New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1358040 | 68 (1.390) | 4 (0.090) | 4/248 | NT | 5.7% | coding (1221/1608 nt) | PP_1182 | sensor histidine kinase |
? | NC_002947 | = 1358084 | 67 (1.450) | coding (1265/1608 nt) | PP_1182 | sensor histidine kinase |
TTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCGGGGATCCCCGAGG > NC_002947/1357948‑1358227 | ttGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACtt > 2:25340/1‑149 (MQ=255) gTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCAcc > 7:153423/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGc > 1:210640/1‑149 (MQ=255) gggTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTg > 8:192500/1‑149 (MQ=255) tagATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGAGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCTCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTg > 8:121882/3‑146 (MQ=255) cGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAg > 6:110511/1‑148 (MQ=255) tGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCAGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCtt > 1:197803/1‑149 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGTCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 7:192500/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAAc < 2:148180/144‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 3:282556/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 8:103510/149‑1 (MQ=255) gATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGt < 5:110511/149‑1 (MQ=255) ccTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCgg < 7:68299/148‑1 (MQ=255) ttGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCaa > 3:178840/1‑149 (MQ=255) tGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGCAGTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCaa > 1:50316/1‑149 (MQ=255) cGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgcca > 5:171134/1‑149 (MQ=255) gATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatgcgccatg > 1:268277/1‑149 (MQ=255) gATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatgcgccatg > 1:186742/1‑149 (MQ=255) tCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGcc < 4:178840/149‑1 (MQ=255) cGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGcc > 2:165701/1‑148 (MQ=255) gAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGcc > 4:69410/1‑147 (MQ=255) tGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCg > 2:64845/1‑147 (MQ=255) ggCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAg > 6:311328/1‑149 (MQ=255) cTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGACGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTgcgc > 6:23525/1‑149 (MQ=255) tGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCt < 3:69410/148‑1 (MQ=255) tGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCt < 5:209235/148‑1 (MQ=255) c‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGa < 3:187243/148‑1 (MQ=255) c‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAg < 2:210640/149‑1 (MQ=255) gTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGc > 4:253425/1‑149 (MQ=255) tGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGc > 2:76001/1‑148 (MQ=255) tGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCt < 6:171134/149‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatg < 3:227202/116‑1 (MQ=255) ccGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATgccatg > 4:227202/1‑116 (MQ=255) gTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCGAA‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGc < 1:165701/149‑1 (MQ=255) tGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTg < 2:247365/149‑1 (MQ=255) cGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTggg > 3:132942/1‑149 (MQ=255) gggTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGc < 5:86010/149‑1 (MQ=255) gggTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGc < 7:169597/149‑1 (MQ=255) gTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgctcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttc < 3:163632‑M2/147‑92 (MQ=255) gTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGt < 4:95915/125‑1 (MQ=255) gTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGt > 3:95915/1‑125 (MQ=255) ttGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑a > 7:59907/1‑115 (MQ=255) ttGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑a < 8:59907/115‑1 (MQ=255) gtgCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGc < 2:186742/148‑1 (MQ=255) gtgCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCCAGGCCGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgatcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttcaaggc < 1:216057‑M2/149‑97 (MQ=255) gcggcgACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgatcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttcaaggccggt < 3:18032‑M2/149‑101 (MQ=255) gACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgatcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttcaaggccggtgcgcc > 2:216057‑M2/1‑44 (MQ=255) tGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGCAGTGCGCCTGAGCTATCCGCTGGGCCCGCAACGTTGCCGTAt > 6:67292/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑ACTGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCg < 1:76001/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGAt < 4:251900/149‑1 (MQ=255) aGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGATATCAGATGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGAt > 6:185319/1‑149 (MQ=255) aGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTAGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGAt > 6:181040/1‑149 (MQ=255) gggCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCa < 1:221351/129‑1 (MQ=255) gggCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCa > 2:221351/1‑129 (MQ=255) gATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTggagga < 5:311328/149‑1 (MQ=255) tGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATg < 5:165513/149‑1 (MQ=255) ccGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGAc > 7:8863/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCTGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACg > 5:265768/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTgg > 4:192419/1‑113 (MQ=255) cGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTgg < 3:192419/113‑1 (MQ=255) cGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACg > 4:99086/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACgg < 6:265768/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTgg > 8:62322/1‑135 (MQ=255) gcgcCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTgg < 7:62322/135‑1 (MQ=255) gcgcCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCg > 8:99731/1‑149 (MQ=255) gcCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCCATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTg > 4:178460/1‑105 (MQ=255) gcCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCCATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTg < 3:178460/105‑1 (MQ=255) gTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCTACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCGGGGATccc < 7:121882/149‑1 (MQ=255) tCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCGGGGATcccc > 2:135794/1‑149 (MQ=255) gAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCGGGGATCCCCGa < 7:99731/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGCCGCGCTACTTTCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTTAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCGGGGATCCCCGAgg < 5:181040/149‑1 (MQ=255) ggCCGAGCCGCGCTACTTTCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTTAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCGGGGATCCCCGAgg < 5:185319/149‑1 (MQ=255) ccGAgccgcgcacaacccgcacctcggcacgcaaaggtgccagctcttcgatcacccgatcgagcaaggcatccagatcgacccgctggaacttcaaggccggtgcgccctgctccaggcgggcgtaggtcagcatctcgtcgaccagc > 4:18032‑M2/1‑4 (MQ=255) | TTGAAGTTCCAGCGGGTCGATCTGGATGCCTTGCTCGATCGGGTGATCGAAGAGCTGGCACCTTTGC‑GTGCCGAGGTGCGGGTTGTGCGCGGCGACTGCCAGGGCGCGGATGCCGAAGGCGCCTGGGTCGAGGCCGAGCCGCGCTACTTGCACCGGGCCCTGCAGAACCTTGTCGGCAATGCCATGCGCCATGCCG‑A‑GGGCGAAGTGCGCCTGAGCTATCAGCTGGGCCAGCAACGTTGCCGTATCGATGTGGAGGATGACGGCCCGGGGATCCCCGAGG > NC_002947/1357948‑1358227 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |