New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3710437 = | 46 (0.940) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.4% | coding (509/534 nt) | paaD | 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit D |
? | NC_002947 | 3710487 = | 44 (0.950) | coding (459/534 nt) | paaD | 1,2‑phenylacetyl‑CoA epoxidase subunit D |
GAAGCGGAACTGGCCCTGCAGGTGCTCGGGCACATCGAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTGCGCTTGCTGGCGCTGCCTTGCG > NC_002947/3710289‑3710584 | gatcaccgaactgggccgcgagcgcctgcgcgcttatggcattgcgccgccgcaaggcagcgccagcaagcgcagcctgctcggcgaagccccccaggtgtgctgcccgcaatgcggcagcgcccataccgaattgctcagccagttcg < 5:241531‑M1/1‑1 (MQ=255) atcaccgaactgggccgcgagcgcctgcgcgcttatggcattgcgccgccgcaaggcagcgccagcaagcgcagcctgctcggcgaagccccccaggtgtgctgcccgcaatgcggcagcgcccataccgaattgctcagccagttcgg > 7:147023‑M1/148‑149 (MQ=255) cgaactgggccgcgagcgcctgcgcgcttatggcattgcgctgccgcaaggcagcgccagcaagcgcagcctgctcggcgaagccccccaggtgtgctgcccgcaatgcggcagcgcccataccgaattgctcagccagttcGGCTCCa < 8:288525‑M1/7‑1 (MQ=255) tGGCCCTGCAGGTGCTCGGGCACATCGAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCa > 2:177402/1‑149 (MQ=255) gCCCTGCAGGTGCTCGGGCCCATCGAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGGCTCATTGCGCACTTGCTTGATGTTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTAAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACt > 2:273046/1‑149 (MQ=255) gTGCTCGGGCACATCGAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGc > 7:246658/1‑149 (MQ=255) aTCGAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCt > 8:74137/1‑149 (MQ=255) aTCGAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCt > 8:20579/1‑149 (MQ=255) gAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGc < 1:273046/149‑1 (MQ=255) aGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCa < 8:128810/148‑1 (MQ=255) ggCAATCGATCCGGCATAACGGGGCTCATTCCGCAGTTGCTTGATGGTCAGGCTGTTAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCAGGGTTCAAATGCTTTTGAAATTGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCTGTACTGCGCGTTGCAgg < 2:88905/149‑1 (MQ=255) aaTCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCg > 3:226809/1‑149 (MQ=255) aTCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGt < 6:135263/149‑1 (MQ=255) cGATACCGCATCACCGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGAACTCGCCCCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTg > 6:135850/1‑148 (MQ=255) cgccgcaaggcagcgccagcaagcgcagcctgctcggcgaagccccccaggtgtgctgcccgcaatgcggcagcgcccataccgaattgctcagccagttcTGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑Ag > 4:8282‑M1/102‑149 (MQ=255) aTACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑Ag < 7:251610/149‑1 (MQ=255) aTACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑Ag > 1:115027/1‑149 (MQ=255) aTACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑Ag > 4:280767/1‑149 (MQ=255) ccGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGcc < 4:226809/148‑1 (MQ=255) cGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCg > 6:241531/1‑148 (MQ=255) cGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCg > 4:56068/1‑148 (MQ=255) aTCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACt < 7:20579/149‑1 (MQ=255) cGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCt < 3:5160/149‑1 (MQ=255) gggTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCt > 1:144404/1‑148 (MQ=255) gccagcaagcgcagcctgctcggcgaagccccccaggtgtgctgcccgcaatgcggcagcgcccataccgaattgctcagccagttcGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGc > 4:132727‑M1/88‑136 (MQ=255) gccagcaagcgcagcctgctcggcgaagccccccaggtgtgctgcccgcaatgcggcagcgcccataccgaattgctcagccagttcGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGc < 3:132727‑M1/49‑1 (MQ=255) aTTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAAtt < 7:74137/149‑1 (MQ=255) gcACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTa > 4:69363/1‑149 (MQ=255) aCTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATg > 6:67002/1‑149 (MQ=255) ttgATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCt > 2:79910/1‑149 (MQ=255) aTGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAg < 5:113413/87‑1 (MQ=255) aTGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAg > 6:113413/1‑87 (MQ=255) tGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCg < 1:177402/149‑1 (MQ=255) ggcAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCGCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGc < 4:254271/146‑1 (MQ=255) gTCAGGCTGTGAAACTGGCTCAGGGGGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGGCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGGGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGc < 4:258618/148‑1 (MQ=255) tgAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCggg > 5:201652/1‑147 (MQ=255) cTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTTAAATAGGCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACATCGCCTTGCAGGCCGTGGCCGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGcac < 1:79910/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTgggg > 6:151882/1‑149 (MQ=255) aTGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTggg < 3:280767/148‑1 (MQ=255) gtCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTc > 4:254958/1‑149 (MQ=255) cACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGcc < 3:56068/147‑1 (MQ=255) cACGGCGCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGGCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGcc < 2:115027/147‑1 (MQ=255) gCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAg > 2:50143/1‑149 (MQ=255) cTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGTCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCTGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAgg < 5:135850/149‑1 (MQ=255) cTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAgg < 8:246658/149‑1 (MQ=255) tCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAgg > 8:159662/1‑148 (MQ=255) tGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTgcgc < 5:67002/149‑1 (MQ=255) gAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTGCGCTTGCTgg > 3:206043/1‑149 (MQ=255) aaaTAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTGCGCTTGCTGgc > 7:288525/1‑149 (MQ=255) aTAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCg > 3:18524/1‑124 (MQ=255) aTAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCg < 4:18524/124‑1 (MQ=255) gTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTGCGCTTGCTGGCGCTGc > 5:240466/1‑149 (MQ=255) gAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGc > 6:159819/1‑89 (MQ=255) gAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGc < 5:159819/89‑1 (MQ=255) gAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTGCGCTTGCTGGCGCTGCCtt > 8:100706/1‑149 (MQ=255) aTGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGc < 4:281820/92‑1 (MQ=255) aTGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGc > 3:281820/1‑92 (MQ=255) tGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTGCGCTTGCTGGCGCTGCCTTgcg < 6:201652/149‑1 (MQ=255) | GAAGCGGAACTGGCCCTGCAGGTGCTCGGGCACATCGAAGGCAATCGATACCGCATCACGGGTCTCATTGCGCACTTGCTTGATGGTCAGGCTGTGAAACTGGCTCATGGTGGTCTCCACGGCTCAAATGCATTTGAAATAGTCGAATGGCTCCAGGCACTCGCGGCAGCGGTACAGCGCCTTGCAGGCCGTGG‑AGCCGAACTGGCTGAGCAATTCGGTATGGGCGCTGCCGCATTGCGGGCAGCACACCTGGGGGGCTTCGCCGAGCAGGCTGCGCTTGCTGGCGCTGCCTTGCG > NC_002947/3710289‑3710584 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |