| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4999641 = | 36 (0.690) | 3 (0.060) | 3/254 | NT | 6.9% | coding (494/1383 nt) | PP_4407 | gamma‑aminobutyrate transporter |
| ? | NC_002947 | 4999711 = | 47 (0.950) | coding (564/1383 nt) | PP_4407 | gamma‑aminobutyrate transporter | |||||
CTCGGTGCGTTCGTTTGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAAGAGCG > NC_002947/4999564‑4999856 | cTCGGTGTGTTCGTTTGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCAt < 3:35790/148‑1 (MQ=255) tCGGTGCGTTCGTTTGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCTACCTCACCGCCCATGa > 7:287084/1‑149 (MQ=255) gctgccgcccagggagaaaatcaccacgataacgccggccatcaccggtgacaggccgttgggcatgaagccgtcaTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGa > 3:307836‑M1/77‑149 (MQ=255) ctgccgcccagggagaaaatcaccacgataacgccggccatcaccggtgacaggccgttgggcatgaagccgtcaTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGAc > 3:112731‑M1/76‑149 (MQ=255) tGCGTTCGTTTGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGc < 5:35421/149‑1 (MQ=255) gttcgttTGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCtt > 1:127129/1‑148 (MQ=255) cgttTGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCAt < 6:235831/148‑1 (MQ=255) tttGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGcc > 2:148159/1‑149 (MQ=255) ccGAAGTAGAGTATTGGCTGGTCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAAc > 8:294113/1‑149 (MQ=255) aaGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGc < 2:127129/149‑1 (MQ=255) ttGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCgg < 2:285292/149‑1 (MQ=255) cgATGAAGGGCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGc < 4:60912/149‑1 (MQ=255) aTGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGt < 1:148159/149‑1 (MQ=255) tGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGt > 7:34705/1‑148 (MQ=255) gCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCgtggt < 7:294113/149‑1 (MQ=255) caTCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCCTGGTGAgtt > 7:244756/1‑149 (MQ=255) aTCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGAttt > 2:89092/1‑148 (MQ=255) ttATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTcc > 2:125815/1‑149 (MQ=255) aTCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTccc < 3:135110/148‑1 (MQ=255) ttCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGCAGGGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGGTATCGTGGTGATTTTCTCCCTgg > 1:93065/1‑149 (MQ=255) cATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTggg < 7:190162/147‑1 (MQ=255) ctgctgGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCa < 1:178913/148‑1 (MQ=255) gtcatgggcggtgaggttgatcaggcctggggcgggaatatcactgtgcaggccgagcaggatcgagacgcccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAg > 3:112731‑M2/75‑149 (MQ=255) tcatgggcggtgaggttgatcaggcctggggcgggaatatcactgtgcaggccgagcaggatcgagacgcccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGc > 3:307836‑M2/74‑149 (MQ=255) GCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAAtt < 1:156928‑M1/149‑1 (MQ=255) GTCTCGTTCCTGCTCGGCCTGGACAGTGATATTCCCGGCCCAGGC‑GTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACGGGTGATGGGCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGc > 8:244756‑M1/1‑149 (MQ=255) tctcGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGcc < 2:127047/149‑1 (MQ=255) tcGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGc > 6:110838/1‑149 (MQ=255) aTCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCt‑gt > 3:51285/1‑149 (MQ=255) cTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTgg < 6:151138/148‑1 (MQ=255) gatcaggcctggggcgggaatatcactgtgcaggccgagcaggatcgagacgcccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTgg < 4:112731‑M2/92‑1 (MQ=255) cGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCgg < 1:125815/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCACACTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCgg < 8:287084/148‑1 (MQ=255) cTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGa < 4:51285/149‑1 (MQ=255) acaGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGCTGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAAt > 3:68508/1‑147 (MQ=255) acaGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAAt > 2:289673/1‑147 (MQ=255) acaGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAAt > 4:89206/1‑147 (MQ=255) caGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCag < 2:156928/149‑1 (MQ=255) aGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCaga < 8:292912/149‑1 (MQ=255) gTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCAGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCa > 6:194378/1‑146 (MQ=255) tGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCTCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCaga < 2:93065/147‑1 (MQ=255) atTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGAt < 3:43992/92‑1 (MQ=255) atTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGAt > 4:43992/1‑92 (MQ=255) atTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAAccc > 4:126635/1‑149 (MQ=255) tCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTggg < 6:38190/102‑1 (MQ=255) tCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTggg > 5:38190/1‑102 (MQ=255) cccGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAAccccc > 2:26553/1‑148 (MQ=255) ccGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGa > 1:296632/1‑149 (MQ=255) ccGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGa > 4:176844/1‑149 (MQ=255) ccccAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGa > 2:188851/1‑146 (MQ=255) c‑cTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAAc > 6:113243/1‑133 (MQ=255) c‑cTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAAc > 6:118347/1‑133 (MQ=255) c‑cTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAAc < 5:118347/133‑1 (MQ=255) c‑cTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAAc < 5:113243/133‑1 (MQ=255) aTCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGGCGCGGGTGAATCAGAGAAACCCCGCAAGAACGTGAtgag > 3:232273/1‑146 (MQ=255) aaCCTCACCGCCCAAGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGCTGAGTCAGAGCACCCACGACAGAACGTGATCcgcgc > 1:282168/1‑149 (MQ=255) cTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGAt > 1:213645/1‑149 (MQ=255) gacgcccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCaa < 4:307836‑M2/141‑1 (MQ=255) aCCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCaa < 1:289673/149‑1 (MQ=255) ccGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAag < 8:34705/149‑1 (MQ=255) cgcccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAaga < 3:89206‑M2/143‑1 (MQ=255) gcccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAagag > 2:24989‑M2/6‑149 (MQ=255) cccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGTCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAAGAGc < 2:213645‑M2/145‑1 (MQ=255) ccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCTCGTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAAGAGc < 1:89092‑M2/146‑1 (MQ=255) ccaTGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAAGAGCg < 3:176844‑M2/146‑1 (MQ=255) | CTCGGTGCGTTCGTTTGCCGAAGTAGAGTATTGGCTGGCCGCGATGAAGGTCGCCACCATCCTTATCTTCATGCTGCTGGGCGTCTCGATCCTGCTCGGCCTGCACAGTGATATTCCCGCCCCAGGC‑CTGATCAACCTCACCGCCCATGACGGCTTCATGCCCAACGGCCTGTCACCGGTGATGGCCGGCGTTATCGTGGTGATTTTCTCCCTGGGCGGCAGCGAAATTGCCGCT‑GTGGCCGCGGGTGAATCAGAGAACCCCCGACAGAACGTGATCCGCGCGATCAAGAGCG > NC_002947/4999564‑4999856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |