New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 4639237 | 42 (0.860) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 7.1% | coding (541/696 nt) | PP_4104 | glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | = 4639263 | 38 (0.810) | coding (515/696 nt) | PP_4104 | glutathione S‑transferase family protein |
AGGCCACGCTGCACGGCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCAAAGAAATGGAAGAACCCGACCTG > NC_002947/4639098‑4639384 | aGGCCACGCTGCACGGCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGt < 7:41697/148‑1 (MQ=255) ggCCACGCTGCACGGCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTAt > 1:50260/1‑149 (MQ=255) aCGCTGCACGGCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCt < 3:808/149‑1 (MQ=255) gCTGCACGGCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCa < 2:16538/149‑1 (MQ=255) aCGGCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCAt < 2:56441/149‑1 (MQ=255) ggCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGAGGGCGATGTCGGCGAAGCTGTATTCCTAAGCCATc > 7:202203/1‑148 (MQ=255) gCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTgc > 7:20548‑M2/1‑147 (MQ=255) ccGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTgcc > 3:169123‑M2/1‑146 (MQ=255) cGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGAcc < 4:104097/148‑1 (MQ=255) cGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCATTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCagtggatggctgaggaatacagcatcgccgaca < 1:276442‑M1/148‑34 (MQ=255) agtaaaTTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCttt > 2:308609/4‑149 (MQ=255) aGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCagtggatggctgaggaatacagcatcgccgacat < 1:132614‑M1/147‑35 (MQ=255) aGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCagtggatggctgaggaatacagcatcgccgacat > 2:132614‑M1/1‑113 (MQ=255) aGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCttt < 3:114376/149‑1 (MQ=255) gAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCa < 2:274467/149‑1 (MQ=255) aTTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAAt < 1:152329/149‑1 (MQ=255) ccAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACTGGGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCAAAGGGAAGATGGCGATGTCGCCGATGATGTATTCCTCAGCCATCAACTGCCGACCTTTCAAATGcc > 1:178947/1‑148 (MQ=255) aGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATc < 2:50260/149‑1 (MQ=255) aGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATc > 6:313629/1‑149 (MQ=255) gcTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTATAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCacccc > 1:68179/1‑144 (MQ=255) cTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCagcagc < 7:224725/148‑1 (MQ=255) ttGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCg > 3:111942/1‑149 (MQ=255) gAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTa > 7:207627/1‑90 (MQ=255) gAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTa < 8:207627/90‑1 (MQ=255) aCT‑GGTCGAAGCCGACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACGAGGTTACGCACCCAAGGGAATATGGCCTTGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTg < 7:113786/149‑1 (MQ=255) cGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCg > 4:20060/1‑149 (MQ=255) cGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCg > 8:198820/1‑149 (MQ=255) gAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGa < 5:259017/118‑1 (MQ=255) gAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGa > 6:259017/1‑118 (MQ=255) gAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCg < 5:313629/148‑1 (MQ=255) ccaGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAg < 2:293432/149‑1 (MQ=255) gTCACGTGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGt < 4:211133/149‑1 (MQ=255) gggCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTcgcgc > 1:281290/1‑149 (MQ=255) gCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCgg < 2:281290/149‑1 (MQ=255) tAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCtt < 7:198820/149‑1 (MQ=255) tAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCtt < 3:20060/149‑1 (MQ=255) aatcgcTCCACCAGGATACCCCCCCAACGTAAGATGGCGATGGCGCCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAATTGCCGCTCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCtt < 8:202203/146‑1 (MQ=255) aGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATa < 5:301395/130‑1 (MQ=255) aGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATa > 6:301395/1‑130 (MQ=255) cTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCgg < 4:223358/138‑1 (MQ=255) cTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCgg > 3:223358/1‑138 (MQ=255) gCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGc > 2:45698/1‑147 (MQ=255) gCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGc < 1:45698/147‑1 (MQ=255) gCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGc > 5:55706/1‑147 (MQ=255) aCCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAg > 2:150296/1‑148 (MQ=255) aaGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCa > 6:50884/1‑146 (MQ=255) ggAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCAAAGaaa < 2:178947/149‑1 (MQ=255) aTGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTgccgacatcgccatcttcccttgggtgcgtaacctggtggagcgctacaacgcccgtgacctggtgggcttcgaccagttcaaggaagtgcagcgcgtgctggcgaatttcct > 2:132614‑M2/1‑34 (MQ=255) aTGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTgccgacatcgccatcttcccttgggtgcgtaacctggtggagcgctacaacgcccgtgacctggtgggcttcgaccagttcaaggaagtgcagcgcgtgctggcgaatttcct < 1:132614‑M2/147‑114 (MQ=255) tGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTgccgacatcgccatcttcccttgggtgcgtaacctggtggagcgctacaacgcccgtgacctggtgggcttcgaccagttcaatgaagtgcagcgcgtgctggcgaatttcctcg < 1:276442‑M2/148‑116 (MQ=255) tCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCAAAGAAATGGAAGAACCCGAc > 2:16061/1‑149 (MQ=255) tCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCAAAGAAATGGAAGAACCCGAc < 5:50884/149‑1 (MQ=255) ggCagtggatggctgaggaatacagcatcgccgacatcgccatcttcccttgggtgcgtaacctggtggagcgctacaacgcccgtgacctggtgggcttcgaccagttcaaggaagtgcagcgcgtgctggcgaatttcctcgaacgg > 3:169123‑M1/1‑3 (MQ=255) ggCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCAGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCAAAg > 3:149177/1‑130 (MQ=255) ggCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCAGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCAAAg < 4:149177/130‑1 (MQ=255) gCagtggatggctgaggaatacagcatcgccgacatcgccatcttcccttgggtgcgtaacctggtggagcgctacaacgcccgtgacctggtgggcttcgaccagttcaaggaagtgcagcgcgtgctggcgaatttcctcgaacggc > 7:20548‑M1/1‑2 (MQ=255) | AGGCCACGCTGCACGGCTGGCCGTTCGAGGAAATTCGCCAGCACGCGCTGCACTTCCTTGAACT‑GGTCGAAGCCCACCAGGTCACGGGCGTTGTAGCGCTCCACCAGGTTACGCACCCAAGGGAAGATGGCGATGTCGGCGATGCTGTATTCCTCAGCCATCCACTGCCGACCTTTCAAATGCCGATCCAGCACGCCCAGCAGCCGCTTGGACTCGTTGACATAGCGGTCGCGCGGGCGCTTGTCTTCATATTCCTTGCCAGCAAAGAAATGGAAGAACCCGACCTG > NC_002947/4639098‑4639384 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |