New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 6059891 | 39 (0.750) | 6 (0.120) | 6/254 | NT | 14.2% | coding (931/1404 nt) | PP_5311 | signal transduction protein |
? | NC_002947 | = 6059929 | 35 (0.700) | coding (969/1404 nt) | PP_5311 | signal transduction protein |
GACCTTGAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGT > NC_002947/6059782‑6060073 | gACCTTGAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACACCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTAc > 5:311324‑M2/1‑148 (MQ=255) cTTGAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTActgc < 1:60521‑M2/149‑5 (MQ=255) gCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCGAACCCGAAAATCAAAGCCAAAACCCGCCCCATGCAACGTGAATAACCCCCCCAGGCCGGCCTCCCATACATGGCCGGGCTAATGcaca > 1:92922/1‑148 (MQ=255) gACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACct < 3:50092/149‑1 (MQ=255) cAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CAGCGATCAACGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCCGGCTCACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctgct > 2:92860/1‑149 (MQ=255) aaCCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGCGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctgctg > 8:187332/1‑149 (MQ=255) cagcagGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGgc > 1:202855/1‑149 (MQ=255) cACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctg < 8:98509/133‑1 (MQ=255) cACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACctg > 7:98509/1‑133 (MQ=255) aactgcatACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACgtgt < 2:202855/142‑1 (MQ=255) tcaaTAGATGTACACCG‑CATCGATCATCGAAGGCCTCACGCGCGCCATGCGTCGTGAAGAACGCCACGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCAGAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTtct < 8:81354/148‑1 (MQ=255) aTCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGc < 1:123753/149‑1 (MQ=255) acCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTAACTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTgccg > 8:150085/1‑149 (MQ=255) cg‑ccgcGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTgccgc > 6:571/1‑148 (MQ=255) g‑ccgcGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCa > 3:65170/1‑149 (MQ=255) ccgcGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCAc < 3:82493/149‑1 (MQ=255) atcatcGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGa < 2:92922/149‑1 (MQ=255) tcatcGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAg < 4:65170/149‑1 (MQ=255) gAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCccg < 6:10895/111‑1 (MQ=255) gAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCccg > 5:10895/1‑111 (MQ=255) aaGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGCCCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAAc > 7:241211/1‑149 (MQ=255) aaGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAAc < 1:53541/149‑1 (MQ=255) ggCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAAccc < 2:60521/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCAt < 1:146150/147‑1 (MQ=255) ccGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGa < 3:260739/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTActgcacgaggcatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatctattgttgccagtattgagtataatgcttctgttggtctttgggtaggc < 2:98196‑M2/149‑103 (MQ=255) tCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTActgcacgaggaaatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatcgattgttgccagtagggcgtggcctgctgcggttggtctttgggtaggc < 1:252180‑M2/149‑104 (MQ=255) tCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTAtg > 4:103233/1‑149 (MQ=255) tCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTAtg > 4:270330/1‑149 (MQ=255) gtgtAGAACGCCCCTAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGTCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCAAGTGTTCACGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTAtgtg < 7:290239/149‑1 (MQ=255) tGCTGAACGCCCCGAGGCGGGGCTGACCTCCCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCTCATTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTgg < 1:92860/149‑1 (MQ=255) gCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTActgcacgaggcatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatcgattgttgccagtagggcgtggcctgctgcggttg < 1:321163‑M2/130‑89 (MQ=255) gCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTActgcacgaggcatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatcgattgttgccagtagggcgtggcctgctgcggttg > 2:321163‑M2/1‑42 (MQ=255) cccGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAacac < 5:306100/147‑1 (MQ=255) cccGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAacac > 6:306100/1‑147 (MQ=255) ccGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGc < 5:192712/141‑1 (MQ=255) ccGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGc > 6:192712/1‑141 (MQ=255) ccGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTg > 1:113647/1‑149 (MQ=255) gAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCAGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCAGCCGCAATTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGTTCAACCCGCATTTGAACCACACATATGTGGAGCAACACTTGCt > 8:135334/1‑149 (MQ=255) ccGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTggg > 4:210963/1‑148 (MQ=255) ccGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGc < 7:187332/149‑1 (MQ=255) acctacgtGGCCGGGCTActtcacgaggcatggcgggggtgaggccttcgatgatcgcggctgtgtagatcgattgttgccagtagggcgtggcctgctgcggttggtctttgggttgggtcaaggtcttgcccagcgccaggcccagg > 2:252180‑M2/1‑18 (MQ=255) ggCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGaa > 7:249911/1‑145 (MQ=255) gCCGGGCTActgcacgaggcatggcgcgggtgaggccttcgatgatcgcggcggtgtagatcgattgttgccagtagggcgtttcctgctgcggttggtctttgggtaggctcaaggtcttgcccagcgccaggcccagggccaggt > 1:98196‑M2/1‑9 (MQ=255) ggCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGt < 3:270330/149‑1 (MQ=255) | GACCTTGAGCCTACCCAAAGACCAACCGCAGCAGGCCACGCCCTACTGGCAACAATCGATCTACACCG‑CCGCGATCATCGAAGGCCTCACCCGCGCCATGCCTCGTGCAGAACGCCCCGAGGCCGGGCTGACCTACCTGGCCGGGCTACTGCACAACTTCGGCTACCTGCTGCTGGCGCACGTGTTCCCGCCGCACTTCTCGCTGATTTGCCGCCACCTTGAGGTCAACCCGCATTTGAACCACACCTATGTGGAGCAACACTTGCTGGGCATCAGCCGCGAACAGATCGGT > NC_002947/6059782‑6060073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |