New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 497023 | 54 (1.100) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 6.5% | coding (895/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 497096 | 64 (1.390) | coding (968/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
CGGCCAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGT > NC_002947/496877‑497171 | cGGCCAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGt < 3:100753/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGt > 1:278132/1‑147 (MQ=255) cAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcg > 7:203743‑M1/1‑143 (MQ=255) gAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCt < 2:278132/149‑1 (MQ=255) aGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTg < 8:100917/149‑1 (MQ=255) aGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTg < 6:287253/149‑1 (MQ=255) cAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGa < 1:194046/149‑1 (MQ=255) aTCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATAGCCGCGCCTGAGCGAGTCGGCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTGCGGTCTGTTGCTGTTGGGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGc < 6:291835/149‑1 (MQ=255) tCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGcc > 7:203707/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGt > 8:252696/1‑149 (MQ=255) cgcTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGtt < 4:247128/149‑1 (MQ=255) cAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCcgcgc < 3:252005/148‑1 (MQ=255) aGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCga < 8:203707/149‑1 (MQ=255) gAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCgaga > 4:20080/1‑147 (MQ=255) aaaTACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTTCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGaaa < 4:233851/148‑1 (MQ=255) aaaTACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAg > 4:299294/1‑149 (MQ=255) aaaTACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTCCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCgaga > 3:233851/1‑146 (MQ=255) cgcgCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCttgtt > 6:135646/1‑149 (MQ=255) ccTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAgc > 6:70262/1‑149 (MQ=255) ccTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAgc < 3:299294/149‑1 (MQ=255) gAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAgcgc > 5:120104/1‑148 (MQ=255) gCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGcgcg < 4:126953/149‑1 (MQ=255) gCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacg < 8:203743‑M1/149‑75 (MQ=255) cTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCGTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAgg > 8:69197‑M2/1‑147 (MQ=255) gCAGAACATGGCCTTGTTGTTTGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgc < 4:87932‑M2/149‑9 (MQ=255) gCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCttg > 2:72484/1‑119 (MQ=255) gCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCttg < 1:72484/119‑1 (MQ=255) cAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCg > 8:199306/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttg < 6:114875‑M1/140‑81 (MQ=255) tGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttg > 5:114875‑M1/1‑60 (MQ=255) tGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGGCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGc < 7:252696/149‑1 (MQ=255) tgttgtTCGGTCCGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgt > 2:264227‑M2/1‑127 (MQ=255) gttgttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTc < 4:64430/148‑1 (MQ=255) ttgttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGc < 6:120104/149‑1 (MQ=255) ttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCAt > 8:67377/1‑149 (MQ=255) cGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATc > 6:203467/1‑148 (MQ=255) gTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGAt < 5:70262/149‑1 (MQ=255) tCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATc < 1:49059/149‑1 (MQ=255) tgttgctgttgTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGAt > 2:33651/1‑146 (MQ=255) ttgctgttgTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCa < 3:20080/146‑1 (MQ=255) tgttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCAcc > 7:241862/1‑149 (MQ=255) ttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGt > 8:37597/1‑149 (MQ=255) gtgtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTgg > 3:209672/1‑149 (MQ=255) tgtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTgg < 8:241862/148‑1 (MQ=255) gtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTg > 6:70954/1‑116 (MQ=255) tgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt < 7:37597/148‑1 (MQ=255) tgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt < 4:209672/148‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTAt > 4:168019/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTATTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTAt > 1:239319/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGc < 1:70634/123‑1 (MQ=255) cTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGc > 2:70634/1‑123 (MQ=255) ttGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCct > 1:205433/1‑149 (MQ=255) gCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTg > 8:154106/1‑149 (MQ=255) gCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTg < 7:67377/149‑1 (MQ=255) gtgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt > 4:183997/1‑130 (MQ=255) gtgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt < 3:183997/130‑1 (MQ=255) tgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGa < 6:300423/149‑1 (MQ=255) tgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGa > 5:300423/1‑149 (MQ=255) gCAACGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccaaacaacaaggccatgttctgc < 4:87932‑M1/149‑142 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGTAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGa > 1:98004/1‑147 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCa > 3:102832/1‑114 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCa < 4:102832/114‑1 (MQ=255) cAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggcca < 6:114875‑M2/140‑61 (MQ=255) cAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggcca > 5:114875‑M2/1‑80 (MQ=255) aaCGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGc > 5:179192/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGc > 3:219030/1‑149 (MQ=255) aCGCCtcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacggaccgaacaaca > 2:264227‑M1/1‑5 (MQ=255) gCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCAt < 6:179192/149‑1 (MQ=255) cctcttcgcgcacctggcgctcaacaaggctttctcgcgcggccaacaggctgcgctccagctggcgctgctgacggcgttgccacaccagcgtggccacggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctgccagaag > 8:69197‑M1/1‑2 (MQ=255) cGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctgccagaagc < 8:203743‑M2/149‑76 (MQ=255) cGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCAtgt > 5:197083/1‑149 (MQ=255) | CGGCCAAGGAGCTGGAGCAACTGCATCAGCGCTGGTTGCAGCCGAAATACCCGCGCCTGAGCGAGTCGCCGGGCTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGT > NC_002947/496877‑497171 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |