New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4095364 | 51 (1.040) | 3 (0.060) | 3/248 | NT | 6.0% | coding (120/765 nt) | PP_3603 | GntR family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 4095423 | 45 (0.970) | coding (61/765 nt) | PP_3603 | GntR family transcriptional regulator |
CCGGTGCATCCAGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCTCATCATAGCG > NC_002947/4095216‑4095509 | ccGGTGCATCCAGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGC > 4:34829‑M1/1‑149 (MQ=255) ggTGCATCCAGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATCATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCtt < 4:85163/149‑1 (MQ=255) gTGCATCCAGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCtt > 6:60379/1‑148 (MQ=255) aTGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGa < 4:235501/149‑1 (MQ=255) tACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATg < 3:34829/149‑1 (MQ=255) cGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGt > 1:178613/1‑149 (MQ=255) gATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGtt < 1:137381/149‑1 (MQ=255) gATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGtt < 5:60379/149‑1 (MQ=255) gATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGtt < 1:142080/149‑1 (MQ=255) gCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGc < 1:68716/148‑1 (MQ=255) ctACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGAc > 3:42723/1‑148 (MQ=255) ccTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCTCCTCACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGAcc < 1:102495/148‑1 (MQ=255) ccTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGAcc < 5:60457/146‑1 (MQ=255) gCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGtt < 3:138744/126‑1 (MQ=255) gCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGtt > 4:138744/1‑126 (MQ=255) gCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTcc > 8:12143/1‑149 (MQ=255) cccGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTc < 7:115039/147‑1 (MQ=255) cggcggCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTgg > 3:188112/1‑149 (MQ=255) ggcggcCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTggg < 4:81872/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc > 2:14804/1‑149 (MQ=255) cggcCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGcc < 4:42723/149‑1 (MQ=255) cggcCTGCAACCGCGAGATCGACTCACACAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGcc > 8:144137/1‑149 (MQ=255) cTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGAc > 1:137825/1‑149 (MQ=255) tGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAAt < 5:231859/110‑1 (MQ=255) tGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAAt > 6:231859/1‑110 (MQ=255) cAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgc < 7:214554‑M2/149‑3 (MQ=255) cAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgc < 5:55779‑M2/149‑3 (MQ=255) ccGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcg < 1:305675‑M1/149‑65 (MQ=255) aTCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTgcg > 5:117506/1‑149 (MQ=255) gCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGcc < 6:117506/148‑1 (MQ=255) ccTCACGCCC‑‑CCCCGTGCGTCTGCCGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCgg < 8:64464/149‑1 (MQ=255) ccTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCgg < 1:149277/149‑1 (MQ=255) ccTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCgg > 2:1712/1‑149 (MQ=255) gCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCtt < 8:41886/149‑1 (MQ=255) aCTTACTCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTGTGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GAGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCTGACTGCGCGGCTTGCGCGGGGTCCTTGCCTGTACctgct < 8:214554/149‑1 (MQ=255) aCTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACctgct < 6:55779/149‑1 (MQ=255) cTGACGCCCTCTTCAGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACctgctg > 8:214057/1‑149 (MQ=255) tGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcgg > 6:253293‑M1/1‑53 (MQ=255) tGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcgg < 5:253293‑M1/118‑66 (MQ=255) aCGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGctc > 6:261841/1‑149 (MQ=255) gCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCTAGGCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGctc > 1:246306/1‑149 (MQ=255) ccTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc > 4:270196/1‑100 (MQ=255) ccTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGc < 3:270196/100‑1 (MQ=255) ccTCTTCAGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTc < 7:214057/149‑1 (MQ=255) tctTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCAt > 2:272687/1‑149 (MQ=255) cGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCAtt < 1:272687/146‑1 (MQ=255) ggCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGccc < 2:137825/149‑1 (MQ=255) ggCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGccc > 1:16302/1‑149 (MQ=255) ggCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGcc < 4:188112/148‑1 (MQ=255) gCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCt < 1:1712/149‑1 (MQ=255) gCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTAGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCt > 2:249171/1‑149 (MQ=255) cATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTg > 1:14775/1‑148 (MQ=255) tCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgc > 7:137880‑M2/1‑91 (MQ=255) tCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgc < 8:137880‑M2/95‑5 (MQ=255) tCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCATGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTc > 5:282843/1‑149 (MQ=255) cggtcggCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTGCTGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGAGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTg < 5:285295/123‑1 (MQ=255) ggCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAg > 4:147920/1‑149 (MQ=255) gccgcGCTTTAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTc < 7:174416/124‑1 (MQ=255) gccgcGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTc > 8:174416/1‑124 (MQ=255) gccgcGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCTCATCATa < 2:14775/149‑1 (MQ=255) ccgcGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtca > 6:253293‑M2/1‑65 (MQ=255) ccgcGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtca < 5:253293‑M2/118‑54 (MQ=255) ccgcGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCTCATCATAg > 3:276172/1‑149 (MQ=255) cgcgCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTgcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtcagtcgcacggtggtgcgtgaggcgatctcgcgg < 1:305675‑M2/149‑86 (MQ=255) gcgcagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcaga > 7:137880‑M1/1‑4 (MQ=255) gcgcagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcaga < 8:137880‑M1/95‑92 (MQ=255) gcagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtcagtcgcacggtggtgcgtgaggcgatctcgcggttg < 5:55779‑M1/149‑148 (MQ=255) gcagtctggcccaggaactggtcacggtgctgaccgaacgcattcgcagcggccagctcaagcgcggcgacaagctgccgaccgaatcgcagatcatggccgaagagggcgtcagtcgcacggtggtgcgtgaggcgatctcgcggttg < 7:214554‑M1/149‑148 (MQ=255) | CCGGTGCATCCAGCACGAATGTACCGATGCCGTGGCGAGTCTCTACCTGCCCGGCGGCCTGCAACCGCGAGATCGCCTCACGCAC‑‑CACCGTGCGACTGACGCCCTCTTCGGCCATGATCTGCGATTCGGTCGGCAGCTTGTCGCCGCGCTTGAGCTGGCCGCT‑‑GCGAATGCGTTCGGTCAGCACCGTGACCAGTTCCTGGGCCAGACTGCGCGGCTTGCGCCGGGTCCTTGCCTGTACCTGCTGCTCTGTCATTGCCCTGTATTTCACCTTGGAAGACAGCGCTCATCATAGCG > NC_002947/4095216‑4095509 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |