New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 722076 = | 46 (0.940) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 9.4% | coding (674/753 nt) | PP_0616 | ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 722166 = | 33 (0.710) | coding (584/753 nt) | PP_0616 | ABC transporter ATP‑binding protein |
TTGAGCGAGACGCCTTCGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCAT > NC_002947/721930‑722212 | gcgggcgaactgtcgcacggccagcaaagggtgctggaagtgggcatgtcgatctgtgccaagcccaccctgctgatgcttgacgaacccacttcgggcatgggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTgg < 3:75082‑M1/3‑1 (MQ=255) gcgggcgaactgtcgcacggccagcaaagggtgctggaagtgggcatgtcgatctgtgccaagcccaccctgctgatgcttgacgaacccacttcgggcatgggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTg > 8:179705‑M1/147‑148 (MQ=255) gAGCGAGACGCCTTCGAGCACATGGCTGTTGTGGTAGTTGGAATGGGTCGAATCGACGGTGAGCATAAGGCGGCCGCTCCCAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCGCGTCGGTGCGCACCTGTTCAGGGGTTCCCTCGACCACGATCTGGcc > 6:295555/1‑149 (MQ=255) aGCGAGACGCCTTCGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCg < 2:20685/149‑1 (MQ=255) gagaCGCCTTCGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGa < 6:14385/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACtcat < 3:79270/149‑1 (MQ=255) gCCTTCGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACtca > 8:69982/1‑148 (MQ=255) cTTCGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGAGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCAACGACCAGGATCTGGCCGTGACtcatca > 8:60001/1‑149 (MQ=255) cGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCAc < 7:20939/147‑1 (MQ=255) cacaTGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGAt < 5:295555/149‑1 (MQ=255) caaagggtgctggaagtgggcatgtcgatctgtgccaagcccaccctgctgatgcttgacgaacccacttcgggcatgggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTGGCCGTGACTCATCACCGTGATgcgc < 1:50822‑M1/27‑1 (MQ=255) gCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCgct < 4:228737/148‑1 (MQ=255) ctctTGTCGTAGTAGTAATGGATCGAATCGACGTTGATCATCAGGCGTCCTCTCCAAGGTATGCTGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACGCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGtta < 7:256041/141‑3 (MQ=255) ctctTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGa < 5:3551/128‑1 (MQ=255) ctctTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGa > 6:3551/1‑128 (MQ=255) ctctTGTAGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTTAGCATCAGGCGGCCTCTCAAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCATCGACCACGATCTGGCCGAGACTCATCACCGTGAtagatcg > 8:256041/1‑142 (MQ=255) ctTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCgctggct > 5:7876/1‑149 (MQ=255) gtagtaGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGa > 1:196423/1‑149 (MQ=255) gtagtaGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGa > 5:303943/1‑149 (MQ=255) tagtagGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGa > 5:53564/1‑148 (MQ=255) gAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGAc > 6:68703/1‑148 (MQ=255) gATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGc < 3:236697/148‑1 (MQ=255) gATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGc > 4:236697/1‑148 (MQ=255) atcgaatcgaCGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTc < 5:119016/149‑1 (MQ=255) atcgaCGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCAtgtt < 5:33296/149‑1 (MQ=255) aGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGAt < 2:196423/148‑1 (MQ=255) aGCATCACGCGGCCTCTCCACGGTAGGCGGTGCGTACGCGGTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGAGCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGAt < 6:242962/148‑1 (MQ=255) aTCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAg > 5:139497/1‑148 (MQ=255) cAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAg > 1:116636/1‑149 (MQ=255) aGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAg > 1:126815/1‑148 (MQ=255) gcggcCTCACCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCa < 6:10588/142‑1 (MQ=255) gcggcCTCACCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCa > 5:10588/1‑142 (MQ=255) ggcCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGa < 8:25288/95‑1 (MQ=255) ggcCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGa > 7:25288/1‑95 (MQ=255) gcCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGt < 6:303943/149‑1 (MQ=255) ctctCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTAt > 2:295331/1‑149 (MQ=255) ctctCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTAt > 3:13521/1‑149 (MQ=255) tctcCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATg > 7:275579/1‑149 (MQ=255) cAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGt < 5:68703/147‑1 (MQ=255) aaGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTcgc < 6:51501/149‑1 (MQ=255) ggTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCgg < 6:53564/149‑1 (MQ=255) cacttcgggcatgggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAg > 2:50822‑M1/58‑149 (MQ=255) cGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGc < 6:7876/148‑1 (MQ=255) gggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCg > 6:282137‑M1/46‑141 (MQ=255) gggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCg < 5:282137‑M1/96‑1 (MQ=255) gcTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCAtgtt‑gt > 5:297710/1‑102 (MQ=255) gcTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCAtgtt‑gt < 6:297710/102‑1 (MQ=255) aCCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCgg < 7:69982/149‑1 (MQ=255) aCCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCgg < 4:13521/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCggg < 2:116636/149‑1 (MQ=255) ggggTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTTCGTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATc < 1:222316/124‑1 (MQ=255) ggggTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATc > 2:222316/1‑123 (MQ=255) tCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCATCGatgcccat > 5:7179/1‑149 (MQ=255) | TTGAGCGAGACGCCTTCGAGCACATGGCTCTTGTCGTAGTAGGAATGGATCGAATCGACGTTGAGCATCAGGCGGCCTCTCCAAGGTAGGCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCAT > NC_002947/721930‑722212 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |