New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 722076 = | 46 (0.940) | 4 (0.090) | 4/250 | NT | 9.4% | coding (674/753 nt) | PP_0616 | ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 722166 = | 33 (0.710) | coding (584/753 nt) | PP_0616 | ABC transporter ATP‑binding protein |
GCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGTTCGCCCGC > NC_002947/722019‑722311 | cacttcgggcatgggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAg > 2:50822‑M1/58‑149 (MQ=255) cGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGc < 6:7876/148‑1 (MQ=255) gggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCg < 5:282137‑M1/96‑1 (MQ=255) gggcatcgacgacatcccggtgatgaccgacctgatcagcgacctTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCg > 6:282137‑M1/46‑141 (MQ=255) aCCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCgg < 7:69982/149‑1 (MQ=255) aCCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCgg < 4:13521/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCggg < 2:116636/149‑1 (MQ=255) ggggTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTTCGTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATc < 1:222316/124‑1 (MQ=255) ggggTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATc > 2:222316/1‑123 (MQ=255) tCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCATCGatgcccat > 5:7179/1‑149 (MQ=255) cgaccttggccgcgaccataccgtgctactgatcgagcacaacatgagcattgtcatgtcgatcagccagcgcatcacggtgatgagtcacggccaAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGatgccc < 5:282137‑M2/45‑1 (MQ=255) cgaccttggccgcgaccataccgtgctactgatcgagcacaacatgagcattgtcatgtcgatcagccagcgcatcacggtgatgagtcacggccaAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGatgccc > 6:282137‑M2/97‑141 (MQ=255) cttggccgcgaccataccgtgctactgatcgagcacaacatgagcattgtcatgtcgatcagccagcgcatcacggtgatgagtcacggccaAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTg > 2:50822‑M2/93‑149 (MQ=255) GGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGc > 8:199824‑M1/1‑96 (MQ=255) GGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGc < 7:199824‑M1/96‑1 (MQ=255) GCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTggg > 6:139497‑M1/1‑147 (MQ=255) GCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTg > 1:295331‑M1/1‑145 (MQ=255) CGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCTCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCg > 7:60001‑M1/1‑149 (MQ=255) tGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTc < 2:126815/149‑1 (MQ=255) ccTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCaa < 5:264812/148‑1 (MQ=255) atcaCCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCAt > 4:134848/1‑149 (MQ=255) atcaCCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCAt > 7:240484/1‑149 (MQ=255) cGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATcag > 4:30807/1‑147 (MQ=255) aTGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCATCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGt < 6:7179/149‑1 (MQ=255) cgcTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTgg < 8:275579/148‑1 (MQ=255) gctggctgATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGc > 6:121855/1‑149 (MQ=255) gctggctgATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGc > 8:53708/1‑149 (MQ=255) gctgATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCATgt > 6:188467/1‑148 (MQ=255) gACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGa < 5:121855/148‑1 (MQ=255) gACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATc > 8:191590/1‑145 (MQ=255) gACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATc < 7:191590/145‑1 (MQ=255) aCAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACa < 3:30807/148‑1 (MQ=255) aaTGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGc < 4:249553/115‑1 (MQ=255) aaTGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGc > 3:249553/1‑115 (MQ=255) tGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTgg < 3:152330/132‑1 (MQ=255) tGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTgg > 4:152330/1‑132 (MQ=255) gCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCa > 3:47105/1‑149 (MQ=255) aTGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACtt < 3:134848/148‑1 (MQ=255) tt‑gtGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCa < 4:47105/148‑1 (MQ=255) cTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCAccc > 2:233127/1‑149 (MQ=255) gcgcatcacggtgatgagtcacggccaAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTg < 1:50822‑M2/122‑1 (MQ=255) tCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGAACCCTTTGc > 3:176614/1‑149 (MQ=255) gTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTc > 7:227269/1‑88 (MQ=255) gTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTc < 8:227269/88‑1 (MQ=255) gttATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTGATCAGCGGGATGTCGTGGATGCCCTTGCCAGAAGTTGGTTCGTTTAGCATCAGCTGTGTGGGCTTGGCACAGATCGAGATGCCCACTTGCAGTAGCCTTTGCTGTCCGTGc < 4:176614/146‑1 (MQ=255) gTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGtt > 1:55415/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGTTc > 6:133836/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGTTc > 4:263400/1‑149 (MQ=255) tCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGTTc < 8:240484/149‑1 (MQ=255) ccaAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGTTcgcccgc < 3:75082‑M2/146‑1 (MQ=255) caAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGTTcgcccgc > 8:179705‑M2/3‑148 (MQ=255) | GCGGTGCGTACGCGCTCGTCGTTGCGCACCTGTTCAGGGGTACCCTCGACCAGGATCTGGCCGTGACTCATCACCGTGATGCGCTGGCTGATCGACATGACAATGCTCATGTT‑GTGCTCGATCAGTAGCACGGTATGGTCGCGGCCAAGGTCGCTGATCAGGTCGGTCATCACCGGGATGTCGTCGATGCCCATGCCCGAAGTGGGTTCGTCAAGCATCAGCAGGGTGGGCTTGGCACAGATCGACATGCCCACTTCCAGCACCCTTTGCTGGCCGTGCGACAGTTCGCCCGC > NC_002947/722019‑722311 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |