New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 314661 = | 50 (1.020) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 8.5% | coding (57/567 nt) | nudE | ADP compounds hydrolase NudE |
? | NC_002947 | 314750 = | 38 (0.810) | coding (146/567 nt) | nudE | ADP compounds hydrolase NudE |
CCAGGGAAGAACAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGT > NC_002947/314523‑314808 | ccAGGGAAGAACAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGaa < 4:107201/148‑1 (MQ=255) ccAGGGAAGAACAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAg < 5:112362/149‑1 (MQ=255) cAGGGAAGAACAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGc < 5:152148/149‑1 (MQ=255) cAGGGAAGAACAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCAAGCCAAGGAGCCCCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCCAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGc > 7:144798/1‑149 (MQ=255) gggAAGAACAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCg < 2:39785/149‑1 (MQ=255) gaagaaCAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGACCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCGCCGTACTCAGCCACGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTa > 5:252427/1‑149 (MQ=255) tgccgccagcacgtcttcgcccggctcgatcaggcccttgggcaacgacagctcgtattcatcggtgccaccgcagtattcctccaccagcacggcgtgctcggcatcgagcttggccacgatcatcaCCGCGTCGAAGCCGTACAGCt < 5:25922‑M1/21‑1 (MQ=255) aaCTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCaa < 2:129682/149‑1 (MQ=255) tcGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTg > 7:87718/1‑149 (MQ=255) gATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGcc > 4:142070/1‑149 (MQ=255) gATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGcc > 6:113551/1‑149 (MQ=255) cAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCACAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGAAGCCGCCTGTTCCCCCTCGAAGCCGTACACCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAg > 1:205858/1‑149 (MQ=255) gTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGCAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAgcg < 2:247547/149‑1 (MQ=255) ctcgatcaggcccttgggcaacgacagctcgtattcatcggtgccaccgcagtattcctccaccagcacggcgtgctcggcatcgagcatggccacgatcatcaCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAgcg < 3:76770‑M1/45‑1 (MQ=255) gCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTc > 1:107452/1‑128 (MQ=255) gCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTc < 2:107452/128‑1 (MQ=255) aaGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTa > 4:290292/1‑149 (MQ=255) aaGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTa > 2:3709/1‑149 (MQ=255) gCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTAt > 6:94238/1‑148 (MQ=255) cgctcttataGTTACCCGCTCACGCCAAGGAGCCTCCCCATGCGCCAGAAACCCACCCTACTCAGCCGCCAAATTGTCGGCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACATCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGa < 5:209117/143‑1 (MQ=255) ccACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTAt > 2:151054/1‑147 (MQ=255) aCGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAgc < 3:142070/149‑1 (MQ=255) ggTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAgcgc > 4:30461/1‑149 (MQ=255) ataGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAAATGTCGCCAGTACCCGCCTGTTCCGCCTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGACCGCACCTATGAgagatcg > 6:209117/1‑143 (MQ=255) aCCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGc > 6:145460/1‑149 (MQ=255) ccGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCg < 3:30461/149‑1 (MQ=255) gTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCggg < 5:94238/149‑1 (MQ=255) gTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCggg < 7:244055/149‑1 (MQ=255) cGCCTAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAATCCCACCGTACTCAGCCTCGAAATTGGCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAAc < 2:205858/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACg > 1:163405/1‑149 (MQ=255) cAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGc > 6:210913/1‑149 (MQ=255) gAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACg > 5:121985/1‑149 (MQ=255) gccgccCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGgc < 8:87718/149‑1 (MQ=255) gccCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGcgcg < 7:251906/149‑1 (MQ=255) gccCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGcgcg > 1:89804/1‑149 (MQ=255) cccATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGAGGTAACGGCTACGGCGCGGt > 3:148645/1‑149 (MQ=255) ccATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCATGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGt > 7:136812/1‑148 (MQ=255) gcCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATc > 4:151665/1‑149 (MQ=255) attcctccaccagcacggcgtgctcggcatcgagcttggccacgatcatcaCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCATCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATc > 6:25922‑M1/52‑148 (MQ=255) ttcctccaccagcacggcgtgctcggcatcgagcatggccacgatcatcaCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGt > 4:76770‑M1/51‑149 (MQ=255) cAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCa > 2:168480/1‑97 (MQ=255) aCCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCa > 4:191936/1‑149 (MQ=255) ccACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCa > 8:292306/1‑147 (MQ=255) ccACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCa < 7:292306/147‑1 (MQ=255) gTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGa < 2:163405/149‑1 (MQ=255) gCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAg < 5:210913/149‑1 (MQ=255) 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gTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTggag < 4:124057/149‑1 (MQ=255) gccgccTGTTCCGCGTCGAAGCCCTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTCGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGaa > 3:292948/1‑149 (MQ=255) gccTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATAc > 7:62737/1‑149 (MQ=255) tCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGt > 1:301352/1‑149 (MQ=255) | CCAGGGAAGAACAGGCATGGGAAACTCTCGATCAGTCGGCAAGCCACGGTATAGTAACCCGTTCACGCCAAGGAGCCGCCCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGT > NC_002947/314523‑314808 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |