| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5574364 | 65 (1.330) | 4 (0.090) | 4/252 | NT | 5.9% | coding (930/1041 nt) | motB | flagellar motor rotation protein |
| ? | NC_002947 | = 5574393 | 64 (1.360) | coding (901/1041 nt) | motB | flagellar motor rotation protein | |||||
GTGGTGGGTGGCACAGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATACGGCGGTTGACC > NC_002947/5574216‑5574511 | gtggtgGGTGGCACAGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑C > 8:41942‑M1/1‑149 (MQ=255)gtggtgGGTGGCACAGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑C > 5:64018‑M1/1‑149 (MQ=255) gtgggtggCACAGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGt > 7:217329/1‑149 (MQ=255) tgggtggCACAGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTg > 2:12910/1‑149 (MQ=255) ggtggCACAGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGc < 4:293477/148‑1 (MQ=255) acaGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTAGTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGcc > 4:280866/1‑149 (MQ=255) gCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTgg < 7:216990/148‑1 (MQ=255) gCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGAGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGgc > 6:157183/1‑149 (MQ=255) ccACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGgcgc < 7:41942/149‑1 (MQ=255) cACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGgcg > 3:94963/1‑147 (MQ=255) aCCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCgcag < 7:168100/149‑1 (MQ=255) cccAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGcac > 3:222289/1‑149 (MQ=255) aaaaGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGcaccac < 1:296695/149‑1 (MQ=255) aaaGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCAct > 5:189926/1‑149 (MQ=255) gCCGCTTAGTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTggc > 3:280866‑M2/1‑146 (MQ=255) ccGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTggct < 8:95110‑M2/149‑5 (MQ=255) gCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑Cagtggtgctgcgccaggggcttcggcaccggctga < 4:18777‑M1/149‑36 (MQ=255) aCTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑Cagtggtgctgcgccaggggcttcggcaccggctgaccc < 6:107371‑M1/148‑39 (MQ=255) aCTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTgg < 5:181586/127‑1 (MQ=255) aCTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGCTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTgg > 6:181586/1‑127 (MQ=255) cTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTg < 6:64018/149‑1 (MQ=255) cTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGgcg < 2:249273/135‑1 (MQ=255) cTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGgcg > 1:249273/1‑135 (MQ=255) cTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGtt > 6:13582/1‑149 (MQ=255) ttCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGgcgc < 2:17439/117‑1 (MQ=255) ttCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGgcgc > 1:17439/1‑117 (MQ=255) ttCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTg > 3:148830/1‑149 (MQ=255) catccatcTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTg < 6:145077/147‑1 (MQ=255) catccatcTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTg < 5:13582/147‑1 (MQ=255) catcTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAg < 6:189926/149‑1 (MQ=255) atcTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGgc < 4:199520/144‑1 (MQ=255) atcTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGgc > 3:199520/1‑144 (MQ=255) aGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCGCCTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCg < 1:12910/149‑1 (MQ=255) tGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCTCTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGtt < 1:129021/149‑1 (MQ=255) ccATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTc > 7:195965/1‑149 (MQ=255) cATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCt > 7:52102/1‑137 (MQ=255) cATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCt < 8:52102/137‑1 (MQ=255) cATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTcc > 7:63113/1‑149 (MQ=255) tCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCgg > 6:109869/1‑149 (MQ=255) ttCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑Cagtggtgctgcgccaggggcttcggcaccggctgac > 3:73794‑M1/1‑73 (MQ=255) ttCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑Cagtggtgctgcgccaggggcttcggcaccggctgac < 4:73794‑M1/109‑37 (MQ=255) ttCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGt > 6:302889/1‑123 (MQ=255) ttCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGt < 5:302889/123‑1 (MQ=255) ttCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGgcg > 5:97655/1‑149 (MQ=255) aaaGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGc > 2:85142/1‑111 (MQ=255) aaaGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGc < 1:85142/111‑1 (MQ=255) aaaGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCAc > 5:288689/1‑149 (MQ=255) tatgcttCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCAccc < 1:246947/144‑1 (MQ=255) aGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGcaccac > 5:264326/1‑96 (MQ=255) aGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGcaccac < 6:264326/96‑1 (MQ=255) gATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCt < 7:95110/149‑1 (MQ=255) tCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCa > 1:259052/1‑149 (MQ=255) gCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCt < 4:193773/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTc > 8:208885/1‑149 (MQ=255) cTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCg < 8:63113/148‑1 (MQ=255) cTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCg < 6:288689/148‑1 (MQ=255) gcgcAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGa < 4:94963/146‑1 (MQ=255) cgcAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATAtt < 4:148830/149‑1 (MQ=255) tCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CAGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTg > 2:294139/1‑149 (MQ=255) gcgcgGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCTTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTggg > 4:268769/1‑149 (MQ=255) gcgcgGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTggg > 5:141574/1‑149 (MQ=255) gcgcgGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTggg < 8:195965/149‑1 (MQ=255) ggTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCttt > 7:129685/1‑149 (MQ=255) cATCGGTGCCTGTTCAGTTGGCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTg < 4:222289/148‑1 (MQ=255) cATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGCTCGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTg > 1:196918/1‑149 (MQ=255) cATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTgg > 4:66609/1‑149 (MQ=255) cATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTg < 7:208885/148‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGt < 8:217329/149‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGt > 5:31976/1‑149 (MQ=255) tGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACgat > 3:135699/1‑149 (MQ=255) cAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGatgatg > 1:54495/1‑149 (MQ=255) aGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTg > 1:125851/1‑133 (MQ=255) aGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTg < 2:125851/133‑1 (MQ=255) ttGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTTGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCg < 5:157183/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATAcg < 2:54495/149‑1 (MQ=255) gggTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTggctgacccaggggcaactgaacaggcaccgatgcaaccgcgcgagctgcgccagaagctgaacatctttgaagatggcacgctgaagatggatgaagccaaggaacagt < 6:107371‑M2/148‑111 (MQ=255) gTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTggctgacccaggggcaactgaacaggcaccgatgcaaccgcgcgagctgcgccagaagctgaacatctttgaa > 3:73794‑M2/1‑36 (MQ=255) gTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTggctgacccaggggcaactgaacaggcaccgatgcaaccgcgcgagctgcgccagaagctgaacatctttgaa < 4:73794‑M2/109‑74 (MQ=255) tCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTggctgacccaggggcaactgaacaggcaccgatgcaaccgcgcgagctgcgccagaagctgaacatctttgaagatggcacgctgaagatggatgaagccaaggaacagtaagc < 4:18777‑M2/149‑115 (MQ=255) tCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCCCCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATACGGCGGtt > 1:206316/1‑149 (MQ=255) gcAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATACGGCGGtt < 2:196918/148‑1 (MQ=255) aGC‑Cagtggtgctgcgccaggggcttcggcaccggctgacccaggggcaactgaacaggcaccgatgcaaccgcgcgagctgcgccagaagctgaacatctttgaagatggcacgctgaagatggatgaagccaaggaacagtaagcgg < 8:95110‑M1/149‑146 (MQ=255) aGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATACGGCGGTTg < 6:97655/148‑1 (MQ=255) aGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATACGGCGGTTGa < 6:31976/149‑1 (MQ=255) gC‑Cagtggtgctgcgccaggggcttcggcaccggctgacccaggggcaactgaacaggcaccgatgcaaccgcgcgagctgcgccagaagctgaacatctttgaagatggcacgctgaagatggatgaagccaaggaacactaagcggc > 3:280866‑M1/1‑3 (MQ=255) gC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGGTTTCTTGGTCAGCACGCTGATGTCGATACGGCGGTTGAc > 6:285976/1‑149 (MQ=255) c‑cGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATACGGCGGTTGAcc > 4:249568/1‑149 (MQ=255) | GTGGTGGGTGGCACAGTTGCCCACCCCCAAAAGCCGCTTACTGTTCCTTGGCTTCATCCATCTTCAGCGTGCCATCTTCAAAGATGTTCAGCTTCTGGCGCAGCTCGCGCGGTTGCATCGGTGCCTGTTCAGTTGCCCCTGGGTCAGC‑CGGTGCCGAAGCCCCTGGCGCAGCACCACTGGCTGGCG‑CTGCAGGTGCCGTTGGCGCAGCTGGCGGTGTTTCCGGCGCACCCTGCTCACCTTCGATATTGCGCTGGGCTTTCTTGGTCAGCACGATGATGTCGATACGGCGGTTGACC > NC_002947/5574216‑5574511 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |