| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 4972591 = | 53 (1.080) | 5 (0.110) | 5/252 | NT | 9.0% | coding (957/1566 nt) | flgL | flagellar hook‑associated protein FlgL |
| ? | NC_002947 | 4972629 = | 50 (1.060) | coding (919/1566 nt) | flgL | flagellar hook‑associated protein FlgL | |||||
TACCCGAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGC > NC_002947/4972446‑4972738 | ttcgacgtcaataccgaaggcggcaagatgatctcgctgcgcggtgtcgacttcgagatcaacctgaacctggcggaaggtgacgatgctgacgccgtcgttgccggccatgtgttcaccctcgaagccaagcccgataccctcaCTgc < 4:95779‑M1/4‑1 (MQ=255)tACCCGAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCt < 4:46193/147‑1 (MQ=255)tACCCGAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTgc > 1:104037/1‑149 (MQ=255) tcgacgtcaataccgaaggcggcaagatgatctcgctgcgcggtgtcgacttcgagatcaacctgaacctggcggaaggtgacgatgctgacgccgtcgttgccggccatgtgttcaccctcgaagccaagcccgataccctcaCTgc < 7:94904‑M1/4‑1 (MQ=255) aCCCGAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTgcg > 5:241973/1‑149 (MQ=255) ccGAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCGTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGGAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGcc > 6:311788/1‑149 (MQ=255) cGAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCg > 2:182992/1‑149 (MQ=255) gAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCAGGTGACCGGCACCAgcgttac < 1:26099/149‑5 (MQ=255) caataccgaaggcggcaagatgatctcgctgcgcggtgtcgacttcgagatcaacctgaacctggcggaaggtgacgatgctgacgccgtcgttgccggccatgtgttcaccctcgaagccaagcccgataccctcaCTGCGCCGTCGa < 2:190255‑M1/12‑1 (MQ=255) cAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGAc > 4:104829/1‑149 (MQ=255) aaTCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACg > 4:130869/1‑149 (MQ=255) aaTCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACg < 3:21730/149‑1 (MQ=255) aTCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACgc > 3:47306/1‑148 (MQ=255) tCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCt < 3:130869/149‑1 (MQ=255) tGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTc > 3:31844/1‑149 (MQ=255) cGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCa < 6:241973/148‑1 (MQ=255) ggCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGCGTAGCGCGGGCAACCCGTCgacgg < 4:47306/149‑5 (MQ=255) gctgcgcggtgtcgacttcgagatcaacctgaacctggcggaaggtgacgatgctgacgccgtcgttgccggccatgtgttcaccctcgaagccaagcccgataccctcaCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCa > 5:14334‑M1/111‑147 (MQ=255) cgcggtgtcgacttcgagatcaacctgaacctggcggaaggtgacgatgctgacgccgtcgttgccggccatgtgttcaccctcgaagccaagcccgataccctcaCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAgg > 1:190255‑M1/107‑149 (MQ=255) cgcATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAg < 1:182992/147‑1 (MQ=255) cAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCgg < 5:38691/149‑1 (MQ=255) agagAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTAGCTTCGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGCTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCTCGCTACGCGTCGCAGTGACGGTATCggg > 1:183774/1‑149 (MQ=255) agaATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGa < 4:250650/108‑1 (MQ=255) agaATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGa > 3:250650/1‑108 (MQ=255) agaATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGggct > 5:270769/1‑149 (MQ=255) ttcgagatcaacctgaacctggcggaaggtgacgatgctgacgccgtcgttgccggccatgtgttcaccctcgaagccaagcccgataccctcaCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTg > 4:25897‑M1/95‑134 (MQ=255) ttcgagatcaacctgaacctggcggaaggtgacgatgctgacgccgtcgttgccggccatgtgttcaccctcgaagccaagcccgataccctcaCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTg < 3:25897‑M1/40‑1 (MQ=255) tCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTc > 1:247550/1‑149 (MQ=255) ggTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTc < 1:29305/147‑1 (MQ=255) ggTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGa < 7:292485/149‑1 (MQ=255) tgtCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAgg < 2:111931/149‑1 (MQ=255) tCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGt > 3:187802/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTg > 1:215744/1‑148 (MQ=255) cTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGaa < 7:92019/149‑1 (MQ=255) tGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAac < 2:247550/149‑1 (MQ=255) gTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGggctt < 1:115954/131‑1 (MQ=255) gTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGggctt > 2:115954/1‑131 (MQ=255) aaGCGTATCACCGCGCAGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACAt < 6:275662/148‑1 (MQ=255) aGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATgg > 4:266280/1‑149 (MQ=255) gCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGt > 2:82903/1‑138 (MQ=255) gCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGt < 1:82903/138‑1 (MQ=255) gATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCgg < 4:187802/149‑1 (MQ=255) tCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGc < 2:215744/148‑1 (MQ=255) gcgcCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAacgac < 2:104037/149‑1 (MQ=255) cgcCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAacgacg > 8:283750/1‑149 (MQ=255) ggtGCTGGGGAAGGTGCGACGGTAAGCTGCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGCGCGTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGt < 5:311788/147‑1 (MQ=255) cTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAg > 5:102217/1‑148 (MQ=255) gggAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATTGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCa < 3:104829/147‑1 (MQ=255) ggAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCCACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTg < 6:183099/116‑1 (MQ=255) ggAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCCACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTg > 5:183099/1‑116 (MQ=255) cTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCtt > 5:259933/1‑148 (MQ=255) cTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCtt < 6:259933/148‑1 (MQ=255) cGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGc < 1:302524/149‑1 (MQ=255) tAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTCGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCcag > 4:169754/1‑149 (MQ=255) cTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCcaggtt > 2:181469/1‑148 (MQ=255) ttCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCcaggtt > 2:55350/1‑147 (MQ=255) ccGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCcaggttcag < 1:137325/148‑1 (MQ=255) cGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCctggttcaggt < 4:31844/149‑1 (MQ=255) tCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGAt > 3:281661/1‑149 (MQ=255) ggTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGAtc < 7:283750/148‑1 (MQ=255) tAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGACAGGTTCAGGTTGATCTCg < 6:270769/149‑1 (MQ=255) tcGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCTCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGaa < 2:183774/148‑1 (MQ=255) gCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGt > 5:169842/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGa < 6:102217/148‑1 (MQ=255) gTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACcgcg > 1:69941/1‑149 (MQ=255) aCCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAg < 1:181469/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGc > 3:95779/1‑149 (MQ=255) CTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGc < 8:94904‑M1/148‑1 (MQ=255) | TACCCGAGCCAATCGGCTTGCTGTCGGCACTGTACGGCTGCGCATACAGAGAATACTCGGTGTCGCTGGTGAAGCGGATCACCGCGCCGTTGCTTGGGAAGGTGCTACGGTAAGCTTCCGGGTCGGTAACGCTGGTGCCGGTCACCTGCGCCGTCGACGGGTTGCCCGCGCTACGCGTCGCAGTGAGGGTATCGGGCTTGGCTTCGAGGGTGAACACATGGCCGGCAACGACGGCGTCAGCATCGTCACCTTCCGCCAGGTTCAGGTTGATCTCGAAGTCGACACCGCGCAGC > NC_002947/4972446‑4972738 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |