New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 497023 | 54 (1.100) | 4 (0.090) | 4/246 | NT | 6.5% | coding (895/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 497096 | 64 (1.390) | coding (968/2388 nt) | PP_0409 | two‑component system sensor histidine kinase |
CTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGC > NC_002947/496950‑497239 | cTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCGTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAgg > 8:69197‑M2/1‑147 (MQ=255) gCAGAACATGGCCTTGTTGTTTGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgc < 4:87932‑M2/149‑9 (MQ=255) cAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCg > 8:199306/1‑149 (MQ=255) tGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGGCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGc < 7:252696/149‑1 (MQ=255) tgttgtTCGGTCCGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgt > 2:264227‑M2/1‑127 (MQ=255) gttgttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTc < 4:64430/148‑1 (MQ=255) ttgttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGc < 6:120104/149‑1 (MQ=255) ttCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCAt > 8:67377/1‑149 (MQ=255) cGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATc > 6:203467/1‑148 (MQ=255) gTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGAt < 5:70262/149‑1 (MQ=255) tCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATc < 1:49059/149‑1 (MQ=255) tgttgctgttgTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGAt > 2:33651/1‑146 (MQ=255) ttgctgttgTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCa < 3:20080/146‑1 (MQ=255) tgttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCAcc > 7:241862/1‑149 (MQ=255) ttgtGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGt > 8:37597/1‑149 (MQ=255) gtgtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTgg > 3:209672/1‑149 (MQ=255) tgtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTgg < 8:241862/148‑1 (MQ=255) gtgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTg > 6:70954/1‑116 (MQ=255) tgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt < 7:37597/148‑1 (MQ=255) tgCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt < 4:209672/148‑1 (MQ=255) gCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTAt > 4:168019/1‑149 (MQ=255) gCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTATTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTAt > 1:239319/1‑149 (MQ=255) cTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGc > 2:70634/1‑123 (MQ=255) cTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGc < 1:70634/123‑1 (MQ=255) ttGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCct > 1:205433/1‑149 (MQ=255) gCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTg > 8:154106/1‑149 (MQ=255) gCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTg < 7:67377/149‑1 (MQ=255) gtgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt > 4:183997/1‑130 (MQ=255) gtgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGt < 3:183997/130‑1 (MQ=255) tgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGa < 6:300423/149‑1 (MQ=255) tgGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGa > 5:300423/1‑149 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGTAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGa > 1:98004/1‑147 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCa < 4:102832/114‑1 (MQ=255) gCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCa > 3:102832/1‑114 (MQ=255) cAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggcca < 6:114875‑M2/140‑61 (MQ=255) cAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggcca > 5:114875‑M2/1‑80 (MQ=255) aaCGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGc > 5:179192/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGc > 3:219030/1‑149 (MQ=255) gcagTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGAGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCAt > 2:266184/4‑149 (MQ=255) gCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCAt < 6:179192/149‑1 (MQ=255) cGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctgccagaagc < 8:203743‑M2/149‑76 (MQ=255) cGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCAtgt > 5:197083/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGc > 8:108951/1‑149 (MQ=255) tCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGc < 2:205433/149‑1 (MQ=255) gcagcGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCAt < 4:112422/142‑1 (MQ=255) gcagcGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCAt > 3:112422/1‑142 (MQ=255) gcgcCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACg > 1:216927/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACg > 2:70687/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTgg < 1:244867/107‑1 (MQ=255) ccAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTgg > 2:244867/1‑107 (MQ=255) tGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACa > 8:156851/1‑126 (MQ=255) tGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACa < 7:156851/126‑1 (MQ=255) gCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAg < 7:154106/149‑1 (MQ=255) ccTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATc < 5:166960/97‑1 (MQ=255) ccTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATc > 6:166960/1‑97 (MQ=255) cTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAgcg < 5:203467/149‑1 (MQ=255) tGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAGCTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAgcg > 3:62762/1‑148 (MQ=255) gCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGtt < 5:135646/149‑1 (MQ=255) ccGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCCTCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTg < 7:199306/149‑1 (MQ=255) cgcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATTTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTgg > 4:244900/1‑149 (MQ=255) gcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTtgg > 7:252969/1‑149 (MQ=255) gcgcgAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTggg > 6:246858/1‑149 (MQ=255) gaAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAg > 6:26937/1‑149 (MQ=255) ttgttgAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAggg > 6:283831/1‑149 (MQ=255) ttgAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCg > 7:201281/1‑149 (MQ=255) gAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGt < 1:70687/148‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGc < 4:219030/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGc < 3:87932/149‑1 (MQ=255) cgcCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCt > 8:32312/1‑149 (MQ=255) gcgcGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGc > 1:61485/1‑149 (MQ=255) cgAAGAggcgttgccacaccagcgtggccaaggcacacaacagcaacagaccgaacaacaaggccatgttctgccagaagcccggcgactcgctcaggcgcgggtatttcggctgcaaccagcgctgatgcagttgctccagctccttg > 7:203743‑M2/1‑6 (MQ=255) cgAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAg > 2:39058/1‑142 (MQ=255) cgAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAg < 1:39058/142‑1 (MQ=255) gAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGc > 7:131891/1‑148 (MQ=255) | CTTCTGGCAGAACATGGCCTTGTTGTTCGGTCTGTTGCTGTTGTGTGCCTTGGCCACGCTGGTGTGGCAACGCCGTCAGCAGCGCCAGCTGGAGCGCAGCCTGTTGGCCGCGCGAGAAAGCCTTGTTGAGCGCCAGGTGCGCGAAGAGGCGTTGCGGCTGAGCCAGTTCGCCATCGATCAGAGCACCGTGGGTATCCTCTGGGTCAACTGGGACAGCCATGTGCGTTACGCCAACCATGCCGCCGAGCGCATGTTGGGCTACAGCGAAGGGGCGTTGCTGGAGCGGCCGC > NC_002947/496950‑497239 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |