New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2473284 | 44 (0.900) | 3 (0.060) | 3/252 | NT | 6.2% | coding (812/1851 nt) | PP_2167 | PhoD‑like phosphatase |
? | NC_002947 | = 2473329 | 48 (1.020) | coding (767/1851 nt) | PP_2167 | PhoD‑like phosphatase |
GAGAGGTTCCAGTCGTCCGTGATGTCGTGGTCATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCGGCGTTGCTGGACGAGAAGATCGGCTTGCGCTTGCCGCCGAAAAA > NC_002947/2473137‑2473432 | gagaGGTTCCAGTCGTCCGTGATGTCGTGGTCATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCt < 2:155034/149‑1 (MQ=255) ggTTCCAGTCGTCCGTGATGTCGTGGTCATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGc < 7:239813/149‑1 (MQ=255) ccAGTCGTCCGTGATGTCGTGGTCATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCg < 2:183412/148‑1 (MQ=255) aGTCGTCCGTGATGTCGTGGTCATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCTAAGACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGc > 1:95343/1‑149 (MQ=255) aGTCGTCCGTGATGTCGTGGTCATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTg > 8:80911/1‑149 (MQ=255) cATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCcggtgccctggcagctggtggacctgggaatc > 2:116152‑M1/1‑117 (MQ=255) cATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGc > 6:92519/1‑149 (MQ=255) tCGTAGATCTTCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTGGGGAAACCCGTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCCTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCt < 1:222191/148‑1 (MQ=255) cGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGc > 1:151592/1‑149 (MQ=255) gAAGATCATCATGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCAGCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCTGCGGGAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGc < 2:36994/148‑1 (MQ=255) gAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATCCCCAGGTCCACCAGCTGcc < 6:355/149‑1 (MQ=255) aGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAg < 3:191782/149‑1 (MQ=255) gATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAgg < 4:94137/149‑1 (MQ=255) tcaGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCAcc > 5:70542/1‑149 (MQ=255) cagggcaggTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGgcga > 3:225418‑M2/1‑145 (MQ=255) cagggcaggTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGgcga > 7:80911‑M2/1‑145 (MQ=255) ggcaggTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCcggtgccctggcagctggtggacctgggaatccccagcgggctcagcgacga < 4:213371‑M1/149‑53 (MQ=255) gcaggTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCcggtgccctggcagctggtggacctgggaatccccagcgggctcagcgacgag < 1:116152‑M1/149‑54 (MQ=255) aggTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCacac > 5:157571/1‑149 (MQ=255) ccATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCAGCGACCACACCAACAgg < 2:151592/149‑1 (MQ=255) aCCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACAt > 6:158695/1‑149 (MQ=255) gcgcCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGcc < 5:247069/149‑1 (MQ=255) gcgcCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGc > 6:247069/1‑148 (MQ=255) gcCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTTCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCAt < 1:225881/149‑1 (MQ=255) cACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGGCCACACCAACAGGTACATGGCCATGa > 1:7304/1‑149 (MQ=255) cACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAAc < 1:129302/133‑1 (MQ=255) cACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAAc > 2:129302/1‑133 (MQ=255) cACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGa < 5:92519/149‑1 (MQ=255) cT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACtt > 1:190251/1‑149 (MQ=255) cT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACtt > 6:89004/1‑149 (MQ=255) t‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTc > 5:2892/1‑149 (MQ=255) aCCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTc < 2:95343/147‑1 (MQ=255) ccGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGc < 5:6566/149‑1 (MQ=255) cGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGc > 6:23656/1‑148 (MQ=255) cGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGc > 7:162788/1‑148 (MQ=255) gaTTGACGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAg > 3:266371/1‑149 (MQ=255) aTTGTCGGCAATCCCCTGGATGAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGGCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAg < 7:229021/148‑1 (MQ=255) tGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCAt > 3:211430/1‑133 (MQ=255) tGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCAt < 4:211430/133‑1 (MQ=255) gCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAg < 5:158695/149‑1 (MQ=255) gCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAg > 7:87144/1‑149 (MQ=255) aCCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGGCCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAggtgg < 2:7304/149‑1 (MQ=255) cTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGt > 2:177674/1‑149 (MQ=255) gATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCgg < 7:219983/149‑1 (MQ=255) gATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCg < 5:89004/148‑1 (MQ=255) ttGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCGGCGTTGCTGGACga < 8:162788/147‑1 (MQ=255) gCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGc < 8:262860/109‑1 (MQ=255) gCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCGGCGTTGCTGGACgag < 6:2892/146‑1 (MQ=255) gCTGGTATCGGGCTGGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGc > 7:262860/1‑109 (MQ=255) gTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCGGCGTTGCTGGACGAGAAGATc < 8:87144/148‑1 (MQ=255) gTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCGGCGTTGCTGGACGAGAAGATc < 4:266371/148‑1 (MQ=255) cTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGgcgacgagcatcaagcccgataccagcaagagctgccgctgatccaggggtttgccgacaatctcggtcaggtggcgcgggtgatggcccacctgc < 1:116152‑M2/149‑97 (MQ=255) tcgtcgCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGgcgacgagcatcaagcccgataccagcaagagctgccgctgatccaggggtttgccgacaatctcggtcaggtggcgcgggtgatggcccacctgcc < 4:213371‑M2/149‑98 (MQ=255) tcgCcggtgccctggcagctggtggacctgggaatccccagcgggctcagcgacgagcatcaagcccgataccagcaagagctgccgctgatccaggggtttgccgacaatctcggtcaggtggcgcgggtgatggcccacctgccctg > 7:80911‑M1/1‑4 (MQ=255) tcgCcggtgccctggcagctggtggacctgggaatccccagcgggctcagcgacgagcatcaagcccgataccagcaagagctgccgctgatccaggggtttgccgacaatctcggtcaggtggcgcgggtgatggcccacctgccctg > 3:225418‑M1/1‑4 (MQ=255) cTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTAGATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCGGCGATGCTGGACGAGAACATCGGCTTGCGCTTGCCGCCGaaaaa > 8:172751/1‑149 (MQ=255) | GAGAGGTTCCAGTCGTCCGTGATGTCGTGGTCATCGAAGATCATCAGGCAGGGCAGGTGGGCCATCACCCGCGCCACCT‑‑GACCGAGATTGTCGGCAAACCCCTGGATCAGCGGCAGCTCTTGCTGGTATCGGGCTTGATGCTCGTCGCTGAGCCCGCTGGGGATTCCCAGGTCCACCAGCTGCCAGGGCACCGGCGACCACACCAACAGGTACATGGCCATGACTTCGGCGAAGGTCACCAGGTGGTTGTCGGCGTTGCTGGACGAGAAGATCGGCTTGCGCTTGCCGCCGAAAAA > NC_002947/2473137‑2473432 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |