New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3926334 = | 28 (0.570) | 3 (0.060) | 3/256 | NT | 9.6% | coding (157/1629 nt) | peaA | quinohemoprotein amine dehydrogenase subunit alpha |
? | NC_002947 | 3926390 = | 29 (0.610) | coding (101/1629 nt) | peaA | quinohemoprotein amine dehydrogenase subunit alpha |
GCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCTTATCGTTTTCGCACGCTTTGGTA > NC_002947/3926188‑3926476 | aacgcttttaccctaactggcacagttcctgtatcacaaccgtcacatgcacacctgctgtaccaaagcgtgcgaaaacgataagaacaacaaccgtggaggtctgaccttgaagacgactcgactccggcggcatgcgggcaaactgg < 5:223597‑M1/2‑1 (MQ=255) aTCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTTCCGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGccc < 1:222787/148‑1 (MQ=255) gAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCg > 7:135583/1‑149 (MQ=255) gAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCg > 7:46040/1‑149 (MQ=255) ggCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGgcc < 7:182396/149‑1 (MQ=255) atgagCATCGCCCGCATGCAGGTGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGAGGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGgccgc > 6:256768/5‑149 (MQ=255) gCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATg > 3:45348/1‑149 (MQ=255) cATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATg < 8:46040/148‑1 (MQ=255) cATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTg < 8:135583/148‑1 (MQ=255) gCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCAGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCCGTTGTGCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCt > 6:167840/1‑147 (MQ=255) cctgctgtaccaaagcgtgcgaaaacgataagaacaacaaccgtggaggtctgaccttgaagacgactcgactccggcggcatgcgggcaaactGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAgcgc > 4:1103‑M1/95‑149 (MQ=255) ccGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCa < 5:256768/147‑1 (MQ=255) tCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGccc > 4:130698/1‑149 (MQ=255) ttGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCg > 4:143681/1‑148 (MQ=255) tggtggCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATgccg > 6:313602/1‑149 (MQ=255) gtggCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTTCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACATGCTCGGTCCCTGCTCGTCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATgccgcc < 5:167840/149‑1 (MQ=255) ataagaacaacaaccgtggaggtctgaccttgaagacgactcgactccggcggcatgcgggcaaactGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCa > 4:110495‑M1/68‑124 (MQ=255) ataagaacaacaaccgtggaggtctgaccttgaagacgactcgactccggcggcatgcgggcaaactGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCa < 3:110495‑M1/57‑1 (MQ=255) gtgtCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTc > 6:223597/1‑147 (MQ=255) tCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGgagtcg > 7:242414/1‑134 (MQ=255) tCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGgagtcg < 8:242414/134‑1 (MQ=255) ggATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAAGAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACgg < 3:130698/149‑1 (MQ=255) ggCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGgttg > 8:97482/1‑146 (MQ=255) ggCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGgttg < 7:97482/146‑1 (MQ=255) gCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCAGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGAACTCCACGGTTGTTNTTCTTATCGt > 6:240238/1‑149 (MQ=255) ttGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCTTATCGTTTTc > 4:92189/1‑149 (MQ=255) gCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCTTATCGTTTTCGCACGCt > 4:218427/1‑149 (MQ=255) gCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCTTATCGTTTTCGCACGCt > 4:141969/1‑149 (MQ=255) cAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCTTATCGTTTTCGCACGCtt > 3:37877/1‑149 (MQ=255) aaCAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCGTATCGTTTTCGCACGCttt > 7:140704/1‑149 (MQ=255) cAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGt < 4:268366/105‑1 (MQ=255) cAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGt > 3:268366/1‑105 (MQ=255) ggCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCTTATCGTTTTCGCACGCTTTGGTa < 3:141969/149‑1 (MQ=255) gCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACg > 2:257627/1‑114 (MQ=255) | GCTGATCTGAAGGCCATGCATCACCTGCATGCGGGCGATGCTCATCAGCCAGCCTTCCGGTGTCTTGCGCTGGTGGCTGATGCGGCTATAGGTGTCGTTGCCTT‑CGGGGATATGGCACCCCATGCACTTGTTCTGCAACAGGCTCGGGCCCTGCTCGGCCGCCATGGCCTGGGTGCTCAGCAGCGCGGCGGCGACCAGCGCCAGTTTGCCCGCATGCCGCCGGAGTCGAGTCGTCTTCAAGGTCAGACCTCCACGGTTGTTGTTCTTATCGTTTTCGCACGCTTTGGTA > NC_002947/3926188‑3926476 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |