New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1358040 | 68 (1.390) | 4 (0.090) | 4/248 | NT | 5.7% | coding (1221/1608 nt) | PP_1182 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 1358084 | 67 (1.450) | coding (1265/1608 nt) | PP_1182 | sensor histidine kinase |
ACAAGCTGGTCGACGAGATGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACG > NC_002947/1357892‑1358183 | aCAAGCTGGTCGACGAGATGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGC > 1:148180‑M1/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGGTCGACGAGATGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCgcggcg < 1:92869/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGACGAGATGCTGACCTACGTCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCCCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACt < 8:216360/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGACGAGATGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCtcgg > 4:18032‑M1/1‑145 (MQ=255) gTCGACGAGATGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGc > 3:92613/1‑147 (MQ=255) gTCGACGAGATGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCa < 4:92613/149‑1 (MQ=255) gagaTGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGgcgc < 7:292304/149‑1 (MQ=255) agttGCTGACCTACGCGCGGCTGGAGGAGGGCGCACCGGGCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGGTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGGGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGgcgc < 8:147282/145‑1 (MQ=255) agaTGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGcgcg < 5:136250/149‑1 (MQ=255) tGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGAt > 7:103510/1‑149 (MQ=255) gCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGAt < 6:303633/148‑1 (MQ=255) gCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGAt > 5:303633/1‑148 (MQ=255) gCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATg > 6:118300/1‑149 (MQ=255) gCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATg > 6:209235/1‑149 (MQ=255) gCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATg > 6:86010/1‑149 (MQ=255) gCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCATTGC‑GTGCCGAGGTGCGCGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATg > 8:169597/1‑149 (MQ=255) gcccgccTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGgcgc < 5:118300/149‑1 (MQ=255) ccgccTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGAt < 4:210960/136‑1 (MQ=255) gccTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTgg > 8:68299/1‑149 (MQ=255) gccTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTgg < 2:151296/149‑1 (MQ=255) gccTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTgg < 3:156868/149‑1 (MQ=255) cTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCTGATGCCGaa < 2:258760/138‑1 (MQ=255) cTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGaa > 1:258760/1‑138 (MQ=255) ggAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGAc < 1:151255/115‑1 (MQ=255) ggAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGAc > 2:151255/1‑115 (MQ=255) gAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTc < 2:102234/147‑1 (MQ=255) aGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGcc > 6:165513/1‑149 (MQ=255) ggCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCtcggcctcgacccaggcgccttcggcatccgcgccctggcagtc > 2:216057‑M1/1‑105 (MQ=255) aCCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCtcggcctcgacccaggcgccttcggcatccgcgccctggcagtcgccgc < 3:18032‑M1/149‑50 (MQ=255) gCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCtcggcctggacccaggcgccttcggcatccgcgccctggcagtcgccgcgcac < 1:216057‑M1/149‑54 (MQ=255) ttGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACtt > 2:25340/1‑149 (MQ=255) gAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGAGCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCtcggcctcgacccaggcgccttcggcatccgcgccctggcagtcgccgcgcacaac < 3:163632‑M1/147‑57 (MQ=255) aaGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCa < 6:56366/98‑1 (MQ=255) aaGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCa > 5:56366/1‑98 (MQ=255) gTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCAcc > 7:153423/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGc > 1:210640/1‑149 (MQ=255) gggTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTg > 8:192500/1‑149 (MQ=255) tagATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGAGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCTCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTg > 8:121882/3‑146 (MQ=255) cGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAg > 6:110511/1‑148 (MQ=255) cTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGc > 1:303189/1‑78 (MQ=255) cTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGc < 2:303189/78‑1 (MQ=255) tGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCAGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCtt > 1:197803/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGTCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 7:192500/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAAc < 2:148180/144‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 3:282556/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 8:103510/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 5:110511/149‑1 (MQ=255) ccTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCgg < 7:68299/148‑1 (MQ=255) ttGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCaa > 3:178840/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGCAGTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCaa > 1:50316/1‑149 (MQ=255) cGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgcca > 5:171134/1‑149 (MQ=255) gATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatgcgccatg > 1:268277/1‑149 (MQ=255) gATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatgcgccatg > 1:186742/1‑149 (MQ=255) tCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGcc < 4:178840/149‑1 (MQ=255) cGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGcc > 2:165701/1‑148 (MQ=255) gAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGcc > 4:69410/1‑147 (MQ=255) tGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCg > 2:64845/1‑147 (MQ=255) ggCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAg > 6:311328/1‑149 (MQ=255) cTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGACGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTgcgc > 6:23525/1‑149 (MQ=255) tGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCt < 5:209235/148‑1 (MQ=255) tGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCt < 3:69410/148‑1 (MQ=255) c‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGa < 3:187243/148‑1 (MQ=255) c‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAg < 2:210640/149‑1 (MQ=255) gTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGc > 4:253425/1‑149 (MQ=255) tGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGc > 2:76001/1‑148 (MQ=255) tGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCt < 6:171134/149‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatg > 4:227202/1‑116 (MQ=255) ccGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatg < 3:227202/116‑1 (MQ=255) gTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCGAAGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGc < 1:165701/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTg < 2:247365/149‑1 (MQ=255) cGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTggg > 3:132942/1‑149 (MQ=255) gggTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGc < 7:169597/149‑1 (MQ=255) gggTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGc < 5:86010/149‑1 (MQ=255) gTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgctcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttc < 3:163632‑M2/147‑92 (MQ=255) gTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGt > 3:95915/1‑125 (MQ=255) gTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGt < 4:95915/125‑1 (MQ=255) ttGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑a > 7:59907/1‑115 (MQ=255) ttGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑a < 8:59907/115‑1 (MQ=255) gtgCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGc < 2:186742/148‑1 (MQ=255) gtgCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCCAGGCCGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgatcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttcaaggc < 1:216057‑M2/149‑97 (MQ=255) gcggcgACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgatcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttcaaggccggt < 3:18032‑M2/149‑101 (MQ=255) | ACAAGCTGGTCGACGAGATGCTGACCTACGCCCGCCTGGAGCAGGGCGCACCGGCCTTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑AGGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACG > NC_002947/1357892‑1358183 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |