New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 314661 = | 50 (1.020) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 8.5% | coding (57/567 nt) | nudE | ADP compounds hydrolase NudE |
? | NC_002947 | 314750 = | 38 (0.810) | coding (146/567 nt) | nudE | ADP compounds hydrolase NudE |
CCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCGGGAGCT > NC_002947/314602‑314891 | cccATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGAGGTAACGGCTACGGCGCGGt > 3:148645/1‑149 (MQ=255) ccATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCATGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGt > 7:136812/1‑148 (MQ=255) gcCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATc > 4:151665/1‑149 (MQ=255) attcctccaccagcacggcgtgctcggcatcgagcttggccacgatcatcaCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCATCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATc > 6:25922‑M1/52‑148 (MQ=255) ttcctccaccagcacggcgtgctcggcatcgagcatggccacgatcatcaCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGt > 4:76770‑M1/51‑149 (MQ=255) aCCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCa > 4:191936/1‑149 (MQ=255) ccACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCa > 8:292306/1‑147 (MQ=255) ccACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCa < 7:292306/147‑1 (MQ=255) gTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGa < 2:163405/149‑1 (MQ=255) gCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAg < 5:210913/149‑1 (MQ=255) cgcgAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCa > 3:124057/1‑149 (MQ=255) cgcgAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCa > 1:115869/1‑149 (MQ=255) cGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCtgg < 7:134304/149‑1 (MQ=255) aGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTgga < 6:252427/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTggag < 4:124057/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTggag < 3:290292/149‑1 (MQ=255) gccgccTGTTCCGCGTCGAAGCCCTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTCGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGaa > 3:292948/1‑149 (MQ=255) acgatcatcaccgcgccgtagccgttaccccggcccaccaggcgctcataggtgcgctcggcaccattgctgaagcgcagctgtacggcttcgacgcggTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGaa > 4:76770‑M2/100‑149 (MQ=255) gatcatcaccgcgccgtagccgttaccccggcccaccaggcgctcataggtgcgctcggcaccattgatgaagcgcagctgtacggcttcgacgcggTGATGATCGTGGCCAAGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAAt > 6:25922‑M2/98‑148 (MQ=255) gccTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATAc > 7:62737/1‑149 (MQ=255) tCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGt > 1:301352/1‑149 (MQ=255) CGCGTCGAAGCCGTAGAGCTGGGGTTCTGGATTGGTGCCGAGCGCACGTATGAGCGCCTGGTGGGGCGAGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCGATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTg > 4:148645‑M1/1‑148 (MQ=255) CGCGTCGAAGCCGTACATGTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCAGGTATGTGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCTGTGATGATCGTGGCCATGGTAGATGCCGAGCACGCCGTGcttgtgt > 4:261085‑M1/1‑132 (MQ=255) CGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCtggtgg < 3:261085‑M1/133‑1 (MQ=255) CGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTg > 5:145460‑M1/1‑148 (MQ=255) aaGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGAt < 3:191936/149‑1 (MQ=255) aaGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGAt < 6:121985/149‑1 (MQ=255) cGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGaa > 8:132057/1‑148 (MQ=255) cAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGa < 8:62737/149‑1 (MQ=255) gcTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCg > 3:15054/1‑149 (MQ=255) cTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAAGACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGt > 6:270052/1‑149 (MQ=255) ttCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGtt > 1:117547/1‑149 (MQ=255) ttCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGCGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGtt > 1:218085/1‑149 (MQ=255) cAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTg < 2:115869/148‑1 (MQ=255) aGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACg > 2:248366/1‑136 (MQ=255) aGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACg < 1:248366/136‑1 (MQ=255) gAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGAt > 8:175372/1‑149 (MQ=255) gcgcACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGa > 8:259856/1‑123 (MQ=255) gcgcACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGa < 7:259856/123‑1 (MQ=255) cgcACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGa < 5:113551/149‑1 (MQ=255) cgctcggcaccattgctgaagcgcagctgtacggcttcgacgcggTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAg < 3:76770‑M2/104‑1 (MQ=255) cTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCATGATCGAGCCgg > 5:297871/1‑149 (MQ=255) tgtgcgcGTGGTGGGCGGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCggg < 4:292948/144‑1 (MQ=255) cgcCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAg < 4:15054/148‑1 (MQ=255) ccTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACg > 4:95970/1‑149 (MQ=255) cTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGt > 1:145161/1‑149 (MQ=255) agctgtacggcttcgacgcggTGATGATCGTGGCCAAGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCa < 5:25922‑M2/128‑1 (MQ=255) aCGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGAc > 2:286640/1‑149 (MQ=255) gCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATTGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCgg < 7:132057/149‑1 (MQ=255) cTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCGCAAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCgg < 1:3709/149‑1 (MQ=255) cGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCGGGa < 1:286640/147‑1 (MQ=255) cGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCGGGa < 2:145161/147‑1 (MQ=255) cGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCGGGAg < 3:95970/148‑1 (MQ=255) ggCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCGGGAGCt > 7:67264/1‑149 (MQ=255) | CCCATGCGCCAGAAACCCACCGTACTCAGCCGCGAAATTGTCGCCAGTAGCCGCCTGTTCCGCGTCGAAGCCGTACAGCTGCGCTTCAGCAATGGTGCCGAGCGCACCTATGAGCGCCTGGTGGGCCGGGGTAACGGCTACGGCGCGGTGATGATCGTGGCCATGCTCGATGCCGAGCACGCCGTGCTGGTGGAGGAATACTGCGGTGGCACCGATGAATACGAGCTGTCGTTGCCCAAGGGCCTGATCGAGCCGGGCG‑AAGACGTGCTGGCGGCAGCCGACCGGGAGCT > NC_002947/314602‑314891 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |