‑1 (MQ=255) aCGCTGCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCt > 4:5772/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAAcc < 1:174139/139‑1 (MQ=255) gCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAAcc > 2:174139/1‑139 (MQ=255) gAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCg < 1:210825/148‑1 (MQ=255) cagcTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTCTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGttt < 4:107804/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCa > 1:40874/1‑149 (MQ=255) ggggTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGt < 2:101318/149‑1 (MQ=255) cgaagggCTGATCGTGAACACGCTCGGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAg > 4:208827/6‑130 (MQ=255) cgaagggCTGATCGTGAACACGCTCGGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAg < 3:208827/125‑1 (MQ=255) gCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACgg > 1:83648/1‑149 (MQ=255) ccGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACAccacca > 1:126342/1‑100 (MQ=255) ccGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACAccacca < 2:126342/100‑1 (MQ=255) cGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGcc < 3:5772/149‑1 (MQ=255) gCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACt > 7:200035/1‑149 (MQ=255) tgtTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGaa < 7:257124/149‑1 (MQ=255) ttCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGaa > 4:130134/1‑147 (MQ=255) tCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAg > 8:304883/1‑149 (MQ=255) gCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAgg < 2:83648/149‑1 (MQ=255) cTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCa < 4:47784/129‑1 (MQ=255) gTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGCTTGGAGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGATTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGTGTTGAGGATATCGGcca > 5:316585/1‑149 (MQ=255) tAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTcctgcagagctacaacgtcgaagggctgatcgtgaacacgctcggccaccaccccggcgagctgctcaacctgcagcgtgacatccccatggtgctggtcgaccgccaattgcccgag < 2:156866‑M2/149‑119 (MQ=255) ctctGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTcctgcagagctacaacgtcgaagggctgatcgtgaacacgctcggccaccaccccggcgagctgctcaacctgcagcgtgacatccccatggtgctggtcgaccgccaattgcccgagct < 2:136216‑M2/148‑121 (MQ=255) tctGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTcctgcagagctacaacgtcgaagggctgatcgtgaacacgctcggccaccaccccggcgagctgctcaacctgca < 5:308196‑M2/102‑76 (MQ=255) tctGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTcctgcagagctacaacgtcgaagggctgatcgtgaacacgctcggccaccaccccggcgagctgctcaacctgca > 6:308196‑M2/1‑27 (MQ=255) tGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGcc > 7:25602/1‑149 (MQ=255) aGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGAt > 1:274322/1‑149 (MQ=255) gggCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGAt > 3:24571/1‑148 (MQ=255) ggCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGAt > 5:265866/1‑147 (MQ=255) caGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGATCAGTcgcg > 3:238559/1‑149 (MQ=255) aGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGt < 4:24571/149‑1 (MQ=255) gACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCcg > 5:91333/1‑149 (MQ=255) aCGCTcctgcagagctacaacgtcgaagggctgatcgtgaacacgctcggccaccaccccggcgagctgctcaacctgcagcgtgacatccccatggtgctggtcgaccgccaattgcccgagctgaatgtggaccttgtcggcctgga > 1:136216‑M2/1‑5 (MQ=255) gCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAgg > 7:90225/1‑107 (MQ=255) gCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAgg < 8:90225/107‑1 (MQ=255) tCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGTCTGTAACCATGCTGACGGCAGGAGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTTAAAAGGGGATGAGGAAATCTGCCACCAGAATGACGAAAAGTCGCGTCTGGCCGCGCtt > 8:5794/1‑149 (MQ=255) | TCCACATTCAGCTCGGGCAATTGGCGGTCGACCAGCACCATGGGGATGTCACGCTGCAGGTTGAGCAGCTCGCCGGGGTGGTGGCCGAGCGTGTTCACGATCAGCCCTTCGACGTTGTAGCTCTGCAGGGCCACCAGGTGGTGACGCTCCTGCTCGTCGTCGCGGTTGGTGTTGCACACCACCAGGCTGTAACCATGCTGACGGCAGGCGGTTTCCACGCCGTGCATCACGGCCACTGAATAGGGGTTGAGGATATCGGCCACCAGCATGCCGATCAGTCGCGTCTGGCCGCGCTT > NC_002947/3825555‑3825850 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |